用于确定目标片段单体型的方法、设备、介质和程序产品

    公开(公告)号:CN120072058A

    公开(公告)日:2025-05-30

    申请号:CN202510541354.5

    申请日:2025-04-27

    Abstract: 本发明涉及一种用于确定目标片段单体型的方法、设备、介质和程序产品。该方法包括:获取来自待测样本的关于目标片段的输入测序序列集合,所述输入测序序列集合包含关于目标片段的多条测序序列;将所述测序序列与参考基因组序列进行比对,确定目标片段内与每一条测序序列对应的杂合单核苷酸多态性信息;基于每一个杂合单核苷酸多态性位点对单体型定相的贡献度,对所述输入测序序列集合进行多次递归划分,从而确定所述目标片段的单体型。本发明显著提高了对多拷贝基因进行单体型定相的效率与准确度。

    用于预测待测基因的拷贝数的方法、计算设备和存储介质

    公开(公告)号:CN114420204A

    公开(公告)日:2022-04-29

    申请号:CN202210314661.6

    申请日:2022-03-29

    Abstract: 本发明涉及一种用于预测待测基因的拷贝数的方法、计算设备和存储介质。该方法包括:获取待测样本的测序序列数据,测序序列数据为经由第三代测序技术而获得的关于待测基因的三代测序序列;基于所获取的测序序列数据,确定关于待测基因的单体型数目和测序深度;以及基于所确定的单体型数目和测序深度,确定关于待测样本的待测基因的拷贝数的预测结果。本发明能够在低成本下,针对重复区域或高度同源基因准确确定基因拷贝数。

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