公开(公告)号：CN117903269A

公开(公告)日：2024-04-19

申请号：CN202410098050.1

申请日：2024-01-24

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 李占杰 ,  秦源

IPC: C07K14/415 ,  C07K16/16 ,  G01N33/68

Abstract: 本发明公开一种芸薹属植物通用着丝粒组蛋白CENH3抗原多肽及其应用，属于生物信息学和分子细胞遗传学领域。首先利用生物信息学比对分析芸薹属物种A、B、C三个亚基因组来源的CENH3蛋白序列，选取N端一段保守氨基酸序列并人工合成多肽，用该多肽常规免疫新西兰大白兔，制备抗血清，经过抗原亲和纯化得到CENH3蛋白抗体。CENH3蛋白抗体通过免疫荧光检测、ChIP‑FISH验证特异性，证明该抗体可以准确识别芸薹属6个物种的功能着丝粒。该抗体不仅可以准确标记功能着丝粒的位置，也为开展芸薹属植物着丝粒结构、功能及进化研究奠定基础。本发明在芸薹属植物分子细胞遗传学、基因组学及表观组学等研究领域具有广阔的应用前景。

公开(公告)号：CN110904191A

公开(公告)日：2020-03-24

申请号：CN201911331788.3

申请日：2019-12-21

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 李占杰 ,  王凯 ,  欧阳凯

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6895 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及一种快速简便构建植物DNase-seq文库的方法，采用AMPure beads首先去除1000bp以上的大片段，然后利用醇沉的方法回收所有小片段用于PCR建库，建库后再一次AMPure beads片段筛选去除插入片段大于200bp的DNA用于测序。本发明通过两轮的AMPure beads筛选，即可获得用于测序的DNase-seq文库，在建库的同时进行片段筛选，明显的缩短有效DNA片段回收的时间和步骤。该方法简便、快速，易操作，且稳定、可靠，重复性好，该方法的建立可加快DNase-seq文库的构建，推动植物开放染色质鉴定相关领域研究的发展，具有重要意义。

公开(公告)号：CN116411128A

公开(公告)日：2023-07-11

申请号：CN202310596407.4

申请日：2023-05-25

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 李占杰 ,  秦源 ,  梁启富

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6841 ,  G01N33/68

Abstract: 本发明公开了一种用于芸薹属植物B基因组染色体特异识别检测的探针及其制备方法和应用。所述探针具有如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列，为地高辛标记探针。本发明提供的探针仅能在芸薹属植物B基因组染色体上产生清晰明亮的信号，而在A、C基因组染色体上无任何信号，说明该探针是芸薹属植物B组染色体特异识别探针。本发明的芸薹属植物B基因组染色体特异识别探针可用于快速准确地检测和跟踪芸薹属植物B基因组染色体行为，为芸薹属植物染色体工程及远源杂交育种工作的开展提供一种简便、高效的鉴定方法。