一种基于RNA序列特异内切扩增的组织原位RNA单分子成像方法

    公开(公告)号:CN116555398A

    公开(公告)日:2023-08-08

    申请号:CN202310523155.2

    申请日:2023-05-10

    Abstract: 本发明公开了一种基于RNA序列特异内切扩增的组织原位RNA单分子成像方法,属于组织原位RNA单分子成像技术领域。该方法利用序列特异的内切酶切断RNA底物,并以切断的RNA为RCA引物,在聚合酶的参与下,目标RNA作为引物,以环形探针为模板发生滚环扩增,实现目标RNA的原位自引发扩增。加入与检出区序列相同的荧光标记探针,可与扩增产物中的检出区特异性杂交,从而实现单分子的荧光成像;无需外加扩增引物,以克服外加引物带来的非特异性杂交扩增产生的背景噪音干扰,从而实现组织原位RNA的超低背景单分子成像。

    基于DNA切刻/聚合链置换循环反应的全基因组自引发扩增方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN114350756A

    公开(公告)日:2022-04-15

    申请号:CN202111389790.3

    申请日:2021-11-22

    Abstract: 本发明公开了基于DNA切刻/聚合链置换循环反应的全基因组自引发扩增方法及试剂盒,属于分子生物学技术领域,先利用切刻酶在基因组相应的酶切位点上进行酶切形成缺口,然后在聚合酶的作用下进行延伸反应同时置换出单链,该过程所形成的双链DNA再次被切刻酶切割,多轮循环后该段基因序列可被线性扩增得到多拷贝的单链片段,从而实现全基因组的放大。因此本发明的基于酶切扩增技术的全基因组扩增方法有望应用于单细胞测序工作,提高疾病的诊断能力。

    一种RNA A-I编辑的酶识别检测方法

    公开(公告)号:CN112063694A

    公开(公告)日:2020-12-11

    申请号:CN202010387469.0

    申请日:2020-05-09

    Abstract: 本发明公开了一种RNA A‑I编辑的酶识别检测方法,属于RNA修饰碱基检测技术领域,包括:设计用于识别的互补或错配探针,以及特异性扩增引物,用设计的识别探针与含有I或者A的RNA进行互补,形成含有缺口的双链结构或者含有突出序列的双链结构;利用连接酶对双链结构进行识别并发生连接反应,或者利用聚合酶识别并发生延伸反应;形成的完整双链结构进行熔解曲线检测测定其Tm值,或者在聚合酶作用下使用扩增引物发生聚合酶链式反应。本方法相较于现有技术的方法可以在保证检测高灵敏度的同时、保证良好的生物兼容性,从而发展出高特异性的RNA A‑I酶识别检测方法。

    一种基于双标记扩增的血浆循环甲基化DNA电化学检测方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN107356642A

    公开(公告)日:2017-11-17

    申请号:CN201710626465.1

    申请日:2017-07-27

    CPC classification number: G01N27/26 G01N27/3275

    Abstract: 本发明公开了一种基于双标记扩增的血浆循环甲基化DNA电化学检测方法,属于甲基化DNA检测技术领域。本发明使用不同标记(地高辛,生物素)的甲基化特异性引物,通过聚合酶链式反应(PCR)鉴别亚硫酸氢盐修饰的基因组样品中的甲基化DNA而不是非甲基化等位基因;利用聚合酶的扩增能力,产生大量具有地高辛和生物素双标记的双链扩增子;通过修饰在金电极表面的地高辛抗体捕获这些双链扩增子;然后通过生物素-亲和素结合作用捕获辣根过氧化物酶缀合的抗生物素蛋白(Avidin-HRP),利用酶的催化过程产生电化学信号。该方法具有良好的灵敏度,能检测5pg的甲基化DNA分子,同时具有良好的特异性,能够在有大量非甲基化DNA干扰下检测出1%的甲基化DNA。

    一种RNA A-I编辑的酶识别检测方法

    公开(公告)号:CN112063694B

    公开(公告)日:2022-08-09

    申请号:CN202010387469.0

    申请日:2020-05-09

    Abstract: 本发明公开了一种RNA A‑I编辑的酶识别检测方法,属于RNA修饰碱基检测技术领域,包括:设计用于识别的互补或错配探针,以及特异性扩增引物,用设计的识别探针与含有I或者A的RNA进行互补,形成含有缺口的双链结构或者含有突出序列的双链结构;利用连接酶对双链结构进行识别并发生连接反应,或者利用聚合酶识别并发生延伸反应;形成的完整双链结构进行熔解曲线检测测定其Tm值,或者在聚合酶作用下使用扩增引物发生聚合酶链式反应。本方法相较于现有技术的方法可以在保证检测高灵敏度的同时、保证良好的生物兼容性,从而发展出高特异性的RNA A‑I酶识别检测方法。

    用于识别目标RNA的环状核酶探针及基于其介导的细胞RNA自引发扩增成像方法

    公开(公告)号:CN114292902A

    公开(公告)日:2022-04-08

    申请号:CN202111408538.2

    申请日:2021-11-24

    Abstract: 本发明公开了一种用于识别目标RNA的环状核酶探针及基于其介导的细胞RNA自引发扩增成像方法,该环状核酶探针包含识别序列、核酶序列及编码序列三种功能区,能够可特异性杂交并切断RNA底物,无需外加扩增引物,而是用目标RNA作为引物原位自引发扩增,以克服外加引物带来的非特异性杂交扩增产生的背景噪音干扰,从而提高成像灵敏度和特异性。本发明基于上述创新设计的环状核酶探针介导的细胞RNA自引发扩增成像方法,可以在保证检测高灵敏度的同时、拥有高的成像信噪比,从而实现细胞内RNA的高效灵敏成像分析。

    一种基于DNA共价交联的质粒组装方法

    公开(公告)号:CN114317520B

    公开(公告)日:2024-10-25

    申请号:CN202111406808.6

    申请日:2021-11-24

    Abstract: 本发明公开了一种基于DNA共价交联的质粒组装方法,本方法巧妙运用交联剂实现来源于质粒的DNA进行链间交联,提高了双链交联引物在变性剂及高温下的抗变性能力。相较于利用未组装的引物通过PCR过程进行组装,经过交联的双链交联引物在PCR过程中展示出更高效高产的组装性能。而将该交联引物运用于质粒的DNA组装中,只需要经过一次普通的PCR反应即能实现,因此该方法简便易行,发展前景好。

    一种基于DNA共价交联的质粒组装方法

    公开(公告)号:CN114317520A

    公开(公告)日:2022-04-12

    申请号:CN202111406808.6

    申请日:2021-11-24

    Abstract: 本发明公开了一种基于DNA共价交联的质粒组装方法,本方法巧妙运用交联剂实现来源于质粒的DNA进行链间交联,提高了双链交联引物在变性剂及高温下的抗变性能力。相较于利用未组装的引物通过PCR过程进行组装,经过交联的双链交联引物在PCR过程中展示出更高效高产的组装性能。而将该交联引物运用于质粒的DNA组装中,只需要经过一次普通的PCR反应即能实现,因此该方法简便易行,发展前景好。

    一种基于双标记扩增的血浆循环甲基化DNA电化学检测方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN107356642B

    公开(公告)日:2019-04-12

    申请号:CN201710626465.1

    申请日:2017-07-27

    Abstract: 本发明公开了一种基于双标记扩增的血浆循环甲基化DNA电化学检测方法,属于甲基化DNA检测技术领域。本发明使用不同标记(地高辛,生物素)的甲基化特异性引物,通过聚合酶链式反应(PCR)鉴别亚硫酸氢盐修饰的基因组样品中的甲基化DNA而不是非甲基化等位基因;利用聚合酶的扩增能力,产生大量具有地高辛和生物素双标记的双链扩增子;通过修饰在金电极表面的地高辛抗体捕获这些双链扩增子;然后通过生物素‑亲和素结合作用捕获辣根过氧化物酶缀合的抗生物素蛋白(Avidin‑HRP),利用酶的催化过程产生电化学信号。该方法具有良好的灵敏度,能检测5pg的甲基化DNA分子,同时具有良好的特异性,能够在有大量非甲基化DNA干扰下检测出1%的甲基化DNA。

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