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公开(公告)号：CN103233075A
公开(公告)日：2013-08-07
申请号：CN201310170677.5
申请日：2013-05-09
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于生物技术领域，涉及一种基于转录组测序开发菊属植物SSR引物的方法。利用EST‐SSR的种间转移性，在转录组测序的基础上，结合Perl编程语言方法，对大量序列信息进行批量处理，进行SSR序列查找和SSR标记引物设计，克服了SSR开发效率低、耗时久、成本高等障碍。选择菊属不同种的材料对设计的SSR引物进行验证，若有条带检测出，即为成功的SSR引物。应用本方法成功地设计了1788对SSR引物，为菊属SSR引物开发进而实现分子标记辅助选择育种和比较基因组学研究提供了新的方法和思路。
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公开(公告)号：CN119959468A
公开(公告)日：2025-05-09
申请号：CN202510008625.0
申请日：2025-01-03
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种基于叶型诊断菊花氮素营养亏缺的方法，包括设置梯度试验，涵盖菊花氮素营养的多种状况；测量不同氮素营养状况下菊花植株的叶型指标，其中，叶型指标包括叶片长宽比、顶裂片长宽比以及叶片裂深参数；计算不同营养状况下菊花的氮素营养诊断特征值NDI：氮素营养诊断特征值＝叶片长宽比×顶裂片长宽比×叶片裂深参数；确定氮素充足条件下菊花的氮素营养诊断特征值SNDI；测量待诊断菊花的氮素营养诊断特征值，通过与氮素充足条件下菊花的氮素营养诊断特征值比较，来判断待诊断菊花的氮素营养亏缺状况。本发明的方法适宜于菊花从营养生长期到花蕾膨大期之间的氮素营养亏缺与否的诊断，成本低廉、易实施、结果可靠、准确度高。
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公开(公告)号：CN116769956A
公开(公告)日：2023-09-19
申请号：CN202310732375.6
申请日：2023-06-20
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种高效预测切花菊株高性状SNP位点，还公开了高效预测切花菊株高性状SNP位点方法及其应用。本发明使用数量多、分布广泛、能够稳定遗传且易于高通量基因分型的SNP标记进行切花菊株高相关性状全基因组关联分析，结果表明，与株高性状相关的最佳标记对株高、节间数、节间长度和茎粗的预测准确度分别为0.97、0.98、0.97和0.96，可以应用于切花菊株高、节间长度、节间数和茎粗的早期预测，缩短育种周期，为菊花株高相关性状功能标记的开发和遗传改良提供了位点信息，对于选育不同株型菊花优良材料具有重要理论和实践意义。
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公开(公告)号：CN116732222A
公开(公告)日：2023-09-12
申请号：CN202310603907.6
申请日：2023-05-26
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , G16B20/00
Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组高效预测菊花耐盐性的方法。本发明通过全基因组关联分析鉴定菊花耐盐性显著相关的13个SNP标记，在此基础上，比较了不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测效果的影响，并基于GWAS分析中与菊花耐盐性显著关联的SNP位点，构建了菊花耐盐性全基因组选择预测模型，选择效率可提高2.96～13.09倍。本发明不仅能够实现菊花育种工作中耐盐性品种的早期选择，缩短育种周期，还有效克服了耐盐性田间鉴定工作量大、周期长、易受环境因素和人为主观因素的影响等技术难题，为耐盐性分子标记辅助选择和基因组选择育种提供重要理论依据，在菊花耐盐性育种领域具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN107815502B
公开(公告)日：2021-06-08
申请号：CN201711176758.0
申请日：2017-11-23
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鉴定菊花耐涝性的dCAPS标记开发方法及应用，属于生物技术领域，该方法包括以下几个步骤：a、通过GWAS方法挖掘与菊花耐涝性显著关联的SNP位点；b、SNP突变位点特异性酶切位点分析及dCAPS引物设计；c、结合基因型与表型数据预期酶切扩增多态性；d、dCAPS标记在自然耐涝极端群体的验证；e、在F1后代耐涝极端群体中对WT‑dCAPS1标记进行进一步验证。本发明开发了一个与菊花耐涝性状共分离的dCAPS共显性标记，命名为WT‑dCAPS1，在两个群体的平均鉴定准确率为78.9％，初步认为可以应用于菊花耐涝性分子标记辅助育种，大大缩短育种周期，对于培育耐涝性菊花新品种具有重要的理论和实践意义。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105112403B
公开(公告)日：2019-06-21
申请号：CN201510587614.9
申请日：2015-09-15
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12N15/10 , C12N15/82 , C12Q1/6895 , A01H5/00 , A01H6/14
Abstract: 本发明公开了菊花耐盐性关联分子标记及其获得方法和应用。该获得方法包括a.连续两年的耐盐性鉴定；b.菊花品种群体结构分析；c.菊花品种亲缘关系分析；d.与菊花耐盐性紧密关联的分子标记的确定。本方法同时运用SRAP、SCoT和EST‑SSR三种分子标记技术对159个切花菊品种进行全基因组分子标记扫描，得到的染色条带数量丰富、多态性好、重复性高，有利于获得与耐盐性紧密关联的分子标记。本发明检测到3个标记位点与品种的耐盐性显著关联，为菊花耐盐性分子标记辅助选择提供一定参考。
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公开(公告)号：CN109792953A
公开(公告)日：2019-05-24
申请号：CN201910085888.6
申请日：2019-01-29
Applicant: 南京农业大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明公开了一种保护菊花知识产权品种的组培方法。本发明发包括配制多种抑菌剂组合的抑菌培养基，并向其中接种自然界广泛存在且易提取的灰绿青霉，使灰绿青霉在抑菌剂的作用下处于潜伏状态，并不引起真菌污染，在这种培养基中培养的菊花组培苗生长发育状况和炼苗后的表现均正常，对菊花种苗的产量和质量均无影响；将抑菌培养基中的菊花组培苗接种到普通培养基中，没有抑菌剂的抑制作用，组培苗大范围爆发真菌污染且污染率达100％。通过此方法在保证菊花组培苗生产效率与质量的同时，能够有效保护菊花的知识产权品种，只有拥有品种授予权的单位可以获得健康的组培苗，防止优良品种非法外流。
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公开(公告)号：CN108411026A
公开(公告)日：2018-08-17
申请号：CN201810483506.0
申请日：2018-05-18
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开一种菊花托桂花型分子标记辅助选择方法，所述的分子标记为SRAP分子标记或/和SCAR标记，本发明以托桂型切花小菊品种‘南农雪峰’为母本和非托桂型品种‘QX096’为父本杂交获得的80株F1分离群体为试材。用SRAP分子标记来筛选与控制托桂花型基因相连锁的特异位点。其中SRAP分子标记引物组合M11E1在托桂型菊花材料中扩增得到一条272bp的特异片段，通过设计特异SCAR分子标记引物在托桂材料中扩增出单一的168bp的条带，进一步在‘南农雪峰’בQX096’和‘南农雪峰’ב蒙白’两个群体中验证，准确率分别高达92.5％和84.3％。说明上述标记已成功转化成SCAR分子标记。该发明提高了托桂花型的选择效率，加快托桂花型菊花新品种的选育进程。
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公开(公告)号：CN103233075B
公开(公告)日：2016-02-10
申请号：CN201310170677.5
申请日：2013-05-09
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于生物技术领域，涉及一种基于转录组测序开发菊属植物SSR引物的方法。利用EST‐SSR的种间转移性，在转录组测序的基础上，结合Perl编程语言方法，对大量序列信息进行批量处理，进行SSR序列查找和SSR标记引物设计，克服了SSR开发效率低、耗时久、成本高等障碍。选择菊属不同种的材料对设计的SSR引物进行验证，若有条带检测出，即为成功的SSR引物。应用本方法成功地设计了1788对SSR引物，为菊属SSR引物开发进而实现分子标记辅助选择育种和比较基因组学研究提供了新的方法和思路。
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公开(公告)号：CN104673938A
公开(公告)日：2015-06-03
申请号：CN201510100532.7
申请日：2015-03-06
Applicant: 南京农业大学
CPC classification number: C12Q1/70 , C12Q1/686 , C12Q2549/119
Abstract: 本发明属于分子生物学病毒检测领域，提供一种高灵敏度检测菊花B病毒的引物、利用该特异引物检测菊花B病毒的方法及引物的应用。其中，本方法步骤如下：1)设计针对菊花B病毒的两轮特异性引物；2)以CVB1-R为引物，对待检测菊花DNA进行反转录得到cDNA，并以步骤1)所述两轮特异性引物进行巢式PCR扩增；3)将步骤2)进行的第二轮PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，当获得381bp特异性片段时，表示待检测菊花感染菊花B病毒。本发明由于加入了特异的反转录引物进行巢式PCR，极大地提高了菊花B病毒检测灵敏度，经过验证灵敏度达到10-9ug/ul。本发明提供的方法，菊花CVB检测特异性强，工序简单，成本低廉。
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