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公开(公告)号：CN114010365B
公开(公告)日：2025-01-10
申请号：CN202111321260.5
申请日：2021-11-09
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
Abstract: 一种适用于影像学随访的输尿管支架，包括一根管状物，管状物的中部为直段部，两端互为相反方向朝内弯曲构成卷曲部，管状物的管壁由高密度部和低密度部构成，低密度部由低密度透射线材料构成，高密度部由高密度不透射线材料构成，高密度部和低密度部沿管状物的延伸方向螺旋间隔盘绕。1.能够通过螺旋高密度部材料提供输尿管支架内外部异物的位置信息。2.螺旋排布的高密度部能够提供结石位置、尺寸、形状等信息，起到标尺作用。3.螺旋排布的高密度部能够防止横向排布时支架于低密度部横断却丧失信息：采用本发明的高密度部与低密度部螺旋排布，如果发生横断，则高密度部必然会断裂，那么必然能够得知断裂的发生以及迅速获取断裂的位置信息。
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公开(公告)号：CN114854839A
公开(公告)日：2022-08-05
申请号：CN202210367674.X
申请日：2022-04-08
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12Q1/6874 , G16B20/00
Abstract: 本发明公开了基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法，该方法包括通过多轮DNA连接反应对组织细胞中的DNA、RNA、蛋白质、染色质以及糖类等分析物进行XYZ三维空间编码，再通过测序技术解析相应的空间位置和生物学信息，进而实现组织的三维空间组学分析。本发明基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法具有操作方便、技术门槛低、成本低廉等优点，能够获取完整组织异质细胞的三维空间分布及相应的生物学信息表达，广泛应用于神经科学、病理学、组织发育等方向的研究。
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公开(公告)号：CN111793628A
公开(公告)日：2020-10-20
申请号：CN202010691163.4
申请日：2020-07-17
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12N15/115 , C12M1/00 , B01L3/00 , C12N5/09 , C12N5/073
Abstract: 本发明涉及一种多维度多价树枝状DNA聚合物，聚合物支架；单链DNA、纳米结构的DNA和/或PAMAM树枝状分子，其会结合所述聚合物支架上，能以其结合到的聚合物结点向外延伸；核酸适配体或多肽，其能结合所述的单链DNA、纳米结构的DNA和/或PAMAM树枝状分子，并能够特异性结合靶向分子；所述多维度多价树枝状DNA聚合物优选地包括聚丙烯酰胺支架；至少一种单链DNA，其连接到聚丙烯酰胺支架；至少一种核酸适配体，其通过碱基互补配对原则结合到至少一种单链DNA。多维度多价树枝状DNA聚合物可以修饰到微流控芯片或磁珠上，从而用来富集细胞(如，循环肿瘤细胞、循环胎儿细胞等)，并进行下游基因分析。
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公开(公告)号：CN116844650A
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202310863572.1
申请日：2023-07-13
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: G16B50/10 , G16B40/20 , G16B30/00 , G06N3/096 , G06N3/0985 , G06F18/213 , G06F18/2415
Abstract: 本发明公开了一种基于域泛化的可拓展测序数据中的细胞恶性状态注释方法，将来自不同组织的数据划分为不同的域进行特征提取，应用于单细胞或空间数据中细胞恶性状态的注释，训练基于多域的泛化模型来预测来自不同域(包括未知域)的测试数据的标签；在分类层由两个神经元输出恶性和非恶性分数；在领域泛化训练过程中，采用基于经验风险和方差的损失函数优化方法进行领域泛化，提高模型的泛化性能；达到循环停止条件后，输出训练完成的神经网络模型。本发明提供的方法能够精确地给目标样本分配准确的标签，用于注释细胞或空间恶性状态。
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公开(公告)号：CN108753571A
公开(公告)日：2018-11-06
申请号：CN201810544015.2
申请日：2018-05-30
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
CPC classification number: C12M23/16 , C12N5/0603 , C12N5/0694
Abstract: 本发明提供了一种细胞分型捕获芯片和方法。所述的细胞分型捕获芯片，其特征在于，包括芯片基体，芯片基体设有进样孔、出样孔以及形成于进样孔和出样孔之间的流道，所述流道内设有微柱阵列，所述的微柱阵列在不同区域修饰标记有不同亲和力特异性识别分子的纳米结构，所述特异性识别分子包括抗体、核酸适体、多肽以及配体中的至少一种；所述修饰特异性识别分子的纳米结构同靶标细胞具有不同的亲和能力，因此能够实现不同类型靶细胞在不同区域的识别和富集。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118421431A
公开(公告)日：2024-08-02
申请号：CN202410481723.1
申请日：2024-04-22
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12M1/00 , B01L3/00 , C12N5/09 , G01N21/64 , G01N33/569 , G16B25/10 , G16B25/20 , G16B40/00 , G16H50/20 , B82Y40/00 , B82Y5/00
Abstract: 本发明公开了一种纳米孔晶体微芯片，该芯片可以用于对肿瘤外泌体进行筛选和定量，同时能够对癌症进行精确早期诊断等。本发明通过尺寸筛选跟免疫亲和捕获的多参数正交捕获，建立外泌体筛选阈值，同时结合光子晶体效应对信号强度进行增强，从而得到了一种能够准确筛选目标外泌体亚群、对低丰度目标外泌体直接定量、对早期患者进行精确诊断的纳米孔晶体微芯片。
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公开(公告)号：CN110592093B
公开(公告)日：2023-08-25
申请号：CN201910850939.X
申请日：2019-09-10
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12N15/115 , C12N5/09 , G16B40/00 , G16B40/30 , G01N33/68 , G01N33/574
Abstract: 本发明提供了一种能够识别EpCAM蛋白的核酸适体，其特征在于，其为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11中任一序列所示的DNA片段。本发明通过多维度分析框架筛选得到的能够识别EpCAM蛋白的核酸适体具有比蛋白抗体更高的亲和力与特异性，将成为EpCAM检测的有力工具，在肿瘤早期诊断、循环肿瘤细胞捕获等领域具有良好的应用前景。
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公开(公告)号：CN116612817A
公开(公告)日：2023-08-18
申请号：CN202310581873.5
申请日：2023-05-22
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: G16B20/30 , G06N20/00 , G06N3/0895
Abstract: 本发明涉及一种对多样本混合的单细胞数据混样拆分的方法，属于单细胞分析技术领域。包括分别进行多样本混合的单细胞测序和各样本单独的批量线粒体测序；提取线粒体变异位点频率矩阵；筛选差异较大的高可变位点，对每个细胞与每个样本进行高可变位点频率的相关性系数计算，将每个单细胞中相关性系数值最大且大于0的对应样本作为该细胞的样本标签；通过半监督的机器学习模型，将单细胞线粒体变异位点频率矩阵中细胞间位点频率的相关性系数作为边，将每个单细胞作为点，从已知样本标签的点开始，将标签通过边向未知样本标签的点传播，直至达到模型停止条件，输出每个单细胞的预测标签。通过本发明获得的结果准确度高，计算效率高。
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公开(公告)号：CN110600080B
公开(公告)日：2023-04-18
申请号：CN201910850896.5
申请日：2019-09-10
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
Abstract: 本发明提供了一种基于多维度分析框架的功能核酸全面识别方法，包括：基于核酸文库测序数据，利用多维度分析框架对功能核酸进行筛选；所述多维度分析框架包括：结构域/模式序列含量Kscore、核酸家族富集程度Fscore与结构稳定性Sscore三个方面。本发明首次提出了一个多维度分析框架，基于多水平的结构分析和序列分析，利用无监督学习、模式序列搜索、结构模拟等技术手段，对核酸适体序列进行多维度评估,从而识别具有靶标结合能力的核酸适体。本算法具有高效处理高通量数据、全面识别高性能核酸适体的能力。
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公开(公告)号：CN108753904B
公开(公告)日：2022-01-04
申请号：CN201810585542.8
申请日：2018-06-08
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院
IPC: C12Q1/04
Abstract: 本发明涉及一种移植入消化道的细菌的活性评价方法，其包括，将移植前的植入菌带有A基团标记物；移植入消化道内一段时间之后，利用带有B基团的标记物体内代谢标记处理接受植入菌后的受体肠道菌群，以检测菌群同时带有A基团标记和B基团标记的细菌，和仅带有A基团标记和B基团标记的其中一个的细菌。
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