基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法

    公开(公告)号:CN114854839A

    公开(公告)日:2022-08-05

    申请号:CN202210367674.X

    申请日:2022-04-08

    Abstract: 本发明公开了基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法,该方法包括通过多轮DNA连接反应对组织细胞中的DNA、RNA、蛋白质、染色质以及糖类等分析物进行XYZ三维空间编码,再通过测序技术解析相应的空间位置和生物学信息,进而实现组织的三维空间组学分析。本发明基于三坐标空间定位的组织三维空间组学方法具有操作方便、技术门槛低、成本低廉等优点,能够获取完整组织异质细胞的三维空间分布及相应的生物学信息表达,广泛应用于神经科学、病理学、组织发育等方向的研究。

    一种基于分子印章的空间组学方法及其应用研究

    公开(公告)号:CN118360374A

    公开(公告)日:2024-07-19

    申请号:CN202410460234.8

    申请日:2024-04-17

    Abstract: 本发明属于空间组学技术领域,涉及一种基于分子印章的空间组学研究方法,具体地,涉及一种基于DNA条形码的分子印章、基于分子印章的细胞空间定位方法、细胞核空间定位方法及其空间组学测序应用。基于DNA条形码分子印章的制备方法包括:DNA条形码加入水凝胶中,利用水凝胶的可逆性制备分子印章;通过物理或化学方法刺激,释放水凝胶中的DNA条形码,对待测组织切片进行空间编码;将被标记的组织解离成单细胞悬浮液或单细胞核悬浮液;对单细胞/单细胞核进行测序,以确定细胞空间位置和基因表达信息。本发明的细胞空间定位方法及空间组学测序方法,具有操作简单、成本低廉、分辨率高、扩展性强等优点,应用范围广泛。

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