预测氨基酸变异对蛋白质结构稳定性影响的系统及其方法

    公开(公告)号:CN107358064A

    公开(公告)日:2017-11-17

    申请号:CN201710533801.8

    申请日:2017-07-03

    Applicant: 苏州大学

    CPC classification number: G16B40/00

    Abstract: 本发明公开了一种预测氨基酸变异对蛋白质结构稳定性影响的系统及其方法,该系统由氨基酸变异信息输入模块、氨基酸变异位点属性计算模块、蛋白质序列属性计算模块、预测稳定性变化模块、预测结果输出模块组成;该方法的步骤为录入并获取变异信息;提前约AAindex属性特征以及计算氨基酸微电物理化学属性特征;计算与氨基酸变异对应的蛋白质序列的保守性及其蛋白质属性;采用两层三分随机森林算法计算氨基酸变异对蛋白质稳定性的影响;储存并输出预测结果。本发明可以依据用户提供的氨基酸变异和对应的蛋白质序列,准确预测该氨基酸变异会导致所在蛋白质的结构稳定性升高、降低或不变,以及相应概率,并将结果存储并发送用户保存。

    一种胃癌组合标志物及标志物模型的建立方法

    公开(公告)号:CN116179691A

    公开(公告)日:2023-05-30

    申请号:CN202211088012.5

    申请日:2022-09-07

    Abstract: 本发明属于医学领域,尤其涉及一种胃癌组合标志物及标志物模型的建立方法。首先公开了一种胃癌组合标志物,包括胃癌预后组合标志物和/或预测胃癌进展的组合标志物;所述胃癌预后组合标志物包括miR‑200b‑3p、miR‑141‑3p、miR‑200c‑3p、miR‑200a‑3p、miR‑429、miR‑182‑5p、miR‑183‑5p中的至少两种;所述预测胃癌进展的组合标志物包括miR‑182‑5p,miR183‑5p,LDB3,NOVA1,NPTX1和NR3C1中的至少两种。本发明构建的模型可用于发现胃癌发展和预后的标志物,以便选择最佳治疗方案,显著提高患者生存率,为胃癌患者带来福音。

    一种肝癌细胞生长抑制剂及其在肝癌预后判断中的应用

    公开(公告)号:CN108245526A

    公开(公告)日:2018-07-06

    申请号:CN201810068318.1

    申请日:2018-01-24

    Applicant: 苏州大学

    CPC classification number: A61K31/7105

    Abstract: 本发明公开了一种肝癌细胞生长抑制剂及其在肝癌预后判断中的应用,属于生物医药领域。本发明提供的肝癌细胞生长抑制剂miR‑378a‑3p体外能够明显抑制肝癌细胞的增殖、生长、干细胞的自我更新及体外的迁移、侵袭,并能体内抑制肝癌裸鼠皮下、肝原位移植瘤的生长及肝癌细胞的远端肺转移。功能验证结果表明,miR‑378a‑3p在肝癌中担当肿瘤抑制性microRNA的角色。

    一种肝癌诊断标志物及其应用

    公开(公告)号:CN108192970A

    公开(公告)日:2018-06-22

    申请号:CN201810068446.6

    申请日:2018-01-24

    Applicant: 苏州大学

    Abstract: 本发明公开了一种肝癌诊断标志物及其应用,属于生物医药领域。本发明通过microRNA加尾荧光定量PCR的方法分别在肝癌组织标本、肝癌细胞系中检测和验证了4个microRNA在肝癌癌组织、肝癌细胞中的表达差异,获得了可用作肝癌标志物的RNA分子。

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