公开(公告)号：CN115101142A

公开(公告)日：2022-09-23

申请号：CN202210632799.0

申请日：2022-06-07

Applicant: 鹏城实验室

Inventor： 田永鸿 ,  杨文明 ,  王天誉 ,  陈杰

IPC: G16C20/30 ,  G16C20/50 ,  G16C20/90 ,  G16B30/00 ,  G16B50/00 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了一种药物‑靶点交互作用预测方法、系统及终端设备，方法包括步骤：将药物SMILES字符串建模为分子图，并使用GNN图神经网络提取所述分子图的药物特征信息；使用分级Transformer网络对靶点氨基酸序列进行靶点特征信息提取；将药物特征信息和靶点特征信息连接起来送入全连接层，进行药物‑靶点交互作用预测输出。本发明基于GNN和分级Transformer网络进行DTI预测，结合两种网络各自的特点，并且对原始的transformer网络进行了改进，大大提升了预测准确度和预测性能。