一种Perturb-seq实验的成本分析方法及系统

    公开(公告)号:CN117649882A

    公开(公告)日:2024-03-05

    申请号:CN202311548915.1

    申请日:2023-11-20

    Applicant: 清华大学

    Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域,公开一种Perturb‑seq实验的成本分析方法及系统,包括:根据目标gRNA信息和目标基因信息,得到目标gRNA的感染效率、目标gRNA对目标基因的扰动数据、预设显著水平数据、和预设功效数据,估算用于检测目标基因受到目标gRNA的影响的细胞数量;根据估算得到的细胞数量,进行实验成本分析和gRNA比例分析,得到优化实验方案。本发明估算得到的细胞数量既有利于实验人员进行实验,又能够进行实验成本分析,当用户认为实验成本过高时可以对细胞数量进行适量删减,当目标gRNA为多个时,还可以优化gRNA比例分配,以降低实验成本,避免浪费生物资源,提高实验效率。

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