公开(公告)号：CN116769956A

公开(公告)日：2023-09-19

申请号：CN202310732375.6

申请日：2023-06-20

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张飞 ,  张雪峰 ,  苏江硕 ,  管志勇 ,  房伟民 ,  陈发棣

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  G16B20/20 ,  G16B20/50 ,  G16B30/00 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种高效预测切花菊株高性状SNP位点，还公开了高效预测切花菊株高性状SNP位点方法及其应用。本发明使用数量多、分布广泛、能够稳定遗传且易于高通量基因分型的SNP标记进行切花菊株高相关性状全基因组关联分析，结果表明，与株高性状相关的最佳标记对株高、节间数、节间长度和茎粗的预测准确度分别为0.97、0.98、0.97和0.96，可以应用于切花菊株高、节间长度、节间数和茎粗的早期预测，缩短育种周期，为菊花株高相关性状功能标记的开发和遗传改良提供了位点信息，对于选育不同株型菊花优良材料具有重要理论和实践意义。

公开(公告)号：CN116732222A

公开(公告)日：2023-09-12

申请号：CN202310603907.6

申请日：2023-05-26

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张飞 ,  周迎雪 ,  苏江硕 ,  张雪峰 ,  管志勇 ,  房伟民 ,  陈发棣

IPC: C12Q1/6895 ,  G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组高效预测菊花耐盐性的方法。本发明通过全基因组关联分析鉴定菊花耐盐性显著相关的13个SNP标记，在此基础上，比较了不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测效果的影响，并基于GWAS分析中与菊花耐盐性显著关联的SNP位点，构建了菊花耐盐性全基因组选择预测模型，选择效率可提高2.96～13.09倍。本发明不仅能够实现菊花育种工作中耐盐性品种的早期选择，缩短育种周期，还有效克服了耐盐性田间鉴定工作量大、周期长、易受环境因素和人为主观因素的影响等技术难题，为耐盐性分子标记辅助选择和基因组选择育种提供重要理论依据，在菊花耐盐性育种领域具有广阔的应用前景。

公开(公告)号：CN117210597A

公开(公告)日：2023-12-12

申请号：CN202310994164.X

申请日：2023-08-08

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 房伟民 ,  贾斐斐 ,  张雪峰 ,  张飞 ,  苏江硕 ,  孙炜 ,  万文阳 ,  陈发棣

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/11 ,  G16B30/10 ,  G16B45/00

Abstract: 本发明公开了一种基于SNP标记的菊花DNA指纹图谱及其构建方法和应用，所述DNA指纹图谱包括179个特异性SNP位点。针对不同色系菊花DNA指纹图谱可用于同一色系或者不同花色菊花品种准确性和特异性鉴定。构建DNA指纹图谱的方法以同一色系或不同色系菊花DNA的特异性为依据，为菊花品种指纹图谱构建提供了通用策略，并结合群体结构分析构建了同一色系或不同色系菊花品种的DNA指纹图谱，在鉴别同一色系以及不同花色的菊花品种中具有应用成本低、鉴定时间短、准确率高和效果更佳的优点。

公开(公告)号：CN116769956B

公开(公告)日：2025-04-22

申请号：CN202310732375.6

申请日：2023-06-20

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张飞 ,  张雪峰 ,  苏江硕 ,  管志勇 ,  房伟民 ,  陈发棣

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  G16B20/20 ,  G16B20/50 ,  G16B30/00 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种高效预测切花菊株高性状SNP位点，还公开了高效预测切花菊株高性状SNP位点方法及其应用。本发明使用数量多、分布广泛、能够稳定遗传且易于高通量基因分型的SNP标记进行切花菊株高相关性状全基因组关联分析，结果表明，与株高性状相关的最佳标记对株高、节间数、节间长度和茎粗的预测准确度分别为0.97、0.98、0.97和0.96，可以应用于切花菊株高、节间长度、节间数和茎粗的早期预测，缩短育种周期，为菊花株高相关性状功能标记的开发和遗传改良提供了位点信息，对于选育不同株型菊花优良材料具有重要理论和实践意义。

公开(公告)号：CN116732222B

公开(公告)日：2024-03-15

申请号：CN202310603907.6

申请日：2023-05-26

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张飞 ,  周迎雪 ,  苏江硕 ,  张雪峰 ,  管志勇 ,  房伟民 ,  陈发棣

IPC: C12Q1/6895 ,  G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组高效预测菊花耐盐性的方法。本发明通过全基因组关联分析鉴定菊花耐盐性显著相关的13个SNP标记，在此基础上，比较了不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测效果的影响，并基于GWAS分析中与菊花耐盐性显著关联的SNP位点，构建了菊花耐盐性全基因组选择预测模型，选择效率可提高2.96～13.09倍。本发明不仅能够实现菊花育种工作中耐盐性品种的早期选择，缩短育种周期，还有效克服了耐盐性田间鉴定工作量大、周期长、易受环境因素和人为主观因素的影响等技术难题，为耐盐性分子标记辅助选择和基因组选择育种提供重要理论依据，在菊花耐盐性育种领域具有广阔的应用前景。