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公开(公告)号：CN115064218B
公开(公告)日：2022-11-25
申请号：CN202210986706.4
申请日：2022-08-17
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本申请公开了一种构建病原微生物数据鉴定平台的方法及装置，所述方法包括：将病原微生物数据进行去重复、去缺失、删除无关信息、数值替换和数据类型转化处理；利用处理后的病原微生物数据构建数据集，所述数据集包括所述处理后的病原微生物数据和与所述处理后的病原微生物数据对应的数据鉴定标签；基于所述数据集，使用PreAI算法构建模型；根据所述模型构建平台。本申请通过对病原微生物数据中的重复、缺失、无关信息等内容进行去除，并且对部分数据进行了数值替换和数据类型转化，有效提高了后续对于模型训练的效率以及准确性，从而能够有效减少鉴定病原微生物数据所需要耗费的时间成本和人工成本。
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公开(公告)号：CN118212987A
公开(公告)日：2024-06-18
申请号：CN202410628294.6
申请日：2024-05-21
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备，涉及基因技术领域，该方法包括：获取待测样本的测序数据；对测序数据进行预处理，获得目标测序数据；将目标测序数据与物种数据库进行比对，获得目标物种序列数据集，对目标物种序列数据集进行序列组装，获得组装结果；对组装结果进行基因预测，获得基因预测结果；对各个基因预测结果进行去冗余处理，得到各个非冗余基因序列；将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对，获得每个非冗余基因序列对应的注释结果；基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法，能够准确地确定出耐药基因序列。
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公开(公告)号：CN118212987B
公开(公告)日：2024-08-20
申请号：CN202410628294.6
申请日：2024-05-21
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备，涉及基因技术领域，该方法包括：获取待测样本的测序数据；对测序数据进行预处理，获得目标测序数据；将目标测序数据与物种数据库进行比对，获得目标物种序列数据集，对目标物种序列数据集进行序列组装，获得组装结果；对组装结果进行基因预测，获得基因预测结果；对各个基因预测结果进行去冗余处理，得到各个非冗余基因序列；将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对，获得每个非冗余基因序列对应的注释结果；基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法，能够准确地确定出耐药基因序列。
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公开(公告)号：CN115064218A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210986706.4
申请日：2022-08-17
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本申请公开了一种构建病原微生物数据鉴定平台的方法及装置，所述方法包括：将病原微生物数据进行去重复、去缺失、删除无关信息、数值替换和数据类型转化处理；利用处理后的病原微生物数据构建数据集，所述数据集包括所述处理后的病原微生物数据和与所述处理后的病原微生物数据对应的数据鉴定标签；基于所述数据集，使用PreAI算法构建模型；根据所述模型构建平台。本申请通过对病原微生物数据中的重复、缺失、无关信息等内容进行去除，并且对部分数据进行了数值替换和数据类型转化，有效提高了后续对于模型训练的效率以及准确性，从而能够有效减少鉴定病原微生物数据所需要耗费的时间成本和人工成本。
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