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公开(公告)号：CN116716432A
公开(公告)日：2023-09-08
申请号：CN202310918645.2
申请日：2023-07-25
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , B01L3/00 , C12R1/72
Abstract: 本申请涉及真菌耐药机制以及耐药快速检测的技术领域，具体公开了近平滑念珠菌唑类耐药相关的新突变位点及其应用。本申请公开了三个唑类耐药相关的新突变位点，分别为：MRR1基因的C1873A突变（氨基酸突变为Q265K）；TAC1基因的G1318T突变（氨基酸突变为D440Y）和C1475T突变（氨基酸突变为T492M）。本申请发现的新突变位点可作为检测靶点应用于近平滑念珠菌唑类耐药性的检测中，促进了近平滑念珠菌唑类耐药性的分子检测水平的发展，且检测时间短，能够有效缩短阳性检出患者的诊断时间，节约患者治疗时间和费用。
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公开(公告)号：CN110408720A
公开(公告)日：2019-11-05
申请号：CN201910726815.0
申请日：2019-08-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/04
Abstract: 本发明提供一种高分辨率熔解曲线鉴定耳念珠菌的方法，包括如下步骤：步骤一、准备待鉴定菌株包括耳念菌株和对照菌株的DNA模板；步骤二、设计上下游引物；步骤三、利用高分辨率溶解曲线技术HRM，获取各菌株高分辨溶解曲线图，具体为利用Real-time PCR技术，通过实时检测DNA熔解过程中荧光信号值的变化获取各菌株高分辨溶解曲线图；步骤四、利用分析软件分析鉴定待鉴定菌株的具体类型；步骤五、测定步骤三中结果为阳性菌株的核苷酸序列；步骤六、验证鉴定方法的灵敏度。本发明提供高分辨率熔解曲线鉴定耳念珠菌的方法，可以明确鉴定耳念珠菌并与相近的菌株进行区分，方法操作简单，准确高效。
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公开(公告)号：CN117604138A
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：CN202311307431.8
申请日：2023-10-10
Applicant: 首都医科大学附属北京朝阳医院 , 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12R1/72 , C12R1/74
Abstract: 本发明提供用于鉴别诊断和/或筛查患者感染的念珠菌属真菌是否对唑类药物耐药的试剂盒、标志物及其应用，所述试剂盒所述试剂盒包括用于检测念珠菌真菌ERG11基因的串联重复的检测试剂。系统发育簇AZR分离株表现出极高水平的唑类耐药性表型，ERG11基因的串联重复加上关键位点突变A395T，成为在AZR簇分离株中观察到的独特特征。这种特定的拷贝数变异(CNV)机制与菌株ERG11基因表达水平的升高和唑类最小抑菌浓度(MIC)的升高密切相关。
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公开(公告)号：CN112646860B
公开(公告)日：2022-10-11
申请号：CN202110002930.0
申请日：2021-01-04
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种DNA甲基化靶向富集的方法，特异性富集甲基化修饰DNA片段。通过本发明所得到的靶向富集后的DNA可广泛应用于下游诸多分子诊断，如基于检测母体血浆中胎儿游离DNA的无创性产前分子诊断(NITP)，病原微生物检测，肿瘤伴随诊断等。
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公开(公告)号：CN108103229B
公开(公告)日：2021-09-07
申请号：CN201810060340.1
申请日：2018-01-22
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了克柔念珠菌STR分子标记及其应用，其中共包括46个高度多态的微卫星位点（SEQ ID NO:1‑40）。同时，提供了一套能够高效扩增克柔念珠菌群体的特导性引物（SEQ ID NO:41‑120）和检测条件。这一套克柔念珠菌的微卫星标记，不仅可以用于球形孢子丝菌的遗传背景分析和分子溯源，同时也可应用于球形孢子丝菌的分子流行病学、群体遗传学和系统进化分析。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN107629960A
公开(公告)日：2018-01-26
申请号：CN201710960600.6
申请日：2017-10-16
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明提供从阳性血中分离细菌的试剂，包括用于溶解来自血液培养物的血液样品中的血细胞的A剂，还包括用作清洗剂的B剂和用于破碎病原菌细胞壁、促进细胞中的蛋白释放的C剂；所述A剂为皂素溶液和SDS中至少一种或其它能裂解血细胞的表面活性剂。本发明还提供从阳性血中分离细菌的方法及细菌鉴定方法，先用A剂裂解血细胞，然后B剂洗去细胞碎片和杂质，最后C剂破碎病原菌细胞壁，让细菌的蛋白质释放出来并取含有细菌蛋白质的上清液坐位后续鉴定的样品；将用于鉴定的样品点样到靶板的空位上，室温干燥后覆盖基质于样品上，室温干燥，然后上机检测。可实现快速鉴定细菌，半小时内即可结果，且检测结果可靠性高，干扰小。
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公开(公告)号：CN116536447B
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN202310759738.5
申请日：2023-06-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明提供了一种拟平滑念珠菌微卫星位点、一种拟平滑念珠菌的微卫星位点的检测方法、一种用于扩增拟平滑念珠菌微卫星位点的引物组、一种用于检测拟平滑念珠菌的微卫星位点的试剂盒、拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法在拟平滑念珠菌的分子分型、分子溯源、院感监测、群体遗传和系统进化分析中的应用。利用本发明提供的拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法和特异性引物组对拟平滑念珠菌的型别进行检测，多态性高、特异型好，在拟平滑念珠菌分子流行病学、群体遗传研究等方面具有重要意义。
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公开(公告)号：CN116536447A
公开(公告)日：2023-08-04
申请号：CN202310759738.5
申请日：2023-06-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明提供了一种拟平滑念珠菌微卫星位点、一种拟平滑念珠菌的微卫星位点的检测方法、一种用于扩增拟平滑念珠菌微卫星位点的引物组、一种用于检测拟平滑念珠菌的微卫星位点的试剂盒、拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法在拟平滑念珠菌的分子分型、分子溯源、院感监测、群体遗传和系统进化分析中的应用。利用本发明提供的拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法和特异性引物组对拟平滑念珠菌的型别进行检测，多态性高、特异型好，在拟平滑念珠菌分子流行病学、群体遗传研究等方面具有重要意义。
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公开(公告)号：CN112646860A
公开(公告)日：2021-04-13
申请号：CN202110002930.0
申请日：2021-01-04
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种DNA甲基化靶向富集的方法，特异性富集甲基化修饰DNA片段。通过本发明所得到的靶向富集后的DNA可广泛应用于下游诸多分子诊断，如基于检测母体血浆中胎儿游离DNA的无创性产前分子诊断(NITP)，病原微生物检测，肿瘤伴随诊断等。
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公开(公告)号：CN110484641A
公开(公告)日：2019-11-22
申请号：CN201910727456.0
申请日：2019-08-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/04 , C12R1/72
Abstract: 本发明提供一种高分辨率熔解曲线鉴定光滑念珠菌的方法，包括如下步骤：步骤一、准备待鉴定菌株包括光滑念珠菌、尼瓦利亚念珠菌、布加拉念珠菌和对照菌株的DNA模板；步骤二、设计上下游引物；步骤三、利用高分辨率溶解曲线技术HRM，获取各菌株高分辨溶解曲线图，具体为利用Real-time PCR技术，通过实时检测DNA熔解过程中荧光信号值的变化获取各菌株高分辨溶解曲线图；步骤四、利用分析软件分析鉴定待鉴定菌株的具体类型；步骤五、测定步骤三中结果为阳性菌株的核苷酸序列；步骤六、验证鉴定方法的灵敏度。本发明提供高分辨率熔解曲线鉴定光滑念珠菌的方法，可明确鉴定光滑念珠菌复合体中的不同物种，方法操作简单，准确高效。
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