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公开(公告)号:CN118606436A
公开(公告)日:2024-09-06
申请号:CN202410797403.7
申请日:2024-06-19
Applicant: 清华大学
Abstract: 本公开涉及一种冷冻电镜数据智能自动处理方法和装置,将冷冻电镜数据处理任务的目标任务信息输入大语言模型,通过大语言模型基于其中的基本参数信息和本地知识库生成用于实现任务目标的操作信息。将操作信息发送至主智能体,以迭代的方式依次控制工作智能体基于步骤参数执行对应操作步骤,在迭代结束后生成对应的反馈信息,正反馈则结束当前工作智能体的操作,控制下一个工作智能体执行下一操作步骤;负反馈则更新当前操作步骤对应的步骤参数,控制当前工作智能体基于更新的步骤参数再次执行当前操作步骤。本公开通过大语言模型自动指示智能体执行操作,不依赖用户经验自动进行冷冻电镜数据的处理,提高了处理过程效率和处理结果的准确度。
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公开(公告)号:CN108121925B
公开(公告)日:2020-08-07
申请号:CN201711178893.9
申请日:2017-11-23
Applicant: 清华大学
IPC: G06K1/12
Abstract: 本发明提供一种电镜数据标签的生成方法及生成系统,该电镜数据标签与电镜数据关联,用于保存电镜数据的相关信息;电镜数据标签的预设内容包括:课题种类、实验名称、数据采集时长、数据采集设备、分辨率精度、课题代号、样本代号、样品类型、样品帧尺寸宽、样品帧尺寸高、制样条件1、制样条件2、放大倍数、采样条件、数据期望精度、所属课题组、所属老师、合作课题组和合作老师。基于本发明提供的电镜数据标签,可以对大数据系统中存储的电镜数据实施多维度的分析和管理。
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公开(公告)号:CN108052524A
公开(公告)日:2018-05-18
申请号:CN201711082627.6
申请日:2017-11-07
Applicant: 清华大学
IPC: G06F17/30
Abstract: 本发明提供一种文件系统元数据的扫描方法和系统,该方法包括:步骤A‑1:扫描文件系统所存储的数据文件目录,生成第一目录集合;步骤A‑2:将第一目录集合中的目录平均分配生成第一目录分组集合,第一目录分组集合包括M个目录分组;步骤A‑3:启动M个进程用于扫描M个目录分组的数据文件路径信息,得到第一全路径集合;步骤A‑4:将第一全路径集合中的路径平均分配生成第一路径分组集合,第一路径分组集合包括N个路径分组;步骤A‑5:启动N个进程用于获取N个路径分组中每个数据文件的元数据,得到第一元数据集合。本发明提供的文件系统元数据的扫描方法和系统,将扫描普通的单进程扫描更改为分步多进程扫描,提高了整体处理效率,节省了处理时间。
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公开(公告)号:CN104537713B
公开(公告)日:2017-10-03
申请号:CN201510006885.0
申请日:2015-01-05
Applicant: 清华大学
IPC: G06T17/00
Abstract: 一种新型三维重构系统包括Appion系统的工作流展现模块、数据指令转换模块、数据配置模块、LSF系统的网格作业队列模块、LSF调度库模块、LSF计费库模块及网络资源池模块。本发明提出的一种新的基于LSF系统、Appion系统和冷冻电子显微镜技术实现三维重构的系统,该系统开创性地将基于Appion系统、冷冻电镜生物结构研究技术和基于LSF的网格计算技术三者有机结合在一起,形成一种新的冷冻电子显微镜三维重构技术,该技术的重要特点是三维重构的流水线技术的实现,该流水线技术能有效降低生物样品电镜图像解析的工作强度,并有效提高结构生物学电镜三维重构方法的研究效率。
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公开(公告)号:CN109460184B
公开(公告)日:2021-04-16
申请号:CN201811035834.0
申请日:2018-09-06
Applicant: 清华大学
IPC: G06F3/06
Abstract: 本发明提供一种电镜数据转储方法、存储介质和装置,包括:步骤11:预设转储进程数为copynum,根据copynum确定源端服务器与目标端服务器的目标带宽,并配置源端服务器与目标端服务器之间的链路带宽不低于目标带宽;步骤13:在源端服务器创建copynum个并行进程,每个进程用于将第一预设目录下的一个待传输文件传输至第二预设目录下;监控copynum个进程,当任一进程结束后,再创建一个新的进程用于传输第一预设目录下另一个待传输文件,直至第一预设目录下的所有待传输文件均传输完毕。基于本发明提供的电镜数据转储方法,可以实现对电镜数据的快速转储,以支持对电镜数据的大数据管理。
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公开(公告)号:CN109522152A
公开(公告)日:2019-03-26
申请号:CN201811035867.5
申请日:2018-09-06
Applicant: 清华大学
IPC: G06F11/14
Abstract: 本发明提供一种电镜数据灾备方法、存储介质和装置,该方法用于将源存储系统中至少一个待灾备目录下的电镜数据文件同步至目标存储系统,源端存储系统挂载于源端服务器,目标端存储系统挂载于目标端服务器,包括:步骤11:判断源端服务器与目标端服务器的当前剩余带宽是否符合预设条件;如果是,则根据当前剩余带宽确定进程数copynum,创建copynum个并行进程,每个进程用于将待灾备目录下的一个待灾备电镜数据文件同步至目标存储系统;步骤13:当任一进程结束后,返回步骤11,直至待灾备目录下的所有待灾备电镜数据文件均同步完毕。基于本发明提供的电镜数据灾备方法,在不影响其他任务的前提下实现对电镜数据的快速灾备,避免数据丢失,保障数据安全。
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公开(公告)号:CN105005487A
公开(公告)日:2015-10-28
申请号:CN201510369044.6
申请日:2015-06-29
Applicant: 清华大学
IPC: G06F9/445
Abstract: 本发明公开了一种持续服务的高性能集群操作系统在线升级方法,包括:确定集群系统中的一批待升级计算节点,作业调度和资源管理系统将作业请求分配到待升级计算节点之外的计算节点上,在待升级计算节点处理完其节点上的作业请求后,隔离待升级计算节点,由集群装机系统进行待升级计算节点的操作系统的升级;完成升级后,作业调度和资源管理系统控制部分用户通过第二提交节点向高性能集群系统提交作业请求,并将该部分用户的作业请求分配到升级后的计算节点上;之后确定新一批待升级计算节点,重复升级步骤直至完成所有计算节点的操作系统升级。该方法可在保持持续服务的状态下对集群进行升级改造,且升级对用户的影响较小,提高了用户满意度。
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公开(公告)号:CN109522152B
公开(公告)日:2021-05-14
申请号:CN201811035867.5
申请日:2018-09-06
Applicant: 清华大学
IPC: G06F11/14
Abstract: 本发明提供一种电镜数据灾备方法、存储介质和装置,该方法用于将源存储系统中至少一个待灾备目录下的电镜数据文件同步至目标存储系统,源端存储系统挂载于源端服务器,目标端存储系统挂载于目标端服务器,包括:步骤11:判断源端服务器与目标端服务器的当前剩余带宽是否符合预设条件;如果是,则根据当前剩余带宽确定进程数copynum,创建copynum个并行进程,每个进程用于将待灾备目录下的一个待灾备电镜数据文件同步至目标存储系统;步骤13:当任一进程结束后,返回步骤11,直至待灾备目录下的所有待灾备电镜数据文件均同步完毕。基于本发明提供的电镜数据灾备方法,在不影响其他任务的前提下实现对电镜数据的快速灾备,避免数据丢失,保障数据安全。
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公开(公告)号:CN108090118B
公开(公告)日:2020-09-18
申请号:CN201711082628.0
申请日:2017-11-07
Applicant: 清华大学
IPC: G06F16/16
Abstract: 本发明提供一种面向电镜数据存储系统的文件元数据增量扫描方法与系统,该方法包括:解析第一元数据信息文件得到第一全路径信息集合;获取文件系统所有数据文件的路径信息,生成第二全路径信息集合,对第二全路径信息集合和第一全路径信息集合做差集运算,得到待增全路径信息集合;对第一全路径信息集合和第二全路径信息集合做差集运算,得到待删全路径信息集合;将待增全路径信息集合中的每个文件路径相关的元数据写入第一元数据信息文件;同时删除第一元数据信息文件中待删全路径信息集合相关的元数据。本发明提供的一种面向电镜数据存储系统的文件元数据增量扫描方法与系统,基于增量更新,节省了处理时间,对文件系统元数据实现了快速扫描和更新。
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公开(公告)号:CN108121925A
公开(公告)日:2018-06-05
申请号:CN201711178893.9
申请日:2017-11-23
Applicant: 清华大学
IPC: G06K1/12
CPC classification number: G06K1/12
Abstract: 本发明提供一种电镜数据标签,该电镜数据标签与电镜数据关联,用于保存电镜数据的相关信息;电镜数据标签的预设内容包括:课题种类、实验名称、数据采集时长、数据采集设备、分辨率精度、课题代号、样本代号、样品类型、样品帧尺寸宽、样品帧尺寸高、制样条件1、制样条件2、放大倍数、采样条件、数据期望精度、所属课题组、所属老师、合作课题组和合作老师。基于本发明提供的电镜数据标签,可以对大数据系统中存储的电镜数据实施多维度的分析和管理。
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