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公开(公告)号:CN118932024A
公开(公告)日:2024-11-12
申请号:CN202411191021.6
申请日:2024-08-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6837 , C12Q1/6874 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种空间转录组芯片及其制备方法与应用。本发明方法包括如下步骤:将基底清洗,放入疏水性硅烷溶液中浸泡,然后使用强腐蚀性试剂或激光刻蚀点阵,再依次加入Spacer试剂、Unylinker分子处理,在其上通过3D喷墨打印或者光化学原位合成设备合成用于空间转录组分析的DNA序列,采用凝胶或收缩薄膜捕获所述DNA阵列芯片的DNA序列,得到包含了捕获序列点阵的凝胶层或收缩薄膜,等比例缩小,将缩小后的凝胶层或收缩薄膜固定到基底上,即得到高空间分辨率、高检测灵敏度的空间转录组芯片。本发明通过序列点阵缩小工艺提高空间转录组分析的空间分辨率和检测灵敏度。
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公开(公告)号:CN117229330A
公开(公告)日:2023-12-15
申请号:CN202311116401.9
申请日:2023-08-31
Applicant: 上海交通大学 , 上海迪赢生物科技有限公司
Abstract: 本发明涉及寡核苷酸合成技术领域,公开了二氧化硅微球在合成超长寡核苷酸中的应用以及合成超长寡核苷酸的方法,其中,二氧化硅微球的比表面积小于1m2/g,优选情况下,二氧化硅微球的表面具有修饰基团。合成超长寡核苷酸的方法包括:在偶联反应条件下,以表面具有修饰基团的二氧化硅微球作为载体使核苷亚磷酰胺合成单元进行偶联反应。采用本发明的制备的载体可以制备得到超长寡核苷酸。
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公开(公告)号:CN107604046B
公开(公告)日:2021-08-24
申请号:CN201711073031.X
申请日:2017-11-03
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/6869 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法。该方法包括如下步骤:血浆游离DNA提取,DNA化学错误修复,自校验双分子识别码发夹型接头制备,血浆游离DNA修复,DNA与接头连接,Pre‑PCR扩增,超量杂交捕获,Post‑PCR扩增,上机测序,数据纠错校正,突变分析与注释。本发明的方法可以高效实现血浆循环游离DNA的低频突变检测。DNA错误修复和双重冗余校验技术使得该方法在检测微量样本时具有超低的假阳性率和高灵敏度,避免了现有血浆循环游离DNA检测方法的缺陷,不仅可以实现癌症突变检测和靶向用药指导,也可实现胎儿遗传和出生缺陷早期筛查。
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公开(公告)号:CN110079633A
公开(公告)日:2019-08-02
申请号:CN201810073814.6
申请日:2018-01-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/70
Abstract: 本发明公开了一种基于DNA折纸标记检测乙肝病毒亚型的方法。本发明提供了的试剂盒,包括多套生物制品;每套生物制品包括1组或多组试剂;每套生物制品对应1种病毒基因型和1种形状的DNA折纸;每组所述试剂由具有延伸区域的DNA折纸和其对应的1条介导探针组成;每组所述试剂中的所述DNA折纸的延伸区域为将构成该DNA折纸每个端点的1条短链延伸出5个T后再延伸出大小为54-1119nt的游离区域;本发明开发了一组基于自组装方法的DNA折纸纳米结构作为特异性标记,通过特定设计的探针捕获标记临床乙肝病毒样品DNA,最终在原子力显微镜(AFM)扫描中识别出相应的HBV基因型。
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公开(公告)号:CN104983734B
公开(公告)日:2018-04-03
申请号:CN201510386611.9
申请日:2015-06-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/565 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了Estradiol在制备抗小细胞肺癌和/或卵巢癌和/或骨肉瘤产品中的应用。本发明提供了Estradiol在制备治疗小细胞肺癌和/或卵巢癌和/或骨肉瘤产品中的应用。本发明的实验证明,本发明对FDA,CFDA已获批准的药物Estradiol进行肿瘤药物重定位,根据肿瘤不同的细胞系(组织类型)以及突变位点对适应症不是抗肿瘤的药物进行筛选,发现Estradiol抗小细胞肺癌和/或卵巢癌和/或骨肉瘤这种新用途,实现旧药新用。
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公开(公告)号:CN105030785B
公开(公告)日:2017-11-10
申请号:CN201510386589.8
申请日:2015-06-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/5415 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了Promethazine在制备抗肝癌和/或结肠癌和/或肺癌产品中的应用。本发明提供了Promethazine在制备治疗肝癌和/或结肠癌和/或肺癌产品中的应用。本发明的实验证明,本发明对FDA,CFDA已获批准的药物Promethazine进行肿瘤药物重定位,根据肿瘤不同的细胞系(组织类型)以及突变位点对适应症不是抗肿瘤的药物进行筛选,发现Promethazine抗肝癌和/或结肠癌和/或肺癌这种新用途,实现旧药新用。
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公开(公告)号:CN104762389B
公开(公告)日:2017-05-03
申请号:CN201510155482.2
申请日:2015-04-02
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 上海交通大学
Inventor: 赵曜 , 师咏勇 , 王镛斐 , 李士其 , 李志强 , 陈剑华 , 寿雪飞 , 沈明 , 叶钊 , 马增翼 , 张启麟 , 宋智健 , 王涛 , 何文强 , 季珏 , 温祖佳 , 周良辅 , 毛颖
Abstract: 本发明公开了单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应用。本发明所保护的一个技术方案是检测人基因组中rs2359536的多态性(等位基因)或基因型的物质在制备检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs2359536的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查垂体腺瘤患者的产品。
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公开(公告)号:CN104593490A
公开(公告)日:2015-05-06
申请号:CN201410831608.9
申请日:2014-12-23
Applicant: 复旦大学附属华山医院 , 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了USP8基因检测物在制备ACTH型垂体腺瘤分子病理诊断及分型产品中的应用。本发明提供了用于检测待测ACTH型垂体腺瘤患者的ACTH型垂体腺瘤亚型的试剂盒,包括记载检测标准的比对卡和测序仪。本发明的实验证明,USP8基因突变为ACTH型垂体腺瘤所特有,其他类型的垂体腺瘤中未见该基因突变,故其可作为ACTH型垂体腺瘤一个特异性的分子病理诊断标记物。ACTH垂体腺瘤可进一步分为两种亚型,即突变型(发生USP8基因突变)和野生型(USP8基因无突变),从而及时采取个体化的临床治疗策略。
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公开(公告)号:CN102918158B
公开(公告)日:2014-05-28
申请号:CN201080067164.6
申请日:2010-05-31
Applicant: 山东大学 , 山东山大附属生殖医院有限公司 , 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明提供了与多囊卵巢综合征(PCOS)相关的SNP,这些SNP在数以千计的中国PCOS病例中被发现。本发明还提供了具有所述SNP的探针和包括一个或多个这些探针的芯片。所述探针和芯片可以用于筛选、预测或诊断PCOS。
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公开(公告)号:CN102199668B
公开(公告)日:2014-03-12
申请号:CN201110095717.5
申请日:2011-04-15
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种生物遗传技术领域的纳米颗粒分子单倍型分型方法,以待测样本的基因组DNA为模板,用对应目的DNA片段中的SNP等位基因的正向等位基因特异性引物和反向通用引物,通过长片段AuNP ASPCR处理实现目的DNA片段的染色单体的分离和扩增。本发明创新地在ASPCR体系中加入AuNP,有效的提高了单倍型分型的特异性;得到的单倍体PCR产物可直接用于SNP基因分型,如TaqMan探针和测序等,来获得待测两倍体个体的一个单倍型。待测样本的另一个单倍型可以用同样的方法得到,或者从基因型来推测。
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