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公开(公告)号：CN104498591B
公开(公告)日：2016-06-29
申请号：CN201410676539.9
申请日：2014-11-24
Applicant: 南通大学附属医院
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种基于液相芯片定量检测Alu基因甲基化水平的方法，包括（1）针对亚硫酸氢钠转化后的Alu序列设计相应引物；（2）标本血清DNA提取和亚硫酸氢钠处理；（3）对处理后的标本进行BSP测序；（4）根据测序结果，分析筛选出检测位点，并针对该位点设计相应探针；（5）制备标准品和样品PCR产物；（6）将探针包被到微球上（7）将包被了探针的微球与PCR产物杂交孵育，并在液相芯片机器上进行检测，读取数据；（8）根据标准品绘制标准曲线后，计算出每个样品的甲基化水平。本发明方法相较于现有的检测方法，是一种高通量、操作简便、准确可靠的定量检测Alu基因甲基化水平的方法。
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公开(公告)号：CN104498591A
公开(公告)日：2015-04-08
申请号：CN201410676539.9
申请日：2014-11-24
Applicant: 南通大学附属医院
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6827 , C12Q2523/125 , C12Q2563/149
Abstract: 本发明公开了一种基于液相芯片定量检测Alu基因甲基化水平的方法，包括（1）针对亚硫酸氢钠转化后的Alu序列设计相应引物；（2）标本血清DNA提取和亚硫酸氢钠处理；（3）对处理后的标本进行BSP测序；（4）根据测序结果，分析筛选出检测位点，并针对该位点设计相应探针；（5）制备标准品和样品PCR产物；（6）将探针包被到微球上（7）将包被了探针的微球与PCR产物杂交孵育，并在液相芯片机器上进行检测，读取数据；（8）根据标准品绘制标准曲线后，计算出每个样品的甲基化水平。本发明方法相较于现有的检测方法，是一种高通量、操作简便、准确可靠的定量检测Alu基因甲基化水平的方法。
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公开(公告)号：CN118345172B
公开(公告)日：2025-05-02
申请号：CN202410608457.4
申请日：2024-05-16
Applicant: 南通大学附属医院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/113 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种用于非小细胞肺癌筛查的circRNA标志物，涉及生物医学技术领域，所述标志物为hsa_circ_0016601，所述hsa_circ_0016601的序列号如SEQ ID NO:01所示。首先通过高通量测序构建非小细胞肺癌组织和癌旁正常组织的circRNA差异表达谱，RT‑qPCR检测hsa_circ_0016601在非小细胞肺癌中的表达情况，从而首次发现hsa_circ_0016601可作为非小细胞肺癌诊断的生物标志物，并且，与正常人相比，该circRNA生物标志物在临床大样本非小细胞肺癌患者血清中的表达升高。非小细胞肺癌患者血清中高表达的上述circRNA生物标志物与组织学类型，分化程度，肿瘤大小，TNM分期，远端转移，细胞增殖相关抗原Ki‑67表达及胸膜浸润有关。本发明提供的生物标志物，其区分血清中非小细胞肺癌患者和健康正常人的AUC可达0.810，灵敏度和特异度分别为72％和77％，截断值为2.4180。
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公开(公告)号：CN115006424A
公开(公告)日：2022-09-06
申请号：CN202210456735.X
申请日：2022-04-28
Applicant: 南通大学附属医院
IPC: A61K31/713 , A61K45/00 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了一种CTC‑497E21.4作为铁死亡调控靶点在制备胃癌靶向药物中的应用，属于生物医药技术领域。本发明公开CTC‑497E21.4作为铁死亡调控靶点在制备胃癌靶向药物中的应用，通过干扰CTC‑497E21.4表达调控SLC7A11表达降低，以促进胃癌细胞铁死亡。本发明根据实验结果推断CTC‑497E21.4与胃癌细胞中的铁死亡相关，其对胃癌细胞铁死亡具有抑制作用，并进一步研究发现，SLC7A11可以作为CTC‑497E21.4影响胃癌细胞铁死亡的靶分子，阐明了CTC‑497E21.4调控胃癌细胞铁死亡的作用机制，为胃癌靶向治疗提供了新的作用靶点及技术支持。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112708635A
公开(公告)日：2021-04-27
申请号：CN202011620055.4
申请日：2020-12-30
Applicant: 南通大学附属医院
IPC: C12N15/85 , C12N15/65 , C12N15/12 , C12Q1/6804 , C12Q1/6834
Abstract: 本发明提供一种转录因子CEBPB和TFCP2竞争结合CPEB1基因启动子区调节CPEB1基因表达的方法，包括如下步骤：S1、通过实验验证转录因子CEBPB可结合CPEB1基因启动子区，而当CPEB1基因启动子区高甲基化状态，转录因子CEBPB无法结合，影响CPEB1基因的染色质可及性，从而抑制CPEB1基因的表达；S2、通过实验验证CPEB1基因启动子区高甲基化状态时，转录因子TFCP2可结合CPEB1基因启动子区，从而阻止转录因子CEBPB的结合。本发明的实验结果表明CPEB1基因启动子区的高DNA甲基化状态可增加转录因子TFCP2的结合活性，使其启动子区不能结合CEBPB，同时证明转录因子TFCP2是一新的DNA甲基化识别因子。
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公开(公告)号：CN112481273A
公开(公告)日：2021-03-12
申请号：CN202011585665.5
申请日：2020-12-29
Applicant: 南通大学附属医院
IPC: C12N15/12 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明提供一种结直肠癌抑癌基因，为CPEB1基因。本发明还提供一种结直肠癌抑癌基因的启动子区高DNA甲基化的验证方法，通过DNA甲基化靶向测序技术检测甲基化程度、荧光定量PCR技术检测基因mRNA表达、Western印迹技术检测蛋白水平、流式细胞术检测细胞凋亡情况、CCK‑8实验和细胞克隆形成实验评估细胞增殖克隆能力、损伤修复实验评估细胞迁移能力、Transwell小室实验评估细胞侵袭能力、裸鼠成瘤实验模拟CPEB1基因在体内的致瘤能力等实验，证明CPEB1基因是一新的结直肠癌抑癌基因，且其启动子区存在高DNA甲基化位点，基因表达呈低表达模式。
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公开(公告)号：CN112342271A
公开(公告)日：2021-02-09
申请号：CN202011122900.5
申请日：2020-10-20
Applicant: 南通大学附属医院
IPC: C12Q1/6816 , G01N30/88 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域，尤其涉及一种同位素稀释质谱法定量检测游离DNA含量的方法。首先公开了一种肽核酸探针，所述肽核酸探针中的核酸部分序列如SEQ ID NO：1所示，所述肽核酸探针中的肽部分序列如SEQ ID NO：2所示。还公开了一种同位素稀释质谱法定量检测游离DNA单链含量的方法包括：形成游离DNA‑生物素‑链霉亲和素磁珠复合物；加入肽核酸探针捕获所述游离DNA‑生物素‑链霉亲和素磁珠复合物；酶解；复溶；根据峰面积比间接计算样本中DNA含量；修正DNA浓度得到最终浓度值等步骤。本发明同位素稀释质谱法定量检测游离DNA单链含量的方法具有准确度高，结果可靠等优点。
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公开(公告)号：CN106770821B
公开(公告)日：2020-04-17
申请号：CN201611144062.5
申请日：2016-12-13
Applicant: 南通大学附属医院
Abstract: 肽段同位素稀释质谱法定量重组肌钙蛋白I含量的方法，它涉及一种准确定量重组肌钙蛋白I含量的方法；包括以下步骤：特征肽段设计；特征肽段质谱分析离子对的确定；LC‑MRM条件研究；样本分析前处理：主要步骤有：重组蛋白变性、还原烷基化、酶解、纯化样品、浓缩样品；数据分析：cTnI特异性肽段浓度，cTnI蛋白肽出峰时间4.20min；回收率及精密度：回收率及精密度符合规定要求，对重组cTnI特异性肽段液相质谱条件进行研究和改进，所建方法准确度好，速度快，出峰时间为4.20min。
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公开(公告)号：CN106770821A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611144062.5
申请日：2016-12-13
Applicant: 南通大学附属医院
Abstract: 肽段同位素稀释质谱法定量重组肌钙蛋白I含量的方法，它涉及一种准确定量重组肌钙蛋白I含量的方法；包括以下步骤：特征肽段设计；特征肽段质谱分析离子对的确定；LC‑MRM条件研究；样本分析前处理：主要步骤有：重组蛋白变性、还原烷基化、酶解、纯化样品、浓缩样品；数据分析：cTnI特异性肽段浓度，cTnI蛋白肽出峰时间4.20min；回收率及精密度：回收率及精密度符合规定要求，对重组cTnI特异性肽段液相质谱条件进行研究和改进，所建方法准确度好，速度快，出峰时间为4.20min。
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