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公开(公告)号：CN114494175B
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202210072775.4
申请日：2022-01-21
Applicant: 厦门大学
Abstract: 一种用于质谱成像数据的交互式空间分割方法，涉及质谱成像数据分析技术领域。包括：将原始数据经过谱峰对其、谱峰提取和谱峰合并等预处理得到质谱成像数据；对质谱成像数据进行无监督降维得到嵌入图像；构建无监督分割模型对嵌入图像进行预分割；将用户的先验知识表示为涂鸦信息对分割模型进行正则化约束；在预分割结果不合理的区域进行交互式微调，得到更合理的分割结果。可以充分利用用户不完整的、不精确的先验知识，提高质谱成像数据分割结果的合理性；避免由于无监督分割模型产生的结果不稳定、或与研究问题不相关等问题，提高质谱成像数据后续分析的可靠性和准确性。
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公开(公告)号：CN114724630A
公开(公告)日：2022-07-08
申请号：CN202210406078.8
申请日：2022-04-18
Applicant: 厦门大学
Abstract: 用于预测蛋白质翻译后修饰位点的深度学习方法,涉及生物信息学领域。包括：从公共数据库上收集带有蛋白质翻译后修饰位点注释的蛋白质序列数据；对收集到的蛋白质序列进行去冗余处理，并删除可信度较低的位点注释信息，得到不同PTM类型的蛋白质序列集合；构建基于深度神经网络的预测模型，提取蛋白质序列的短程耦合信息和长程耦合信息；利用蛋白质序列数据集为每种PTM类型训练一个预测模型；将训练好的预测模型部署到网上得到在线预测系统；用户通过在线预测系统输入蛋白质序列文件，选择需要预测的PTM位点类型，在线系统返回PTM位点的预测结果。可以同时预测多种PTM位点，可为生物医学研究和药物设计提供相关的蛋白质信息。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111859275A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN202010701528.7
申请日：2020-07-20
Applicant: 厦门大学
IPC: G06F17/16
Abstract: 本发明涉及一种基于非负矩阵分解的质谱数据缺失值填补方法及系统，包括：对数据集矩阵进行缺失值的预填补，得到无缺失的初始数据矩阵；对无缺失的初始数据矩阵中所有元素进行对数变换；取一组非负矩阵分解的维度参数，分别进行非负矩阵分解，得到对应的一组重构矩阵；对重构矩阵的元素值做指数变换；计算所有指数变换后的重构矩阵与无缺失的初始数据矩阵之间的重构误差；根据重构误差计算得到不同重构矩阵下各自对应的权重；对重构矩阵进行加权平均，得到加权重构矩阵；将加权重构矩阵中对应位置的元素值填补到数据集矩阵中的缺失位置；基于无缺失的最终数据矩阵进行特征代谢物识别及通路分析。本发明的上述方法能够提高数据填补精度。
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公开(公告)号：CN111210876A
公开(公告)日：2020-05-29
申请号：CN202010008409.3
申请日：2020-01-06
Applicant: 厦门大学
IPC: G16B40/10
Abstract: 本发明涉及一种受扰动代谢通路确定方法及系统，包括：获取待测生物样本；采用高通量分析技术和谱数据处理方法对生物样本进行分析和处理，得健康和异常生物样本代谢物的浓度集合；计算健康生物样本代谢物集合中任意两种代谢物的健康生物样本浓度比值对数，得健康生物样本浓度比值对数集；同理得异常生物样本浓度比值对数集；根据上述浓度比值对数集确定偏离系数集；根据偏离系数集确定代谢物的扰动矩阵；获取通路隶属矩阵；根据代谢物的扰动矩阵和通路隶属矩阵确定代谢通路扰动矩阵；采用单边T检验对代谢通路扰动矩阵分析，确定受扰动代谢通路。通过本发明上述方法能准确获取显著受扰动的疾病代谢通路，降低生物样品的个体间差异对于通路识别的影响。
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公开(公告)号：CN109187614A
公开(公告)日：2019-01-11
申请号：CN201811130259.2
申请日：2018-09-27
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明公开了基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法及其应用，该方法包括：分别利用核磁共振谱仪和液相色谱-质谱仪器采集生物样品的代谢轮廓，得到基于核磁共振(NMR)和基于质谱(MS)的两种代谢组学数据；利用Diffreg检验方法，先从MS数据中筛选出对NMR数据具有补充意义的变量，将所筛选的MS变量集与NMR数据集合并；再从新数据集中删除冗余的变量，则所得的数据即为融合数据，便于后续的建模分析。本发明方法得到的模型具有更好的解释与预测性能，且对于其它代谢组学平台的数据融合具有很强的适用性。
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公开(公告)号：CN108872293A
公开(公告)日：2018-11-23
申请号：CN201810909220.4
申请日：2018-08-10
Applicant: 厦门大学
IPC: G01N24/08
CPC classification number: G01N24/088
Abstract: 本发明公开了一种肝泡型包虫病的代谢组学分析及初步筛查模型的构建方法，包括：收集健康人和肝泡型包虫病患者血清和尿液样品；采集每个样品的一维核磁共振氢谱，得到样品的代谢轮廓谱；对代谢轮廓谱进行数据预处理，得到二维数据矩阵；将二维数据矩阵进行正交偏最小二乘判别分析，得到OPLS‑DA模型；对模型进行验证，若模型没有存在过拟合现象，则所得OPLS‑DA模型即为肝泡型包虫病的代谢组学分析及初步筛查模型。本发明首次将代谢组学技术应用于肝泡型包虫病的分析及初步筛查中，可以无创、快速、便捷地筛选出肝泡型包虫病高危人群，有效提高肝泡型包虫病高发区全人群的筛查效率，大大降低筛查成本，便于推广使用。
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公开(公告)号：CN210694458U
公开(公告)日：2020-06-05
申请号：CN201920365851.4
申请日：2019-03-21
Applicant: 厦门大学
IPC: H05K1/02
Abstract: 本实用新型提供了一种板级安规绝缘结构，包括PCB板，所述PCB板上设置有一次侧高压电路功能模块、安全特低电压电路功能模块及接地系统；所述接地系统设置于所述一次侧高压电路功能模块与安全特低电压电路功能模块之间；所述一次侧高压电路功能模块与安全特低电压电路功能模块之间设置为加强绝缘处理，所述一次侧高压电路功能模块与接地系统之间做基本绝缘处理，所述安全特低电压电路功能模块与接地系统之间做功能绝缘处理。应用本技术方案可实现给电路组件提供一个良好的安规绝缘距离效果。(ESM)同样的发明创造已同日申请发明专利
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