一种基因组DNA提取方法

    公开(公告)号:CN102382821B

    公开(公告)日:2016-02-10

    申请号:CN201110368801.X

    申请日:2011-11-18

    Inventor: 向浏欣 蔡应繁

    Abstract: 本发明涉及一种基因组DNA提取方法,包括DNA分离、DNA析出、DNA洗涤干燥和DNA溶解保存,所述DNA分离得到的DNA水溶液平均分装到1.5-5ml小离心管中;所述DNA溶解保存前对所述小离心管中DNA进行质量预测。本发明通过分装得到多份少量DNA,则DNA溶解保存时增加了DNA与溶剂的总的接触面积,在不影响DNA长度的前提下即可使提取的DNA快速充分溶解;所述DNA溶解保存前对平均分装的小离心管中DNA进行质量预测,通过质量预测可以控制DNA的浓度达后续实验要求。

    基于相似基因比例的基因家族关系判定方法

    公开(公告)号:CN106980777B

    公开(公告)日:2019-12-31

    申请号:CN201710229350.9

    申请日:2017-04-10

    Abstract: 本发明公开了一种基于相似基因比例的基因家族关系判定方法,包括确定一个基因家族为指定基因家族,计算两个考察物种谁与参考物的指定基因家族亲缘关系更近,计算方法为将参考物种指定基因家族的基因分别与两个考察物种指定基因家族的基因进行两两序列比对,分别获取多个阈值条件下的参考物种的考察物种非冗余基因比例,确定相同阈值条件下参考物种的考察物种非冗余基因比例间的差值的绝对值最大且非冗余基因比例较大的考察物种为与参考物种指定基因家族关系更密切,可认为该考察物种与参考物种具有更相似的相应形态发育特征而应用于优势物种或目的物种的筛选,还可反映不同物种间基因家族的进化关系。

    一种基因内含子进化重构装置及方法

    公开(公告)号:CN102542178B

    公开(公告)日:2015-01-14

    申请号:CN201110459713.0

    申请日:2011-12-31

    Inventor: 向浏欣 蔡应繁

    Abstract: 本发明涉及一种基因内含子进化重构装置及方法,所述装置包括同源基因数据获取单元,用于获取同源基因数据;内含子位点判断单元,用于对获取的同源基因数据进行判断是否有内含子位点数据;内含子位点标定单元,用于对同源基因数据标定内含子位点;系统进化树构建单元,用于对带有内含子位点的同源基因数据集构建系统进化树;内含子进化重构单元,用于对构建的系统进化树根据最大简约法重构内含子进化;本发明在系统进化树的基础上重构内含子进化,客观地描述内含子进化历程,是后续内含子功能研究的基础,本发明对进化树的数量和每棵进化树的同源基因的数量没有限制,对同源基因内含子的任何存在形式都可以重构,具有广泛性应用前景。

    棉花Ghexp基因及其应用
    6.
    发明公开

    公开(公告)号:CN102925452A

    公开(公告)日:2013-02-13

    申请号:CN201210099099.6

    申请日:2012-04-06

    Abstract: 本发明属于生物工程技术领域,具体涉及棉花膨胀素基因Ghexp及其在转基因植物培育中的应用。棉花膨胀素基因Ghexp核苷酸序列为SEQIDNo1。本发明的有益效果在于,克隆了棉花膨胀素基因Ghexp,并通过根癌脓杆菌介导的方法将该基因转入拟南芥,与野生型拟南芥植株相比,本发明的Ghexp基因的转基因可明显促进拟南芥植株的叶片、茎干的腺毛增多及增长,同时增加叶片的气孔密度。根据本发明,可利用基因工程方法培育转Ghexp基因植物,增加有关植株表皮毛数目,增加叶片的气孔密度,从而增加植株的次生代谢产物含量或阻碍草食动物的侵害,还可以提高植株对不良环境的适应性。

    一种基因组DNA提取方法

    公开(公告)号:CN102382821A

    公开(公告)日:2012-03-21

    申请号:CN201110368801.X

    申请日:2011-11-18

    Inventor: 向浏欣 蔡应繁

    Abstract: 本发明涉及一种基因组DNA提取方法,包括DNA分离、DNA析出、DNA洗涤干燥和DNA溶解保存,所述DNA分离得到的DNA水溶液平均分装到1.5-5ml小离心管中;所述DNA溶解保存前对所述小离心管中DNA进行质量预测。本发明通过分装得到多份少量DNA,则DNA溶解保存时增加了DNA与溶剂的总的接触面积,在不影响DNA长度的前提下即可使提取的DNA快速充分溶解;所述DNA溶解保存前对平均分装的小离心管中DNA进行质量预测,通过质量预测可以控制DNA的浓度达后续实验要求。

    一种物种间基因家族亲缘关系计算方法

    公开(公告)号:CN106980776B

    公开(公告)日:2019-05-24

    申请号:CN201710229007.4

    申请日:2017-04-10

    Abstract: 本发明公开了一种物种间基因家族亲缘关系计算方法,包括确定一个基因家族为指定基因家族,计算两个考察物种谁与参考物的指定基因家族亲缘关系更近,计算方法为将参考物种指定基因家族的基因分别与两个考察物种指定基因家族的基因进行两两序列比对,分别获取多个阈值条件下的考察物种的参考物种非冗余基因数量,确定相同阈值条件下考察物种间的参考物种非冗余基因数量的差值的绝对值最大且参考物种非冗余基因数量较多所对应的考察物种为与参考物种指定基因家族亲缘关系更近,可认为该考察物种与参考物种具有更相似的相应形态发育特征,而应用于优势物种或目的物种的筛选,还可反映不同物种间基因家族的进化关系。

    基于相似基因比例的基因家族关系判定方法

    公开(公告)号:CN106980777A

    公开(公告)日:2017-07-25

    申请号:CN201710229350.9

    申请日:2017-04-10

    Abstract: 本发明公开了一种基于相似基因比例的基因家族关系判定方法,包括确定一个基因家族为指定基因家族,计算两个考察物种谁与参考物的指定基因家族亲缘关系更近,计算方法为将参考物种指定基因家族的基因分别与两个考察物种指定基因家族的基因进行两两序列比对,分别获取多个阈值条件下的参考物种的考察物种非冗余基因比例,确定相同阈值条件下参考物种的考察物种非冗余基因比例间的差值的绝对值最大且非冗余基因比例较大的考察物种为与参考物种指定基因家族关系更密切,可认为该考察物种与参考物种具有更相似的相应形态发育特征而应用于优势物种或目的物种的筛选,还可反映不同物种间基因家族的进化关系。

    一种物种间基因家族亲缘关系计算方法

    公开(公告)号:CN106980776A

    公开(公告)日:2017-07-25

    申请号:CN201710229007.4

    申请日:2017-04-10

    CPC classification number: G16B30/00

    Abstract: 本发明公开了一种物种间基因家族亲缘关系计算方法,包括确定一个基因家族为指定基因家族,计算两个考察物种谁与参考物的指定基因家族亲缘关系更近,计算方法为将参考物种指定基因家族的基因分别与两个考察物种指定基因家族的基因进行两两序列比对,分别获取多个阈值条件下的考察物种的参考物种非冗余基因数量,确定相同阈值条件下考察物种间的参考物种非冗余基因数量的差值的绝对值最大且参考物种非冗余基因数量较多所对应的考察物种为与参考物种指定基因家族亲缘关系更近,可认为该考察物种与参考物种具有更相似的相应形态发育特征,而应用于优势物种或目的物种的筛选,还可反映不同物种间基因家族的进化关系。

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