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公开(公告)号:CN109658981B
公开(公告)日:2022-10-04
申请号:CN201811501781.7
申请日:2018-12-10
Applicant: 海南大学
Abstract: 本发明属于生物信息学分析技术领域,公开了一种单细胞测序的数据分类方法;包括有第一条序列(Read1.fastq)的信息识别模块;第二条序列(Read2.fastq)的信息识别模块;条形码列表信息加载(barcodeList)模块;引物信息加载(primerList)模块。本发明主要对单细胞测序技术SPLiT‑seq的数据进行分类,在分类过程中充分考虑条码barcode的信息,这是第一个对单细胞SPLiT‑seq技术的数据分类的方法。在barcode和特征序列中加入了容错比对机制,并使用碱基转换函数,将字符转换成数字进行运算,使单细胞测序数据的分类更加快速和高效。
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公开(公告)号:CN109658981A
公开(公告)日:2019-04-19
申请号:CN201811501781.7
申请日:2018-12-10
Applicant: 海南大学
Abstract: 本发明属于生物信息学分析技术领域,公开了一种单细胞测序的数据分类方法;包括有第一条序列(Read1.fastq)的信息识别模块;第二条序列(Read2.fastq)的信息识别模块;条形码列表信息加载(barcodeList)模块;引物信息加载(primerList)模块。本发明主要对单细胞测序技术SPLiT-seq的数据进行分类,在分类过程中充分考虑条码barcode的信息,这是第一个对单细胞SPLiT-seq技术的数据分类的方法。在barcode和特征序列中加入了容错比对机制,并使用碱基转换函数,将字符转换成数字进行运算,使单细胞测序数据的分类更加快速和高效。
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公开(公告)号:CN109504795A
公开(公告)日:2019-03-22
申请号:CN201811583474.8
申请日:2018-12-24
Applicant: 海南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开了一种檀香基因组特异序列的确定方法和檀香的鉴定方法,涉及基因技术领域。所述确定方法:从基因数据库中获取檀香基因组测序数据,确定檀香候选区域序列;将檀香候选区域序列比对基因数据库中其他物种基因组序列,从檀香候选区域序列中剔除能比对上其他物种基因组序列,保留特异无法比对上其他物种基因组序列并将其作为檀香核苷酸特异序列;将檀香核苷酸特异序列映射至檀香基因组,确定檀香核苷酸特异序列在所述檀香基因组中的位置信息。鉴定方法:利用SEQ ID NO.1所示核苷酸序列鉴定檀香。本发明通过获取檀香核苷酸特异序列并利用其特异性,从基因角度鉴定檀香真伪,提高了檀香鉴定结果的准确性。
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公开(公告)号:CN117051155A
公开(公告)日:2023-11-14
申请号:CN202311106624.7
申请日:2023-08-29
Applicant: 海南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种与文心兰花梗硬度性状相关的SNP分子标记及其应用,该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其中SNP位点为SEQ ID NO.1所示序列的第501bp处,具有A/G多态性。本发明通过106份文心兰种质资源简化基因组测序数据,结合文心兰花梗硬度相关的表型数据进行全基因组关联分析,定位筛选出了一个与花梗硬度相关的SNP分子标记,该分子标记在文心兰花梗硬度性状的调控起着关键作用,可用作图位克隆和分子标记辅助选择,从而在苗期或无花期有效筛选得到花梗硬度较强的文心兰品种,加速文心兰鲜切花品种选育进程,对种质资源保护和新品种选育具有重要意义。
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公开(公告)号:CN117187433A
公开(公告)日:2023-12-08
申请号:CN202311106646.3
申请日:2023-08-29
Applicant: 海南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种与文心兰花梗直径相关的SNP分子标记及其应用,所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其中SNP位点为SEQ ID NO.1所示序列的第401bp处,具有G/A多态性。本发明将106份文心兰种质资源简化基因组测序数据,与文心兰花梗直径相关的表型数据进行全基因组关联分析,定位筛选出与花梗直径相关的SNP分子标记Orc.chr05:p56360532,该分子标记在文心兰花梗直径性状的调控中起着关键作用,可用作图位克隆和分子标记辅助选择,从而在苗期或无花期有效筛选得到花梗直径较粗的文心兰品种,加速文心兰鲜切花品种选育进程,对种质资源保护和新品种选育具有重要意义。
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公开(公告)号:CN208987367U
公开(公告)日:2019-06-18
申请号:CN201821723276.2
申请日:2018-10-24
Applicant: 海南大学
IPC: A01G2/38
Abstract: 本实用新型提供一种新型果树嫁接防风支架,涉及果树保护装置领域,该新型果树嫁接防风支架,包括两块相对设置的半弧覆板,两块所述半弧覆板相互靠近的一端通过伸缩连接带绑扎连接,两块所述半弧覆板相互靠近的另一端均粘接有固定侧板,两个所述侧板的内部贯穿有锁定螺杆,所述半弧覆板的内部设置有固定内控块,该新型果树嫁接防风支架,半弧覆板可弯曲改变其弧度的大小,便于包覆在不同粗细的树干上,同时半弧覆板的弹性可包覆在树干上且与树干外表面充分接触,提高固定的稳定性,避免固定不牢固歪斜对嫁接的枝苗产生损坏,通过拧紧螺母即可将半弧覆板固定,操作简单方便,降低了嫁接作业的劳动强度。
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