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公开(公告)号：CN113913333B
公开(公告)日：2022-09-02
申请号：CN202111222066.1
申请日：2021-10-20
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q1/04 , G16B5/00 , G16B30/10 , G16B40/00 , G16B50/00 , G16H50/30 , G16H50/50 , G06K9/62 , G06N20/00 , C12R1/07 , C12R1/01
Abstract: 本发明涉及一种肺癌早期筛查和诊断标志物及用途，属于分子生物医学技术领域。本研究首次通过血浆cfDNA来研究肺癌和健康人的菌群差异，并筛选出具有明显差异的菌群，然后通过随机森林的方法，建立肺癌风险预测模型，适用于肺癌的筛查与诊断，用于筛查肺癌人群。
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公开(公告)号：CN114807377A
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN202210762897.6
申请日：2022-06-29
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B30/00
Abstract: 本发明涉及膀胱癌预后生存期标志物的应用、评估装置以及计算机可读取介质，属于肿瘤医学技术领域。本发明通过对大量膀胱癌患者肿瘤样本的基因组测序数据进行单因素和多因素分析，评估各因素与总生存期的相关性，并建立了包括淋巴结状态、TOP1扩增、MYC扩增、CREBBP突变及CDKN2A缺失状态在内的5特征预后模型，该模型可以有效进行膀胱癌患者预后分层，为临床诊疗提供参考依据。
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公开(公告)号：CN113373524A
公开(公告)日：2021-09-10
申请号：CN202110458794.6
申请日：2021-04-27
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C40B70/00 , C40B80/00 , C40B40/06 , C12Q1/6869 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开一种利用NGS技术检测血浆ctDNA超低频突变的测序方法及分子标签接头。标签接头包括含有11个碱基的样本标签和含有4个碱基的单分子及双链DNA共用标签序列。样本标签实现了超过300种i7/i5“双端唯一”index组合，分子标签可同时用作单分子和双链分子index。采用本发明提供的标签接头，可以有效去除文库富集过程中DNA氧化应激损伤、PCR扩增以及测序引入的随机错误突变；同时能够有效识别发生“标签跳跃”的分子，避免因标签跳跃造成样本间交叉污染引入的假性突变。本发明在保证100%特异性的前提下实现了检测灵敏度的大力提升，ctDNA中丰度0.1%突变的检测敏感性达到95%以上。
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公开(公告)号：CN119943142A
公开(公告)日：2025-05-06
申请号：CN202510102066.X
申请日：2025-01-22
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: G16B20/50 , G16B30/10 , G16B50/00 , C12Q1/6869 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及一种基于ctDNA的实体瘤MRD检测方法、检测系统和计算机可读取介质，属于肿瘤基因检测技术领域。本发明提出了在动态血浆检测时，基于组织基线突变位点进行血浆样本MRD定性的方法。本方法通过计算单碱基突变的背景错误率，基于该错误率模拟突变读数，与实际观察到的突变读数进行比较，统计模拟的突变读数大于实际观察突变读数的次数。通过在突变位点上的多次模拟结果计算样本ctDNA阳性的p值。
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公开(公告)号：CN113862335B
公开(公告)日：2023-04-28
申请号：CN202111236808.6
申请日：2021-10-23
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种检测BRCA1/2基因和部分同源重组修复(HRR)通路基因(PALB2、RAD51C、RAD51D)回复突变的探针及检测方法，所述DNA探针库包括一个或多个能够与BRCA1、BRCA2、PALB2、RAD51C、RAD51D基因部分外显子及相邻内含子进行杂交的DNA探针。所述DNA探针可以如SEQIDNO.1～192所示。此外，本发明提供利用该探针库BRCA1、BRCA2、PALB2、RAD51C、RAD51D基因外显子及相邻内含子进行富集及检测的方法，采用此方法与下一代测序技术(NGS)相结合可以极大地提高BRCA1、BRCA2、PALB2、RAD51C、RAD51D基因检测的敏感性，准确性与全面性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115181800A
公开(公告)日：2022-10-14
申请号：CN202210809270.1
申请日：2022-07-11
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , G16B15/30
Abstract: 本发明涉及基因标志物在非小细胞肺癌预后效果预测中的的应用、预测装置以及计算机可读取介质，属于医学分子生物学技术领域。通过对阿法替尼治疗患者进行NGS检测及获益时间随访分析，找到了可以用于EGFR阳性非小细胞肺癌患者阿法替尼治疗疗效预测的分子标志物：Mutation signature APOBEC，能够有效地区分出阿法替尼原发耐药患者，及时调整临床方案，从而使得患者能够更好的获益。
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公开(公告)号：CN114807377B
公开(公告)日：2022-09-23
申请号：CN202210762897.6
申请日：2022-06-29
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B30/00
Abstract: 本发明涉及膀胱癌预后生存期标志物的应用、评估装置以及计算机可读取介质，属于肿瘤医学技术领域。本发明通过对大量膀胱癌患者肿瘤样本的基因组测序数据进行单因素和多因素分析，评估各因素与总生存期的相关性，并建立了包括淋巴结状态、TOP1扩增、MYC扩增、CREBBP突变及CDKN2A缺失状态在内的5特征预后模型，该模型可以有效进行膀胱癌患者预后分层，为临床诊疗提供参考依据。
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公开(公告)号：CN114561473A
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202210455413.3
申请日：2022-04-28
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种PML‑RARA融合基因突变的检测方法，本发明中通过下一代测序技术（NGS）方法能够准确地检测出PML和RARA的融合基因发生的变化情况，本发明的方法能够同步检测基因突变、缺失、增加、和颠换等多种基因变异类型，全面指导临床急性早幼粒细胞白血病（acute promyelocytic leukemia,APL）的诊断，指导后续砷剂或全反式维甲酸（ATRA）治疗和耐药选择。
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公开(公告)号：CN119331977A
公开(公告)日：2025-01-21
申请号：CN202411892918.1
申请日：2024-12-20
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , G16B20/20
Abstract: 本发明涉及一种用于实体瘤ctDNA高灵敏度检测的检测方法和系统。该方法针对高发的20种实体瘤，涵盖了高频主克隆突变基因、与常见靶向治疗相关的关键基因以及与预后相关的基因。所述探针库和试剂盒设计用于通过高通量测序技术对人样本中的这些基因进行高效、准确的检测，从而获取全面的基因变异信息。本发明的方法能够显著提高实体瘤ctDNA检测的灵敏度和准确性，为肿瘤的早期诊断、疗效监测和预后评估提供了一种强有力的工具。
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公开(公告)号：CN114093428A
公开(公告)日：2022-02-25
申请号：CN202111314976.2
申请日：2021-11-08
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
Abstract: 本发明公开一种NGS双端分子标签测序技术和背景降噪算法的检测血浆ctDNA超高测序深度下低丰度突变的检测方法，包括：(1)对所有测序读段携带的双端分子标签序列收集并标注分子标签序列和组合方式；(2)标注后的读段与参考序列进行比对，将分子标签组合序列和比对位置相同的测序读段归类至单分子共识序列；(3)将存在的分子标签组互补且读段序列互补的单分子共识序列进一步归类至双链共识序列；(4)对包含单链共识序列和双链共识序列的比对结果进行突变检测，注释和过滤；(5)对突变检测结果，利用健康人检测结果使用零膨胀泊松分布算法进行背景降噪。在保证100％特异性的前提下提升了检测灵敏度的，ctDNA中丰度0.1％突变的检测敏感性达到95％以上。
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