公开(公告)号：CN119144723A

公开(公告)日：2024-12-17

申请号：CN202411540176.6

申请日：2024-10-31

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院

Inventor： 朱峰 ,  刘睿娜 ,  张玉丹 ,  王艺扬 ,  李春娥 ,  马现仓

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/689 ,  G16H50/30 ,  G16B40/00 ,  G16B5/00

Abstract: 本发明公开了一种结直肠癌肠道微生物标志物及其应用与构建结直肠癌检测模型的方法，属于生物医学技术领域，本发明从宏基因组数据中提取与结直肠癌发病机制和进程相关的生物标志物，构建随机森林模型，并进行评估得到结直肠癌检测模型，将待测患者的宏基因组及其丰度信息输入结直肠癌检测模型进行识别，增加了结直肠癌检测模型的泛化能力和抗过拟合性，能够更准确地预测和评估结直肠癌的病情，有助于医生制定更有效的治疗方案，提高患者的生存率和生活质量；还具有非侵入性、操作简便等优点，能够为结直肠癌的诊断提供新的途径，筛选出的微生物标志物和构建的结直肠癌检测模型具有较高的准确性和特异性，有助于提高结直肠癌的诊断效率。

公开(公告)号：CN119446258A

公开(公告)日：2025-02-14

申请号：CN202411505280.1

申请日：2024-10-25

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院

Inventor： 朱峰 ,  李春娥 ,  张玉丹 ,  刘睿娜 ,  王艺扬 ,  马现仓

IPC: G16B20/30 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明公开了跨队列多界抑郁症诊断标志物筛选方法、系统及存储介质，涉及生化检测技术领域，所述方法包括：构建多界微生物数据库，所述多界微生物数据库包括细菌、真菌、病毒和古生菌；基于所述多界微生物数据库对跨队列患者和健康对照的粪便进行宏基因组测序，得到跨队列的物种注释丰度表；利用MMUPHin对所述跨队列的物种注释丰度表进行微生物差异丰度分析，得到差异物种表；对所述差异物种表利用Python中的Boruta算法进行特征选择，得到差异特征；基于所述差异特征构建预测模型，并利用所述预测模型进行诊断标志物筛选。本发明结合跨队列多界微生物的抑郁症诊断标志物组合，可为抑郁症的诊断提供更全面的信息，进而提高诊断的准确性和可靠性。

公开(公告)号：CN118629510A

公开(公告)日：2024-09-10

申请号：CN202410712154.7

申请日：2024-06-03

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院

Inventor： 朱峰 ,  张玉丹 ,  李春娥 ,  王艺扬 ,  马现仓

IPC: G16B40/00 ,  G16B50/10

Abstract: 本发明公开了一种多界精神分裂症诊断标志物筛选方法、系统及存储介质，涉及生化检测技术领域。具体步骤为：构建多界微生物数据库，所述多界微生物包括细菌、真菌、病毒和古生菌；基于所述多界微生物数据库对患者和健康对照的粪便进行宏基因组测序，得到物种注释丰度表；利用MaAsLin 2对所述物种注释丰度表进行微生物差异丰度分析，得到差异表；对所述差异表利用R语言中的Boruta算法进行特征选择，得到第一特征；通过所述第一特征构建预测模型，利用所述预测模型进行诊断标志物筛选。本发明结合多界微生物的精神分裂症诊断标志物组合，为精神分裂症的诊断提供更全面的信息，进而提高诊断的准确性和可靠性。

公开(公告)号：CN117577172A

公开(公告)日：2024-02-20

申请号：CN202311517725.3

申请日：2023-11-15

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院 ,  西安菌佑医疗科技发展有限公司

Inventor： 朱峰 ,  张玉丹 ,  李春娥 ,  王阳 ,  赵哲 ,  马现仓

IPC: G16B15/30 ,  G16B20/00 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种菌群移植的供受体配型方法，属于生物医疗技术领域。所述方法对供体和受体的粪便进行宏基因组测序以及非靶向代谢组学检测，基于Alpha多样性指数、肠型、丰富和稀有物种、生态位宽度指数、有益菌、耐药基因、宏基因组相关通路、代谢物，计算所述供体和受体之间的相似度和互补度，对其进行标准化加权，得到受体与每个供体之间的匹配度打分，以为受体选择最佳供体；解决了匹配指标单一的问题，可以保证供体菌群与受体菌群之间有一定的相似性，避免因为过于不同而导致排斥或不适应；同时也可以保证供体菌群与受体菌群之间有一定的互补性增强受体肠道微生态功能，在肠道微生态平衡恢复和健康改善领域具有广泛的应用前景。

公开(公告)号：CN119162304A

公开(公告)日：2024-12-20

申请号：CN202411528388.2

申请日：2024-10-30

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院

Inventor： 朱峰 ,  刘睿娜 ,  张玉丹 ,  李春娥 ,  马现仓

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/04 ,  G16B20/00 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明公开了一种克罗恩病肠道微生物标志物及其应用与构建克罗恩病检测模型的方法，属于生物医学技术领域，本发明从克罗恩病患者和健康人群样本的宏基因组数据中，提取与克罗恩病相关的肠道微生物，通过克罗恩病肠道微生物标志物建立诊断克罗恩病的随机森林模型，评估，得到克罗恩病检测模型；本发明提供的方法可以评估治疗效果和及时调整治疗方案，为患者的预后评估提供了新的工具；并通过发现和应用针对克罗恩病的特异性肠道微生物标志物，不仅提高了克罗恩病的早期辅助诊断、预后和治疗的准确性和有效性，还深化了对克罗恩病的理解，推动了微生物组学在临床应用中的发展；有助于发现新的生物标志物，可以发现新的生物标志物或治疗靶点。

公开(公告)号：CN119144715A

公开(公告)日：2024-12-17

申请号：CN202411533261.X

申请日：2024-10-30

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院

Inventor： 朱峰 ,  张玉丹 ,  李春娥 ,  刘睿娜 ,  寻御风 ,  马现仓

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/04 ,  G16B20/00 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明公开了一种非酒精性脂肪肝肠道微生物标志物及其应用与构建非酒精性脂肪肝检测模型的方法，属于生物医学技术领域，本发明从非酒精性脂肪肝患者和健康人群样本的宏基因组数据中，提取与非酒精性脂肪肝相关的肠道微生物，通过非酒精性脂肪肝肠道微生物标志物建立诊断非酒精性脂肪肝的随机森林模型，评估，得到非酒精性脂肪肝检测模型；本发明提供的方法可以更准确地识别出非酒精性脂肪肝患者和健康对照的差异菌，从而提高非酒精性脂肪肝的早期辅助诊断的准确性，还通过ROC曲线和marker菌，不但可以对非酒精性脂肪肝患者进行个性化的治疗，还可以减少昂贵的医疗测试和不必要的医疗干预，从而节省医疗资源。