本发明实施例提供一种燃料电池控制方法、装置及存储介质，该方法包括：接收车载终端发送的启动信号；根据所述启动信号确定远程启动判别信号的接收情况；若根据所述远程启动判别信号的接收情况确定满足远程启动条件，则控制燃料电池进入远程启动模式，以控制燃料电池启动并为动力电池充电。用户可在有用车需求时，通过远程启动方式，向车载终端发送启动请求，进而车载终端通过整车控制装置控制SOFC启动，以保证车辆在进入正常驱动模式前，SOFC已经成功启动或者已经完成对动力电池充电，从而保证车辆在进入正常驱动模式后，SOFC能够与动力电池共同为车辆驱动中提供能量需求供给，提升电动汽车的续航能力。