一种基于对比学习的药物靶标智能推荐方法

    公开(公告)号:CN119601077A

    公开(公告)日:2025-03-11

    申请号:CN202411664907.8

    申请日:2024-11-20

    Abstract: 本发明属于计算生物学,具体涉及一种基于对比学习的药物靶标智能推荐方法;该方法包括:获取药物和靶标信息,包括药物的SMILES序列和靶标蛋白的氨基酸序列;使用药物编码器和靶标蛋白编码器得到药物和靶标蛋白的表征信息;设计自适应注意力机制,通过不同的掩码方法实现药物靶标表征向量与可学习的查询向量之间的交互,利用对比学习对齐药物表征空间和靶标蛋白表征空间;根据交互后得到的查询向量得到药物靶标之间的匹配的概率;选取概率大于阈值的药物靶标推荐给用户;本发明预测结果准确率高,有助于减少生物医学研究者挖掘药物靶标反应对的时间,减轻研究负担。

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