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    番茄茸毛调控基因的克隆及应用
    11.
    发明授权
    番茄茸毛调控基因的克隆及应用 失效

    公开(公告)号：CN110964731B

    公开(公告)日：2021-07-16

    申请号：CN201911359832.1

    申请日：2019-12-25

    Applicant: 华中农业大学

    Inventor： 叶志彪 ,  解庆敏 ,  杨长宪 ,  张俊红 ,  张余洋 ,  王涛涛 ,  欧阳波 ,  李汉霞 ,  卢永恩

    IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82

    Abstract: 本发明涉及植物基因工程技术领域，具体涉及一种番茄茸毛调控基因的克隆和应用。该番茄茸毛调控的基因的序列如SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2所示，SEQ ID NO：1所示序列与其背景材料TS212相比发生了单碱基的突变，由胞嘧啶(C‑1676)变成了腺嘌呤(A)；与SEQ ID NO：2相比，突变体LA3127存在两个突变位点，第436位由G突变为A，第1676位由C突变为A；与LA1589相比，LA3127发生了多个位点的突变，其中第1676位同样由C突变为A。Ln基因的编码区由胞嘧啶(C‑1676)变成了腺嘌呤(A)，导致了丙氨酸(Ala‑559)到谷氨酸(Glu)的转变，进而诱导腺体毛的显著增加。本发明所克隆的Ln基因能够诱导腺体毛的显著增加，利用克隆的Ln基因的超量表达，可以增强番茄的抗虫性和抗病毒能力，对于番茄育种具有重要的意义。

    一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法
    14.
    发明公开
    一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法 失效

    公开(公告)号：CN109112124A

    公开(公告)日：2019-01-01

    申请号：CN201811126376.1

    申请日：2018-09-26

    Applicant: 华中农业大学

    Inventor： 杨长宪 ,  叶志彪 ,  廖晓利 ,  朱顺华 ,  裴利菲 ,  王涛涛 ,  李汉霞

    IPC: C12N15/11 ,  C12N15/10 ,  C12N15/82 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82

    Abstract: 本发明属于植物基因工程技术领域，公开了一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法，测定转录组数据；TopHat2与参考基因组比对，结合Cufflinks对转录本拼接得转录本；去除表达量和可信度低的单外显子转录本、选择转录本长度>200bp转录本、筛除与数据库注释exon区域有重叠转录本、选择FPKM≥0.5转录本，确定疑似lncRNAs；用PFAM和CPC得lncRNAs。本发明确定在番茄I型腺体毛高表达的lncRNA，得调控番茄腺毛形成的lncRNA000100，全长序列为1266bp；该基因在番茄中超量表达，显著抑制I型番茄腺毛形成；可以在番茄抗虫、抗病毒、抗逆境等方面进行应用。

    一种调控番茄可溶性固形物含量的基因及应用
    16.
    发明授权
    一种调控番茄可溶性固形物含量的基因及应用 有权

    公开(公告)号：CN112522282B

    公开(公告)日：2022-08-09

    申请号：CN202011481174.6

    申请日：2020-12-15

    Applicant: 华中农业大学

    Inventor： 张余洋 ,  叶志彪 ,  袁磊 ,  张俊红 ,  王涛涛 ,  卢永恩 ,  欧阳波 ,  杨长宪

    IPC: C12N15/29 ,  C12Q1/6895

    Abstract: 本发明属于生物技术领域，尤其涉及一种调控番茄可溶性固形物含量的基因及应用。本发明通过对500份番茄核心种质成熟果实进行可溶性固形物分析，鉴定了一批SSC含量显著差异的番茄材料，丰富了番茄品质种质资源库。GWAS结合BSA能更加有效的鉴定数量性状的遗传调控位点。因此，本发明克服现有材料和技术的缺点，通过对SSC变异丰富的自然群体进行GWAS分析与BSA分析，鉴定了SSC的主效调控基因SlSTP1。通过对SlSTP1基因的变异研究不仅有助于选择对可溶性固形物积累更高效的天然变异，还可以进一步认识植物可溶性固形物合成代谢的进化规律和调控机制，对研究高品质番茄选育和番茄的栽培环境改良具有重要意义。

    一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法
    18.
    发明授权
    一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法 失效

    公开(公告)号：CN109112124B

    公开(公告)日：2021-05-21

    申请号：CN201811126376.1

    申请日：2018-09-26

    Applicant: 华中农业大学

    Inventor： 杨长宪 ,  叶志彪 ,  廖晓利 ,  朱顺华 ,  裴利菲 ,  王涛涛 ,  李汉霞

    IPC: C12N15/11 ,  C12N15/10 ,  C12N15/82 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82

    Abstract: 本发明属于植物基因工程技术领域，公开了一种调控番茄腺毛形成的基因及克隆方法，测定转录组数据；TopHat2与参考基因组比对，结合Cufflinks对转录本拼接得转录本；去除表达量和可信度低的单外显子转录本、选择转录本长度>200bp转录本、筛除与数据库注释exon区域有重叠转录本、选择FPKM≥0.5转录本，确定疑似lncRNAs；用PFAM和CPC得lncRNAs。本发明确定在番茄I型腺体毛高表达的lncRNA，得调控番茄腺毛形成的lncRNA000100，全长序列为1266bp；该基因在番茄中超量表达，显著抑制I型番茄腺毛形成；可以在番茄抗虫、抗病毒、抗逆境等方面进行应用。

    一种番茄抗青枯病的分子标记及其应用
    19.
    发明公开
    一种番茄抗青枯病的分子标记及其应用 有权

    公开(公告)号：CN112410463A

    公开(公告)日：2021-02-26

    申请号：CN202011508139.9

    申请日：2020-12-18

    Applicant: 华中农业大学

    Inventor： 叶志彪 ,  任志勇 ,  张俊红 ,  张余洋 ,  王涛涛 ,  李汉霞 ,  欧阳波 ,  卢永恩 ,  杨长宪 ,  叶杰

    IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

    Abstract: 本发明涉及一种番茄抗青枯病的分子标记。其中所述分子标记为SNP分子标记或dCAPS分子标记，所述SNP分子标记如SEQ ID NO.1所示，所述dCAPS分子标记为基于Bwr6所在QTL区间内的一个只存在于携带Bwr6品种中的特异性SNP分子标记(即SEQ ID NO.1)开发获得的dCAPS连锁分子标记。该dCAPS分子标记具有较好的准确性和特异性，能有效鉴定抗青枯病番茄品种，并在88份商品种进行测试未发现假阳性结果的出现；与最新发表的Bwr6连锁分子标记RsR6‑5相比，本发明开发出的分子标记也显示出了更高的准确性。

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