公开(公告)号：CN108753571A

公开(公告)日：2018-11-06

申请号：CN201810544015.2

申请日：2018-05-30

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 宋彦龄 ,  杨朝勇 ,  施远志 ,  黄梦娇

IPC: C12M1/00 ,  C12N5/09 ,  C12N5/073

CPC classification number: C12M23/16 ,  C12N5/0603 ,  C12N5/0694

Abstract: 本发明提供了一种细胞分型捕获芯片和方法。所述的细胞分型捕获芯片，其特征在于，包括芯片基体，芯片基体设有进样孔、出样孔以及形成于进样孔和出样孔之间的流道，所述流道内设有微柱阵列，所述的微柱阵列在不同区域修饰标记有不同亲和力特异性识别分子的纳米结构，所述特异性识别分子包括抗体、核酸适体、多肽以及配体中的至少一种；所述修饰特异性识别分子的纳米结构同靶标细胞具有不同的亲和能力，因此能够实现不同类型靶细胞在不同区域的识别和富集。

公开(公告)号：CN110592093A

公开(公告)日：2019-12-20

申请号：CN201910850939.X

申请日：2019-09-10

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 杨朝勇 ,  宋彦龄 ,  宋佳 ,  郑媛

IPC: C12N15/115 ,  C12N5/09 ,  G16B40/00 ,  G16B40/30 ,  G01N33/68 ,  G01N33/574

Abstract: 本发明提供了一种能够识别EpCAM蛋白的核酸适体，其特征在于，其为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11中任一序列所示的DNA片段。本发明通过多维度分析框架筛选得到的能够识别EpCAM蛋白的核酸适体具有比蛋白抗体更高的亲和力与特异性，将成为EpCAM检测的有力工具，在肿瘤早期诊断、循环肿瘤细胞捕获等领域具有良好的应用前景。

公开(公告)号：CN110600080A

公开(公告)日：2019-12-20

申请号：CN201910850896.5

申请日：2019-09-10

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 杨朝勇 ,  宋彦龄 ,  宋佳 ,  郑媛

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明提供了一种基于多维度分析框架的功能核酸全面识别方法，包括：基于核酸文库测序数据，利用多维度分析框架对功能核酸进行筛选；所述多维度分析框架包括：结构域/模式序列含量Kscore、核酸家族富集程度Fscore与结构稳定性Sscore三个方面。本发明首次提出了一个多维度分析框架，基于多水平的结构分析和序列分析，利用无监督学习、模式序列搜索、结构模拟等技术手段，对核酸适体序列进行多维度评估,从而识别具有靶标结合能力的核酸适体。本算法具有高效处理高通量数据、全面识别高性能核酸适体的能力。

公开(公告)号：CN110592093B

公开(公告)日：2023-08-25

申请号：CN201910850939.X

申请日：2019-09-10

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 杨朝勇 ,  宋彦龄 ,  宋佳 ,  郑媛

IPC: C12N15/115 ,  C12N5/09 ,  G16B40/00 ,  G16B40/30 ,  G01N33/68 ,  G01N33/574

Abstract: 本发明提供了一种能够识别EpCAM蛋白的核酸适体，其特征在于，其为SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11中任一序列所示的DNA片段。本发明通过多维度分析框架筛选得到的能够识别EpCAM蛋白的核酸适体具有比蛋白抗体更高的亲和力与特异性，将成为EpCAM检测的有力工具，在肿瘤早期诊断、循环肿瘤细胞捕获等领域具有良好的应用前景。

公开(公告)号：CN110600080B

公开(公告)日：2023-04-18

申请号：CN201910850896.5

申请日：2019-09-10

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 杨朝勇 ,  宋彦龄 ,  宋佳 ,  郑媛

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明提供了一种基于多维度分析框架的功能核酸全面识别方法，包括：基于核酸文库测序数据，利用多维度分析框架对功能核酸进行筛选；所述多维度分析框架包括：结构域/模式序列含量Kscore、核酸家族富集程度Fscore与结构稳定性Sscore三个方面。本发明首次提出了一个多维度分析框架，基于多水平的结构分析和序列分析，利用无监督学习、模式序列搜索、结构模拟等技术手段，对核酸适体序列进行多维度评估,从而识别具有靶标结合能力的核酸适体。本算法具有高效处理高通量数据、全面识别高性能核酸适体的能力。

公开(公告)号：CN111235103A

公开(公告)日：2020-06-05

申请号：CN202010083726.1

申请日：2020-02-10

Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院

Inventor： 杨朝勇 ,  吴玲玲 ,  宋彦龄

IPC: C12N5/078 ,  C12N5/09 ,  B01J13/04 ,  C12M1/00 ,  B01L3/00

Abstract: 本发明公开了一种用于细胞捕获的流动识别纳米囊泡，其特征在于，包括由天然细胞膜或仿生膜包绕形成的球体结构，所述膜的膜界面上通过物理、化学或生物作用修饰有特异性识别分子。本发明还提供了使用该纳米囊泡捕获循环肿瘤细胞的方法。另一方面，本发明提供了一种微流控芯片，其修饰有本发明的纳米囊泡，此外本发明还提供了使用上述微流控芯片捕获循环肿瘤细胞的方法。使用本发明的流动性增强的多价策略，可实现循环肿瘤细胞的高效、选择性、温和捕获。