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公开(公告)号：CN119061115A
公开(公告)日：2024-12-03
申请号：CN202310627933.2
申请日：2023-05-30
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6874 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B20/30
Abstract: 本发明提供一种可编程表观遗传修饰的DNA分子探针制备方法和装置，包括：获取单链DNA并按照预定顺序分为不同区域，每个区域预先分配一个至多个表观遗传修饰位点；基于单链DNA不同区域的修饰分布信息，引入与各个区域互补的DNA短链，DNA短链内携带有表观遗传修饰信息；DNA短链与单链DNA杂交形成杂交体；根据DNA短链上的表观遗传修饰信息，选用对应的生物酶，对杂交体进行表观遗传修饰化学基团链转移反应，得到可编程表观遗传修饰的DNA分子探针。本发明利用探针序列的可编程性和纳米材料种类多样性，按需要设计不同结构的DNA探针和选择不同类型的纳米材料合成功能化的纳米探针，以研究基因在不同位置被修饰后基因表达水平的改变，在生物领域具有较大应用前景。
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公开(公告)号：CN114581724A
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202210485325.8
申请日：2022-05-06
Applicant: 北京大学
IPC: G06V10/764 , G06K9/62 , G06N3/00 , G06N3/04 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种生物分子冷冻电镜数据的构象分类方法，属于结构生物学与计算科学的交叉领域。本发明在卷积残差神经网络模型的基础上，对冷冻电镜单颗粒数据进行有监督的高精度构象分类，以发现生物分子的新构象类，使单颗粒图像数据进行性能更为强大的监督分类成为可能，从而获得生物分子潜在新构象状态的结构。
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公开(公告)号：CN114580603A
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202210484308.2
申请日：2022-05-06
Applicant: 北京大学
IPC: G06N3/00 , G06N3/04 , G06N3/08 , G06K9/62 , G06V10/764
Abstract: 本发明公开了一种基于冷冻电镜数据构建单颗粒水平的能量曲面的方法，属于数据科学与生物学的交叉领域。本发明通过单颗粒数据的分组分类、三维电子密度图数据集的低维流形映射、单颗粒图像与其对应投影图像的相似程度计算、利用卷积神经网络的训练与预测得到单颗粒水平的能量曲面。本发明得到单颗粒水平能量曲面，可以直观反映生物分子构象分布，扩展了冷冻电镜数据多构象分析的方式，提高了数据处理结果对高噪声的鲁棒性。
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公开(公告)号：CN103361263A
公开(公告)日：2013-10-23
申请号：CN201310291183.2
申请日：2013-07-11
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明涉及生物学技术领域，特别涉及一种细胞趋化分析芯片，包括进液腔室、趋化通道、栅栏通道和吸液腔室；进液腔室设有用于加入细胞溶液的进液口；进液腔室用于容纳细胞溶液；趋化通道的一端与进液腔室相连通，趋化通道的另一端与栅栏通道的一端相连通，趋化通道的内径大于细胞溶液中所含细胞的直径；栅栏通道的内径小于细胞溶液中所含细胞的直径；栅栏通道的另一端与吸液腔室相连通；吸液腔室用于吸收细胞溶液中的溶液。本发明还涉及该细胞趋化分析芯片的使用方法和制作方法。本发明可以非常方便的定量观测到细胞在特定浓度梯度下的趋化过程，排除流动对此过程的影响，为细胞趋化行为的研究提供了方便。
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公开(公告)号：CN1425777A
公开(公告)日：2003-06-25
申请号：CN03100489.X
申请日：2003-01-16
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明提供了一种能够在分子水平进行机械操作的可开关的工具——活性基因分子纳米舱，由多个基因分子单元在固体衬底上重复排列构成，每个基因分子单元包含一段双链和一段单链；相对于固体衬底，单链部分靠近衬底，双链部分远离衬底；单链部分的一端固联在固体衬底表面；各基因分子单元的双链部分紧密排列形成一层致密的分子膜，从而在双链部分形成的分子膜和固体衬底表面之间形成一个纳米量级高度的分子舱。本发明还提供了所述活性基因分子纳米舱的制备方法。本发明的活性基因分子纳米舱，可以在分子水平进行人工操作，包括分子捕捉、基因识别、微能量存储与释放等，可应用于分子生物学、生物化学的研究，广泛用于生物物理材料(如生物芯片)的制造和发展。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN1082189C
公开(公告)日：2002-04-03
申请号：CN98120104.0
申请日：1998-09-29
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明光纤阵列型基因芯片，其制作方法是预先在单根光纤单元的端面生长基因探针并固化后，再将一组带不同基因探针的光纤单元排布成阵列。本发明的特点是相邻基因探针间不会形成串扰，光纤阵列型基因芯片允许在光纤单元两端进行检测，每种光纤单元的基因探针生长可大批量一次性完成，再组合成一定规格的阵列。本发明可靠性高，检测灵敏度高，制作效率高且成本低，可广泛应用于分子生物学，生物医学及人类基因组研究，以至临床诊断。
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公开(公告)号：CN119709691A
公开(公告)日：2025-03-28
申请号：CN202411358799.1
申请日：2024-09-27
Applicant: 北京大学 , 中国科学院深圳先进技术研究院
IPC: C12N9/14 , C12N9/12 , C12N9/10 , C12N15/70 , C12N15/81 , C12N15/85 , C12N15/54 , C12N15/55 , C12P19/34 , C12R1/19 , C12R1/865
Abstract: 本发明涉及一种RNA加帽酶，所述加帽酶包含与SEQ ID NO:1‑28中的任一序列具有高度同一性的氨基酸序列或由所述氨基酸序列组成，可在体外、人细胞内、小鼠细胞内或酵母细胞内表达，并同时具有RNA 5’三磷酸酶(RT)、鸟苷酸转移酶(GT)和RNA鸟嘌呤‑N7甲基转移酶(RNMT)的活性。本发明还涉及对SEQ ID NO:1‑28中的任一序列进行氨基酸的取代、添加和/或缺失后得到的突变体、编码加帽酶和/或其突变体的核酸序列、包含所述核酸序列的表达构建体或宿主细胞。本发明还涉及包含所述加帽酶的组合物以及使用所述加帽酶、其突变体或其组合物对RNA进行加帽的方法和反应体系。
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公开(公告)号：CN114563259B
公开(公告)日：2022-07-26
申请号：CN202210464835.7
申请日：2022-04-29
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种基于微流控芯片制备时间分辨冷冻电镜样品的方法及装置。通过设计微流控芯片，使生化反应的底物进入微流控芯片的反应通道，在反应发生后的不同时间点通过连接在反应通道不同位置处的输出通道将反应溶液引出，并通过枪头快速涂写或喷射在金属载网上，获取反应过程中不同时间点上的样品，然后快速进行冷冻制样，实现对时间分辨的样品进行冷冻电镜数据采集和分析。本发明使捕获生物样品短时间尺度（如微秒级）的中间状态成为可能，从而获得生物分子三维结构与构象分布随时间的演化特征。
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公开(公告)号：CN111909828A
公开(公告)日：2020-11-10
申请号：CN201910666239.5
申请日：2019-07-23
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明涉及一种能用于捕获目标颗粒(如循环肿瘤细胞CTC)的微流控芯片，该芯片包括汇聚分流单元，所述汇聚分流单元能够将液体样本(如血液、灌流液等)中的目标颗粒汇聚在液流中心，同时将一定比例的不含目标颗粒的液流分走，进而对输入芯片的液流进行有效的降流降速，从而更有利于液流中目标颗粒的捕获；当芯片用于目标颗粒的捕获时，还包括捕获单元，并通过所述捕获单元实现对目标颗粒的捕捉。本发明的芯片能够在待测样本流速和流量均很高的情况下，有效富集目标颗粒并降低整体流量和流速，当芯片中进一步包含捕获单元时，即可灵敏而特异的捕捉目标颗粒(特别是CTC)，非常适合于大规模的临床应用。
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公开(公告)号：CN106047665A
公开(公告)日：2016-10-26
申请号：CN201610617882.5
申请日：2016-07-29
Applicant: 北京大学
CPC classification number: G01N33/5029
Abstract: 本发明公开了一种用于高通量细胞迁移研究的方法和细胞迁移研究系统，采用细胞布置器件中的细胞群体限制腔室培养贴壁生长的细胞，得到贴壁生长的细胞群。将贴壁生长的细胞群放在迁移测试器件中的迁移测试腔室中培养，获取细胞生长过程中的图片，以通过图片记录的细胞群的生长所覆盖的区域，计算细胞迁移的迁移距离。采用本发明提供的细胞迁移研究系统进行细胞迁移研究，通过细胞群体限制腔室得到贴壁生长的细胞群，再通过对迁移测试腔室中细胞生长的图片的获取，这种研究方法具有极高的可重复性，并能通过图像处理将细胞的迁移能力定量化。
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