一种小RNA测序数据表达量计算方法

    公开(公告)号:CN108154009A

    公开(公告)日:2018-06-12

    申请号:CN201711439911.4

    申请日:2017-12-26

    Inventor: 李婷

    CPC classification number: G16B25/00

    Abstract: 本发明公开了一种小RNA测序数据表达量计算方法,包括:获取原始测序数据,对所述获得的原始数据进行质量控制序列提取,对所述质量控制序列提取后的数据进行去除接头处理,对所述除接头后的数据进行有效序列提取,对所述提取的有效序列有效处理,统计不同序列在不同样本中的表达量。该方法能准确快速的计算RNA测序数据的表达量。

    一种基因组数据的网页展示方法

    公开(公告)号:CN108038353A

    公开(公告)日:2018-05-15

    申请号:CN201711433665.1

    申请日:2017-12-26

    Inventor: 李婷

    Abstract: 本发明公开了一种基因组数据的网页展示方法,首先将Apache作为服务器软件并利用数据库管理系统存储基因组数据;其次通过perl语言接收用户的访问请求并从所述数据库管理系统中完成对所述基因组数据的查询;最后调javascript将所述基因组数据的查询结果在网页上进行图形化的展示。本申请公开的上述技术方案,使得基因组数据的信息变得更加形象化,把艰涩难懂的生物学问题变成了一个直观的图形,从而使得研究人员可以从容的分析自己的基因组数据,更加深入的从遗传物质入手,更好地理解项目,实现基因组的可视化。

    一种预测阿德福韦酯治疗反应性建模的方法及装置

    公开(公告)号:CN106701745A

    公开(公告)日:2017-05-24

    申请号:CN201710109291.1

    申请日:2017-02-27

    Inventor: 何苗 杨德英 李婷

    CPC classification number: C12Q1/6806 C12Q1/6869 C12Q2531/113 C12Q2537/165

    Abstract: 本发明公开了一种预测阿德福韦酯治疗反应性建模的方法及装置,其中,该方法包括:处理采集得到的HBV慢性感染病人的血清样本,获取所述样本的RT区基因序列信息;基于所述样本的RT区基因序列信息,建立初步的预测模型,并采用交叉验证的方法筛选出最优模型作为预测模型;通过采集到的进行ADV治疗的病人的血清样本,对所述预测模型进行验证。在本发明中选用NAs中的ADV,建立了基于RT区序列的预测模型,获取了ADV反应性的相关位点,并进行了模型的验证,提高了模型的准确性,实现了通过建立一种准确的预测模型,来对ADV治疗反应性进行预测的目的。

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