一种SDS脱细胞溶液及其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用

    公开(公告)号:CN115453021B

    公开(公告)日:2023-11-14

    申请号:CN202210972568.4

    申请日:2022-08-15

    Inventor: 陈巍 尤红 张文

    Abstract: 本发明公开一种SDS脱细胞溶液及其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用。首先公开了一种SDS脱细胞溶液,由溶剂PBS溶液和溶质0.5M NaCl、1.5%SDS、0.1%Triton X‑100、0.1%Tween 20和1mM蛋白酶抑制剂混合物组成。进一步公开了其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用。本发明脱细胞方法在SDS法脱细胞前,增加了冷冻/解冻三次循环以及针尖扎眼等步骤,另外利用优化的SDS脱细胞溶液,适用于小鼠整体器官或组织或小块组织的脱细胞,操作简便,且经济成本较低,脱细胞效果显著,最大限度提高了ECM组分的纯度,以后续蛋白质谱鉴定ECM不可溶组分。

    检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用

    公开(公告)号:CN116064765B

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202210918879.2

    申请日:2022-08-02

    Abstract: 本发明公开检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用。本发明公开了检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用,所述LOXL1基因突变为LOXL1基因第一外显子从起始密码子ATG开始的第458位的核苷酸由G突变为A的杂合突变。本发明首次发现LOXL1基因458G>GA杂合突变与肝纤维化患者治疗后的肝纤维化不易逆转显著相关,基于该发现可快速对肝纤维化初治患者进行分子分型,以预判治疗后效果,有利于临床诊治过程中对肝纤维化患者更好地监督管理,适用于大样本肝纤维化患者分子分型的快速诊断筛查。

    检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用

    公开(公告)号:CN116064765A

    公开(公告)日:2023-05-05

    申请号:CN202210918879.2

    申请日:2022-08-02

    Abstract: 本发明公开检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用。本发明公开了检测LOXL1基因突变的物质在制备肝纤维化患者分子分型的产品中的应用,所述LOXL1基因突变为LOXL1基因第一外显子从起始密码子ATG开始的第458位的核苷酸由G突变为A的杂合突变。本发明首次发现LOXL1基因458G>GA杂合突变与肝纤维化患者治疗后的肝纤维化不易逆转显著相关,基于该发现可快速对肝纤维化初治患者进行分子分型,以预判治疗后效果,有利于临床诊治过程中对肝纤维化患者更好地监督管理,适用于大样本肝纤维化患者分子分型的快速诊断筛查。

    一种肝纤维化分子分型系统
    4.
    发明公开

    公开(公告)号:CN115662622A

    公开(公告)日:2023-01-31

    申请号:CN202211445532.7

    申请日:2022-11-18

    Abstract: 本发明实施例公开一种肝纤维化分子分型系统,所述分子分型系统包括:特异基因集获取模块,用于从公共数据库中肝纤维化相关的转录组基因表达谱中筛选出不受病因扰动的肝纤维化细胞外基质组基因获得特异基因集;肝纤维化患者分子分型模块,用于基于所述特异基因集的整体表达水平,使用非监督的分层聚类法将待分类的肝纤维化患者分子分型为不同的风险等级。本方案基于大样本、多病因、相对独立的多个临床样本队列筛选出不受病因扰动的肝纤维化细胞外基质组基因,通过分层聚类法进行肝纤维化患者的分子分型,无需人为评价,具有较高的客观性。

    一种SDS脱细胞溶液及其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用

    公开(公告)号:CN115453021A

    公开(公告)日:2022-12-09

    申请号:CN202210972568.4

    申请日:2022-08-15

    Inventor: 陈巍 尤红 张文

    Abstract: 本发明公开一种SDS脱细胞溶液及其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用。首先公开了一种SDS脱细胞溶液,由溶剂PBS溶液和溶质0.5M NaCl、1.5%SDS、0.1%Triton X‑100、0.1%Tween 20和1mM蛋白酶抑制剂混合物组成。进一步公开了其在脱细胞处理或细胞外基质不可溶组分鉴定中的应用。本发明脱细胞方法在SDS法脱细胞前,增加了冷冻/解冻三次循环以及针尖扎眼等步骤,另外利用优化的SDS脱细胞溶液,适用于小鼠整体器官或组织或小块组织的脱细胞,操作简便,且经济成本较低,脱细胞效果显著,最大限度提高了ECM组分的纯度,以后续蛋白质谱鉴定ECM不可溶组分。

    一种用于评估肝纤维化病因控制预后的基因标志物组合及其应用

    公开(公告)号:CN117402959A

    公开(公告)日:2024-01-16

    申请号:CN202311404053.5

    申请日:2023-10-26

    Abstract: 本发明公开一种用于评估肝纤维化病因控制预后的基因标志物组合及其应用。本发明首先公开了用于评估肝纤维化病因控制预后的基因标志物组合,包括BUB1B、CDC45、CDT1、CHEK1、CLSPN、DEPDC1、E2F8、ECT2、KIF11、KIF18A、KIF4A、KIFC1、MKI67、ORC6、PARPBP、PBK、RRM2和TOP2A。进一步公开了上述基因标志物组合的表达水平的检测试剂在制备评估肝纤维化病因控制预后的试剂盒中的应用。本发明基因标志物组合的表达水平差异可用于预测初治患者在长期病因控制预后肝纤维化的逆转情况,进而对患者进行更好的临床诊治和监督管理,以期为更多的患者带来临床获益。

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