公开(公告)号：CN109830261A

公开(公告)日：2019-05-31

申请号：CN201910064006.8

申请日：2019-01-23

Applicant: 西南大学

Inventor： 钱伟 ,  崔艺馨 ,  万华方 ,  贺亚军 ,  熊清 ,  丁一娟 ,  梅家琴 ,  刘智 ,  曾晓 ,  廖泾行 ,  索朗贡布

IPC: G16B20/20 ,  G16B30/00 ,  G16B40/10 ,  G01N21/3563 ,  G01N21/359 ,  G01N30/02 ,  G01N33/00 ,  G01N33/48

Abstract: 本发明属于分子育种领域，主要涉及一种筛选数量性状候选基因的方法，该方法是提取数量性状相关区间（QTL区间和GWAS区间）的基因作为“候选基因集”，收集与该性状相关的已知基因作为“诱饵”基因，通过对一组样品的转录组数据进行基因共表达分析或者权重共表达分析，构建共表达网络，从中挑选出跟诱饵基因连通性强的基因即为候选基因。本方法相比以前的分析方法，能快速、有效地筛选数量性状相关区间内的候选基因，缩小了候选基因的筛选范围，同时可以预测基因之间的互作关系，克服了传统精细定位工作量大且繁琐的问题，加速物种分子育种进程。

公开(公告)号：CN109830261B

公开(公告)日：2023-05-05

申请号：CN201910064006.8

申请日：2019-01-23

Applicant: 西南大学

Inventor： 崔艺馨 ,  钱伟 ,  万华方 ,  贺亚军 ,  熊清 ,  丁一娟 ,  梅家琴 ,  刘智 ,  曾晓 ,  廖泾行 ,  索朗贡布

IPC: G16B20/20 ,  G16B30/00 ,  G16B40/10 ,  G01N21/3563 ,  G01N21/359 ,  G01N30/02 ,  G01N33/00 ,  G01N33/48

Abstract: 本发明属于分子育种领域，主要涉及一种筛选数量性状候选基因的方法，该方法是提取数量性状相关区间（QTL区间和GWAS区间）的基因作为“候选基因集”，收集与该性状相关的已知基因作为“诱饵”基因，通过对一组样品的转录组数据进行基因共表达分析或者权重共表达分析，构建共表达网络，从中挑选出跟诱饵基因连通性强的基因即为候选基因。本方法相比以前的分析方法，能快速、有效地筛选数量性状相关区间内的候选基因，缩小了候选基因的筛选范围，同时可以预测基因之间的互作关系，克服了传统精细定位工作量大且繁琐的问题，加速物种分子育种进程。