变形杆菌多种血清型菌株特异性引物及多重PCR检测方法

    公开(公告)号:CN103173555A

    公开(公告)日:2013-06-26

    申请号:CN201310115652.5

    申请日:2013-04-02

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及一种用于检测变形杆菌多种血清型致病菌的特异性PCR引物及采用多重PCR快速检测的方法及应用,其中的多重PCR检测体系包括10×PCR反应液、MgCl2、dNTP、引物、DNA聚合酶,所用引物的序列包含以下序列中选取的多种:(1)变形杆菌血清型1-4型等一直到60型的wzy特异的核苷酸序列;(2)上述(1)中选取的DNA序列的互补DNA序列。本发明的对常见变形杆菌血清型的wzy特异的核苷酸及包含该核苷酸的多重PCR检测方法,多重PCR体系配制方法简便,检测周期短、速度快、准确性高,可操作性强,降低检测成本。

    对大肠杆菌O151型的O-抗原特异的核苷酸

    公开(公告)号:CN1262558C

    公开(公告)日:2006-07-05

    申请号:CN200310107163.1

    申请日:2003-12-03

    Applicant: 南开大学

    CPC classification number: Y02A50/474

    Abstract: 本发明提供一种对大肠杆菌O151型(Escherichia coli O151)的O-抗原特异的核苷酸,它是大肠杆菌O151型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,全长15670个碱基;或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ IDNO:1的核苷酸;还包括源于大肠杆菌O151型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因的寡核苷酸;本发明通过PCR证实寡核苷酸对大肠杆菌O151型的O-抗原都有高度的特异性;本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的大肠杆菌O151型的方法。

    对大肠杆菌O54型的O-抗原特异的核苷酸

    公开(公告)号:CN1261444C

    公开(公告)日:2006-06-28

    申请号:CN200310107159.5

    申请日:2003-12-03

    Applicant: 南开大学

    CPC classification number: Y02A50/474

    Abstract: 本发明提供一种对大肠杆菌O54型(Escherichia coli O54)的O-抗原特异的核苷酸,它是大肠杆菌O54型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,全长14062个碱基;或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQID NO:1的核苷酸;还包括源于大肠杆菌O54型的O-抗原基因簇中的wzx基因或与wzx有相似功能的基因和wzy基因或与wzy有相似功能的基因的寡核苷酸;本发明通过PCR证实寡核苷酸对大肠杆菌O54型的O-抗原都有高度的特异性;本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的大肠杆菌O54型的方法。

    对鲍氏志贺氏菌13型的O-抗原特异的核苷酸及其应用

    公开(公告)号:CN1252266C

    公开(公告)日:2006-04-19

    申请号:CN03100537.3

    申请日:2003-01-20

    Applicant: 南开大学

    Inventor: 王磊 杨静华 冯露

    Abstract: 本发明提供一种对鲍氏志贺氏菌13型(Shigella dysenteriae 13)的O-抗原特异的核苷酸,它是鲍氏志贺氏菌13型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列。还包括O-抗原基因簇的结构以及源于鲍氏志贺氏菌13型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因(包括wzx基因或与wzx有相似功能的基因、wzy基因或与wzy有相似功能的基因)的寡核苷酸,并且包括获得细菌O-抗原基因簇的方法。本发明通过PCR证实寡核苷酸对鲍氏志贺氏菌13型的O-抗原有高度的特异性。本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的鲍氏志贺氏菌13型的方法。

    对大肠杆菌O142型的O-抗原特异的核苷酸

    公开(公告)号:CN1554761A

    公开(公告)日:2004-12-15

    申请号:CN200310117865.8

    申请日:2003-12-22

    Applicant: 南开大学

    Inventor: 王磊 孔庆科 冯露

    Abstract: 本发明提供一种对大肠杆菌O142型(Escherichiacoli O142)的O-抗原特异的核苷酸,它是大肠杆菌O142型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,全长13584个碱基;或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ ID NO:1的核苷酸;还包括源于大肠杆菌O142型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因的寡核苷酸;本发明通过PCR证实寡核苷酸对大肠杆菌O142型的O-抗原都有高度的特异性;本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的大肠杆菌O142型的方法。

    对鲍氏志贺氏菌10型的O-抗原特异的核苷酸

    公开(公告)号:CN1546510A

    公开(公告)日:2004-11-17

    申请号:CN200310107160.8

    申请日:2003-12-03

    Applicant: 南开大学

    CPC classification number: Y02A50/476

    Abstract: 本发明提供一种对鲍氏志贺氏菌10型(Shigellabodyii 10)的O-抗原特异的核苷酸,它是鲍氏志贺氏菌10型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,全长13402个碱基;或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ ID NO:1的核苷酸;还包括源于鲍氏志贺氏菌10型的O-抗原基因簇中的wzx基因或与wzx有相似功能的基因和wzy基因或与wzy有相似功能的基因及未知功能的orf8基因的寡核苷酸,本发明通过PCR证实寡核苷酸对鲍氏志贺氏菌10型的O-抗原都有高度的特异性,本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的鲍氏志贺氏菌10型的方法。

    对鲍氏志贺氏菌2型的O-抗原特异的核苷酸

    公开(公告)号:CN1546508A

    公开(公告)日:2004-11-17

    申请号:CN200310107158.0

    申请日:2003-12-03

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明提供一种对鲍氏志贺氏菌2型(Shigellabodyii 2)的O-抗原特异的核苷酸,它是鲍氏志贺氏菌2型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,全长13234个碱基;或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ ID NO:1的核苷酸;还包括源于鲍氏志贺氏菌2型的O-抗原基因簇中的wzx基因或与wzx有相似功能的基因和wzy基因或与wzy有相似功能的基因的寡核苷酸。本发明通过PCR证实寡核苷酸对鲍氏志贺氏菌2型的O-抗原都有高度的特异性。本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的鲍氏志贺氏菌2型的方法。

    对大肠杆菌O96型的O-抗原特异的核苷酸

    公开(公告)号:CN1539847A

    公开(公告)日:2004-10-27

    申请号:CN200310106708.7

    申请日:2003-10-24

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明提供一种对大肠杆菌O96型(Escherichiacoli O96)的O-抗原特异的核苷酸,它是大肠杆菌O96型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列,如SEQ ID NO:1所示的分离的核苷酸,全长9415个碱基;或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基,同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQID NO:1的核苷酸;还包括源于大肠杆菌O96型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因的寡核苷酸;本发明提供分离大肠杆菌O96型的O-抗原基因簇的全序列的方法。本发明通过PCR证实寡核苷酸对大肠杆菌O96型的O-抗原都有高度的特异性;本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的大肠杆菌O96型的方法。

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