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公开(公告)号:CN110283895A
公开(公告)日:2019-09-27
申请号:CN201910642659.X
申请日:2019-07-16
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了基于二代Illumina测序平台的高效纯化与识别环状RNA的方法,属于分子生物学领域。使用本方法纯化得到的环状RNA测序文库,可以大大提高不相关线性RNA的去除效率,富集得到高纯度的环状RNA。基于基因组注释,构建环状RNA的虚拟数据集。将测序数据的reads进行搜库比对,识别到的环状RNA种类远高于常规方法。这对于研究环状RNA的内部结构和揭示其功能具有重要意义。
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公开(公告)号:CN109402166A
公开(公告)日:2019-03-01
申请号:CN201811459796.1
申请日:2018-11-30
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12N15/82 , C12Q1/6851 , C12Q1/6895 , A01H5/00 , A01H6/00
Abstract: 本发明提供了杉木病毒诱导基因沉默系统及其构建方法,属于林木基因工程领域。包括如下步骤:杉木植株材料的培养;目的基因片段的克隆;重组病毒质粒载体的构建;农杆菌介导沉默载体侵染杉木植株;沉默效果结果验证。使用本发明可以根据植株表型的变化来探究目标基因的功能机制,该VIGS体系的建立对林木裸子植物功能基因的研究具有开创性的意义。
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公开(公告)号:CN113025688A
公开(公告)日:2021-06-25
申请号:CN202110347673.4
申请日:2021-03-31
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明名公开了一种基于Oxford Nanopore Technologies的序列特异性直接RNA测序文库构建方法及应用,属于三代高通量测序技术领域。其构建方法为:总RNA的提取和质量控制;从总RNA中去除rRNA和质量控制;设计序列特异性逆转录接头的设计、构建和质量控制;基于Oxford Nanopore Technologies的直接RNA测序文库构建;序列特异性RNA的检测。本方法重新设计ssRTA并将其应用于基于Oxford Nanopore Technologies的直接RNA测序文库,主要应用于测定不带ploy(A)尾的线性转录本,这是以往任何流程无法做到的。
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公开(公告)号:CN116042701A
公开(公告)日:2023-05-02
申请号:CN202310105479.4
申请日:2023-02-13
Applicant: 福建农林大学
Abstract: 本发明提供了一种竹花叶病毒介导的外源表达系统及其应用,属于基因工程技术领域。所述外源基因表达系统的元件包括竹花叶病毒基因组、pCAMBIA1302线性化载体、ORF5亚基因组启动子、RNA沉默抑制子P19、T2A自剪切肽、外源基因和农杆菌GV3101。该过表达体系能够被应用于毛竹和麻竹基因功能研究,可为竹类分子育种提供科学指导。
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公开(公告)号:CN109402166B
公开(公告)日:2022-07-15
申请号:CN201811459796.1
申请日:2018-11-30
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12N15/82 , C12Q1/6851 , C12Q1/6895 , A01H5/00 , A01H6/00
Abstract: 本发明提供了杉木病毒诱导基因沉默系统及其构建方法,属于林木基因工程领域。包括如下步骤:杉木植株材料的培养;目的基因片段的克隆;重组病毒质粒载体的构建;农杆菌介导沉默载体侵染杉木植株;沉默效果结果验证。使用本发明可以根据植株表型的变化来探究目标基因的功能机制,该VIGS体系的建立对林木裸子植物功能基因的研究具有开创性的意义。
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公开(公告)号:CN111705119A
公开(公告)日:2020-09-25
申请号:CN202010640832.5
申请日:2020-07-06
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了检测毛竹环状RNA表观遗传修饰的方法,属于分子生物学领域。目前常用的RNA修饰检测方法,一般采用特异性RNA修饰的抗体,进行免疫沉淀,结合高通量测序来识别RNA修饰位点。而使用本方法首先纯化得到环状RNA,将环状RNA打断并3'端去磷酸化,基于ONT平台直接对RNA进行测序,即可获得环状RNA的多种表观修饰信息,如m6A、m5C,m1A等。本发明首次提出了避免PCR扩增,直接从单碱基精度上检测环状RNA表观修饰位点的新型方法,克服了传统方法的繁琐流程与高额的抗体成本,这不仅丰富了检测环状RNA中表观修饰方法的多样性,也为探究环状RNA的结构和功能提供了新的思路。
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公开(公告)号:CN109486856B
公开(公告)日:2021-11-02
申请号:CN201811459776.4
申请日:2018-11-30
Applicant: 福建农林大学
IPC: C12N15/82
Abstract: 本发明名公开了一种毛竹原生质体环状RNA过表达体系构建方法及应用,属于基因工程技术领域。该体系构建环状RNA过表达载体并将其转化到毛竹的原生质体中。其构建方法为:高保真Taq酶扩增环状RNA宿主基因、以pUC19‑35s‑sGFP为终载体,使用Gateway方法构建环状RNA过表达重组质粒;大量提取重组质粒并在PEG介导下转化到毛竹原生质体中,研究环状RNA过表达对其宿主基因在转录和转录后水平的影响。
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