公开(公告)号：CN114581724B

公开(公告)日：2022-07-26

申请号：CN202210485325.8

申请日：2022-05-06

Applicant: 北京大学

Inventor： 吴赵龙 ,  韩旭 ,  毛有东 ,  欧阳颀

IPC: G06V10/764 ,  G06K9/62 ,  G06N3/00 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了一种生物分子冷冻电镜数据的构象分类方法，属于结构生物学与计算科学的交叉领域。本发明在卷积残差神经网络模型的基础上，对冷冻电镜单颗粒数据进行有监督的高精度构象分类，以发现生物分子的新构象类，使单颗粒图像数据进行性能更为强大的监督分类成为可能，从而获得生物分子潜在新构象状态的结构。

公开(公告)号：CN114580603B

公开(公告)日：2022-07-26

申请号：CN202210484308.2

申请日：2022-05-06

Applicant: 北京大学

Inventor： 韩旭 ,  吴赵龙 ,  毛有东 ,  欧阳颀

IPC: G06N3/00 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08 ,  G06K9/62 ,  G06V10/764

Abstract: 本发明公开了一种基于冷冻电镜数据构建单颗粒水平的能量曲面的方法，属于数据科学与生物学的交叉领域。本发明通过单颗粒数据的分组分类、三维电子密度图数据集的低维流形映射、单颗粒图像与其对应投影图像的相似程度计算、利用卷积神经网络的训练与预测得到单颗粒水平的能量曲面。本发明得到单颗粒水平能量曲面，可以直观反映生物分子构象分布，扩展了冷冻电镜数据多构象分析的方式，提高了数据处理结果对高噪声的鲁棒性。

公开(公告)号：CN1182257C

公开(公告)日：2004-12-29

申请号：CN03100489.X

申请日：2003-01-16

Applicant: 北京大学

Inventor： 毛有东 ,  欧阳颀

IPC: C12Q1/68 ,  G01N33/53 ,  B82B3/00 ,  B81B7/04

CPC classification number: B82Y30/00 ,  B82Y5/00 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明提供了一种能够在分子水平进行机械操作的可开关的工具——活性基因分子纳米舱，由多个基因分子单元在固体衬底上重复排列构成，每个基因分子单元包含一段双链和一段单链；相对于固体衬底，单链部分靠近衬底，双链部分远离衬底；单链部分的一端固联在固体衬底表面；各基因分子单元的双链部分紧密排列形成一层致密的分子膜，从而在双链部分形成的分子膜和固体衬底表面之间形成一个纳米量级高度的分子舱。本发明还提供了所述活性基因分子纳米舱的制备方法。本发明的活性基因分子纳米舱，可以在分子水平进行人工操作，包括分子捕捉、基因识别、微能量存储与释放等，可应用于分子生物学、生物化学的研究，广泛用于生物物理材料(如生物芯片)的制造和发展。

公开(公告)号：CN1363689A

公开(公告)日：2002-08-14

申请号：CN02100344.0

申请日：2002-01-11

Applicant: 北京大学

Inventor： 毛有东 ,  欧阳颀

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明涉及一种化学电极型基因探针的制备方法,选择金丝或表面镀金的金属丝为电极探针的原始材料,将探测DNA固联到探针的探头上,探测DNA具有发夹结构,再修饰氧化还原指示剂,得到具有化学和生物活性的基因探针。这种基因探针避免了对目标基因的化学修饰,简化了检测、识别的过程;具有理想的高灵敏度;可实时检测;避免了荧光检测方法中容易出现的“假阳性”问题;有良好的复用性;制备工艺简单,易于使用和制作各种生物探针。可广泛用于分子生物学、细胞生物学、生物医学、生物探针、人类基因组研究,及临床诊断等方面。