一种配对互作基因检测方法及预测模型

    公开(公告)号:CN107292128A

    公开(公告)日:2017-10-24

    申请号:CN201710500075.X

    申请日:2017-06-27

    CPC classification number: G06F19/20

    Abstract: 本发明公开了一种配对互作基因检测方法及预测模型,检测方法包括以下步骤:对给定的数据集{Yi,Xij},首先对每个基因表达值进行秩规格化,得到规格化后的数据矩阵{Yi,Rij},即对于任一基因j,将其表达值按从小到大顺序排列,然后用每个表达值的排列位置代替初始表达值;对任意两个基因p和基因q采用abs模式进行转换,获得转换后的数据集{Yi,Zis};abs模式:Zis=|Rip–Riq|;其中i=1,2,…,n;p=1,2,…,m;q=1,2,…,m;p≠q;s=1,2,…,m(m-1)/2;n为数据集中的样本数,m为数据集中的基因数;计算每个变量Zis与表型Yi之间的t值,根据t值判断两个基因之间的互作效应。本发明可有效提高模型预测精度。

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