与脂肪酶靶向结合的肽配基序列及其应用

    公开(公告)号:CN106518969A

    公开(公告)日:2017-03-22

    申请号:CN201611004667.4

    申请日:2016-11-15

    CPC classification number: C07K7/06 G01N33/573 G01N33/68 G01N2333/92

    Abstract: 本发明涉及与脂肪酶靶向结合的肽配基序列及其应用,属于多肽设计及病毒抗原检测领域。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术,在脂肪酶晶体结构的基础上,通过分子对接技术,搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的肽配基,最终得到可与脂肪酶结合的肽配基,其肽配基序列为RRRDCW,即P19。人工合成P19,并与脂肪酶进行亲和力鉴定,P19序列与人工表达的脂肪酶之间相互作用的平衡解离常数KD为3.653×10-8M,即36.53nM,说明亲和力较好。本发明设计而成的P19序列与人工表达蛋白、人工纯化蛋白均可以结合,除与脂肪酶反应性较高外,与其它蛋白均不发生交叉性反应,特异性较好。

    可与甲胎蛋白特异结合的多肽序列及其应用

    公开(公告)号:CN106518970B

    公开(公告)日:2019-03-15

    申请号:CN201611004950.7

    申请日:2016-11-15

    Abstract: 本发明涉及一条可与甲胎蛋白特异结合的多肽序列及其应用,属于多肽设计及病毒抗原检测领域。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术,在甲胎蛋白晶体结构的基础上,通过分子对接技术,搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的多肽配体,最终得到可与甲胎蛋白特异结合的多肽序列,其多肽序列为WYRVGY,即P217。人工合成P217,并与甲胎蛋白进行亲和力鉴定,P217序列与人工表达的甲胎蛋白之间相互作用的平衡解离常数KD为1.47×10‑9M,即1.47nM,说明亲和力较好。本发明设计而成的P217序列与人工表达蛋白、人工纯化蛋白均可以结合,除与甲胎蛋白反应性较高外,与其它蛋白均不发生交叉性反应,特异性较好。

    丙型肝炎病毒NS5BRNA聚合酶抑制多肽序列及其用途

    公开(公告)号:CN104530189A

    公开(公告)日:2015-04-22

    申请号:CN201410775233.9

    申请日:2014-12-16

    Abstract: 本发明设计了一系列不同长度的多肽组合库,利用分子对接软件,将多肽与HCV NS5B RNA聚合酶上特定的抑制性位点进行分子对接,对结果进行综合分析,筛选出具有抑制HCV NS5B RNA聚合酶活性的多肽,为进一步研发抗HCV药物奠定基础。修饰多肽与NS5B表达蛋白的结合实验结果表明:设计的多肽能与表达蛋白结合,表达融合蛋白测定结果和虚拟对接结果之间有相关性,本发明多肽可以用来对HCV NS5B蛋白进行检测,利用HCV NS5B RNA聚合酶体外活性鉴定体系进行多肽抑制筛选的结果表明,本发明的多肽对HCV NS5B蛋白的聚合酶活性均有显著抑制作用,其IC50可达9.85μM,可作为HCV抑制的潜在药物。

    与脂肪酶靶向结合的肽配基序列及其应用

    公开(公告)号:CN106518969B

    公开(公告)日:2019-03-15

    申请号:CN201611004667.4

    申请日:2016-11-15

    Abstract: 本发明涉及与脂肪酶靶向结合的肽配基序列及其应用,属于多肽设计及病毒抗原检测领域。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术,在脂肪酶晶体结构的基础上,通过分子对接技术,搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的肽配基,最终得到可与脂肪酶结合的肽配基,其肽配基序列为RRRDCW,即P19。人工合成P19,并与脂肪酶进行亲和力鉴定,P19序列与人工表达的脂肪酶之间相互作用的平衡解离常数KD为3.653×10‑8M,即36.53nM,说明亲和力较好。本发明设计而成的P19序列与人工表达蛋白、人工纯化蛋白均可以结合,除与脂肪酶反应性较高外,与其它蛋白均不发生交叉性反应,特异性较好。

    丙型肝炎病毒NS5B RNA聚合酶抑制多肽序列及其用途

    公开(公告)号:CN104530189B

    公开(公告)日:2017-11-14

    申请号:CN201410775233.9

    申请日:2014-12-16

    Abstract: 本发明设计了一系列不同长度的多肽组合库,利用分子对接软件,将多肽与HCV NS5B RNA聚合酶上特定的抑制性位点进行分子对接,对结果进行综合分析,筛选出具有抑制HCV NS5B RNA聚合酶活性的多肽,为进一步研发抗HCV药物奠定基础。修饰多肽与NS5B表达蛋白的结合实验结果表明:设计的多肽能与表达蛋白结合,表达融合蛋白测定结果和虚拟对接结果之间有相关性,本发明多肽可以用来对HCV NS5B蛋白进行检测,利用HCV NS5B RNA聚合酶体外活性鉴定体系进行多肽抑制筛选的结果表明,本发明的多肽对HCV NS5B蛋白的聚合酶活性均有显著抑制作用,其IC50可达9.85μM,可作为HCV抑制的潜在药物。

    可与甲胎蛋白特异结合的多肽序列及其应用

    公开(公告)号:CN106518970A

    公开(公告)日:2017-03-22

    申请号:CN201611004950.7

    申请日:2016-11-15

    CPC classification number: C07K7/06 G01N33/53 G01N33/68 G01N33/689 G01N2333/471

    Abstract: 本发明涉及一条可与甲胎蛋白特异结合的多肽序列及其应用,属于多肽设计及病毒抗原检测领域。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术,在甲胎蛋白晶体结构的基础上,通过分子对接技术,搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的多肽配体,最终得到可与甲胎蛋白特异结合的多肽序列,其多肽序列为WYRVGY,即P217。人工合成P217,并与甲胎蛋白进行亲和力鉴定,P217序列与人工表达的甲胎蛋白之间相互作用的平衡解离常数KD为1.47×10-9M,即1.47nM,说明亲和力较好。本发明设计而成的P217序列与人工表达蛋白、人工纯化蛋白均可以结合,除与甲胎蛋白反应性较高外,与其它蛋白均不发生交叉性反应,特异性较好。

    一条可与淀粉酶结合的多肽序列及其应用

    公开(公告)号:CN106432421A

    公开(公告)日:2017-02-22

    申请号:CN201611004671.0

    申请日:2016-11-15

    CPC classification number: C07K7/06 G01N33/573 G01N33/68 G01N2333/928

    Abstract: 本发明涉及一条可与淀粉酶结合的多肽序列及其应用,属于多肽设计及病毒抗原检测领域。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术,在淀粉酶晶体结构的基础上,通过分子对接技术,搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的多肽配体,最终得到可与淀粉酶结合的多肽序列,其多肽序列为HHWYIR,即P615。人工合成P615,并与淀粉酶进行亲和力鉴定,P615序列与人工表达的淀粉酶之间相互作用的平衡解离常数KD为4.94×10-8M,即49.4nM,说明亲和力较好。本发明设计而成的P615序列与人工表达蛋白、人工纯化蛋白均可以结合,除与淀粉酶反应性较高外,与其它蛋白均不发生交叉性反应,特异性较好。

    一条可与淀粉酶结合的多肽序列及其应用

    公开(公告)号:CN106432421B

    公开(公告)日:2019-03-15

    申请号:CN201611004671.0

    申请日:2016-11-15

    Abstract: 本发明涉及一条可与淀粉酶结合的多肽序列及其应用,属于多肽设计及病毒抗原检测领域。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术,在淀粉酶晶体结构的基础上,通过分子对接技术,搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的多肽配体,最终得到可与淀粉酶结合的多肽序列,其多肽序列为HHWYIR,即P615。人工合成P615,并与淀粉酶进行亲和力鉴定,P615序列与人工表达的淀粉酶之间相互作用的平衡解离常数KD为4.94×10‑8M,即49.4nM,说明亲和力较好。本发明设计而成的P615序列与人工表达蛋白、人工纯化蛋白均可以结合,除与淀粉酶反应性较高外,与其它蛋白均不发生交叉性反应,特异性较好。

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