公开(公告)号：CN119889701A

公开(公告)日：2025-04-25

申请号：CN202510361147.1

申请日：2025-03-26

Applicant: 厦门大学

Inventor： 刘雅茹 ,  陆可懿 ,  徐向南 ,  董继扬

IPC: G16H50/30 ,  G06F18/25 ,  G06F18/213 ,  G06F18/243 ,  G06F18/2415

Abstract: 本发明公开了基于微生物组分层特征自适应融合的疾病预测方法及系统，涉及微生物组数据分析技术领域，使用训练好的疾病预测模型基于微生物组数据进行疾病预测；疾病预测模型通过分层特征提取模块对五个分类层级的特征数据进行多层次特征提取，并将结果整合为多级融合特征；利用多尺度特征融合模块通过模式流、上下文流和内容流三条并行通路处理多级融合特征，实现微生物组数据的全方位表征；训练过程引入动态采样模块，基于类别平衡机制和不确定性评估策略，动态调整样本采样权重；最后通过分类器对多尺度融合特征进行疾病预测。本发明充分利用微生物分类层级信息，实现多维度特征表征，有效应对样本不平衡问题，提高疾病预测准确率。

公开(公告)号：CN109187614B

公开(公告)日：2020-03-06

申请号：CN201811130259.2

申请日：2018-09-27

Applicant: 厦门大学

Inventor： 秦家辉 ,  徐向南 ,  董继扬 ,  许晶晶

IPC: G01N24/08 ,  G01N30/88

Abstract: 本发明公开了基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法及其应用，该方法包括：分别利用核磁共振谱仪和液相色谱‑质谱仪器采集生物样品的代谢轮廓，得到基于核磁共振(NMR)和基于质谱(MS)的两种代谢组学数据；利用Diffreg检验方法，先从MS数据中筛选出对NMR数据具有补充意义的变量，将所筛选的MS变量集与NMR数据集合并；再从新数据集中删除冗余的变量，则所得的数据即为融合数据，便于后续的建模分析。本发明方法得到的模型具有更好的解释与预测性能，且对于其它代谢组学平台的数据融合具有很强的适用性。

公开(公告)号：CN119400275A

公开(公告)日：2025-02-07

申请号：CN202411538584.8

申请日：2024-10-31

Applicant: 厦门大学

Inventor： 董继扬 ,  沈雄辉 ,  郭磊 ,  徐向南

IPC: G16C20/20 ,  G06V10/762 ,  G06V10/26 ,  G06V10/84

Abstract: 本发明公开了一种用于识别质谱成像数据中空间群聚离子的方法和系统，涉及质谱成像数据处理技术领域，方法包括：S1，预处理MSI数据获得原始离子图像集，对其进行维度约简获得嵌入离子图像集；S2，随机化原始离子图像集获得随机化离子图像集；S3，图像块划分所有图像集得到原始离子图像块集、嵌入离子图像块集和随机化离子图像块集；S4，构建采样概率，基于采样概率进行下采样，获得原始离子图像下采样集与随机化离子图像下采样集；S5，分别构建两个下采样集中的相关系数并计算空间群聚分数；S6，基于所有离子图像的空间群聚分数进行筛选。本发明利用MSI图像的信号强度差与空间距离的相关性作为空间群聚度的度量，充分提取了信号强度的空间分布特征。

公开(公告)号：CN114494175A

公开(公告)日：2022-05-13

申请号：CN202210072775.4

申请日：2022-01-21

Applicant: 厦门大学

Inventor： 董继扬 ,  郭磊 ,  胡振兴 ,  徐向南 ,  许晶晶

IPC: G06T7/00 ,  G06T7/11 ,  G06V10/77 ,  G06V10/82 ,  G06K9/62 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08 ,  G01N27/64

Abstract: 一种用于质谱成像数据的交互式空间分割方法，涉及质谱成像数据分析技术领域。包括：将原始数据经过谱峰对其、谱峰提取和谱峰合并等预处理得到质谱成像数据；对质谱成像数据进行无监督降维得到嵌入图像；构建无监督分割模型对嵌入图像进行预分割；将用户的先验知识表示为涂鸦信息对分割模型进行正则化约束；在预分割结果不合理的区域进行交互式微调，得到更合理的分割结果。可以充分利用用户不完整的、不精确的先验知识，提高质谱成像数据分割结果的合理性；避免由于无监督分割模型产生的结果不稳定、或与研究问题不相关等问题，提高质谱成像数据后续分析的可靠性和准确性。

公开(公告)号：CN114494175B

公开(公告)日：2024-05-03

申请号：CN202210072775.4

申请日：2022-01-21

Applicant: 厦门大学

Inventor： 董继扬 ,  郭磊 ,  胡振兴 ,  徐向南 ,  许晶晶

IPC: G06T7/00 ,  G06T7/11 ,  G06V10/77 ,  G06V10/82 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/084 ,  G01N27/64 ,  G06N3/048

Abstract: 一种用于质谱成像数据的交互式空间分割方法，涉及质谱成像数据分析技术领域。包括：将原始数据经过谱峰对其、谱峰提取和谱峰合并等预处理得到质谱成像数据；对质谱成像数据进行无监督降维得到嵌入图像；构建无监督分割模型对嵌入图像进行预分割；将用户的先验知识表示为涂鸦信息对分割模型进行正则化约束；在预分割结果不合理的区域进行交互式微调，得到更合理的分割结果。可以充分利用用户不完整的、不精确的先验知识，提高质谱成像数据分割结果的合理性；避免由于无监督分割模型产生的结果不稳定、或与研究问题不相关等问题，提高质谱成像数据后续分析的可靠性和准确性。

公开(公告)号：CN109187614A

公开(公告)日：2019-01-11

申请号：CN201811130259.2

申请日：2018-09-27

Applicant: 厦门大学

Inventor： 秦家辉 ,  徐向南 ,  董继扬 ,  许晶晶

IPC: G01N24/08 ,  G01N30/88

Abstract: 本发明公开了基于核磁共振和质谱的代谢组学数据融合方法及其应用，该方法包括：分别利用核磁共振谱仪和液相色谱-质谱仪器采集生物样品的代谢轮廓，得到基于核磁共振(NMR)和基于质谱(MS)的两种代谢组学数据；利用Diffreg检验方法，先从MS数据中筛选出对NMR数据具有补充意义的变量，将所筛选的MS变量集与NMR数据集合并；再从新数据集中删除冗余的变量，则所得的数据即为融合数据，便于后续的建模分析。本发明方法得到的模型具有更好的解释与预测性能，且对于其它代谢组学平台的数据融合具有很强的适用性。