公开(公告)号：CN118917072A

公开(公告)日：2024-11-08

申请号：CN202410960379.4

申请日：2024-07-17

Applicant: 西安电子科技大学

Inventor： 刘伟 ,  张琰 ,  高丽华 ,  陶杨 ,  肖雄 ,  刘仲贺

IPC: G06F30/20 ,  G06F17/18 ,  G16C10/00 ,  G06F119/14

Abstract: 本发明提供了一种非共键粒子对近程力的确定方法、系统和设备，应用于分子动力学仿真系统，仿真系统包括：CPU和FPGA模块，FPGA模块包括RL子系统、XDMA模块、HBM模块；充分利用了FPGA中HBM资源带来的高访问带宽和高存储容量的优势，对RL作用力的计算过程进行优化设计，提高了并行算力的流水线数量，适用更大规模数据集的仿真需求。

公开(公告)号：CN118711680A

公开(公告)日：2024-09-27

申请号：CN202410779206.2

申请日：2024-06-17

Applicant: 西安电子科技大学

Inventor： 张琰 ,  刘伟 ,  高丽华 ,  陶杨 ,  肖雄 ,  刘仲贺

IPC: G16C10/00 ,  G16C20/70 ,  G06F17/16 ,  G06F15/78

Abstract: 本发明公开了一种应用于FPGA加速器的PME算法异构计算方法及装置，涉及分子动力学模拟技术领域，解决了现有技术中在使用HBM作为存储器导致的在PME计算过程中数据存取延时长，以及多维FFT计算过程中转置和卷积单独处理导致的存储资源占用多、计算时间长的问题，该方法包括：利用B样条插值将电荷插值至快速傅里叶变换网格，得到静电势能矩阵和系数矩阵；对静电势能矩阵和系数矩阵进行计算，得到静电力矩阵；对静电力矩阵进行B样条插值，得到各个原子的受力情况分析结果；实现了将PME算法卸载到FPGA中，以此提升PME算法的计算速度。