一种单细胞测序的数据分类方法

    公开(公告)号:CN109658981B

    公开(公告)日:2022-10-04

    申请号:CN201811501781.7

    申请日:2018-12-10

    Applicant: 海南大学

    Abstract: 本发明属于生物信息学分析技术领域,公开了一种单细胞测序的数据分类方法;包括有第一条序列(Read1.fastq)的信息识别模块;第二条序列(Read2.fastq)的信息识别模块;条形码列表信息加载(barcodeList)模块;引物信息加载(primerList)模块。本发明主要对单细胞测序技术SPLiT‑seq的数据进行分类,在分类过程中充分考虑条码barcode的信息,这是第一个对单细胞SPLiT‑seq技术的数据分类的方法。在barcode和特征序列中加入了容错比对机制,并使用碱基转换函数,将字符转换成数字进行运算,使单细胞测序数据的分类更加快速和高效。

    一种单细胞测序的数据分类方法

    公开(公告)号:CN109658981A

    公开(公告)日:2019-04-19

    申请号:CN201811501781.7

    申请日:2018-12-10

    Applicant: 海南大学

    Abstract: 本发明属于生物信息学分析技术领域,公开了一种单细胞测序的数据分类方法;包括有第一条序列(Read1.fastq)的信息识别模块;第二条序列(Read2.fastq)的信息识别模块;条形码列表信息加载(barcodeList)模块;引物信息加载(primerList)模块。本发明主要对单细胞测序技术SPLiT-seq的数据进行分类,在分类过程中充分考虑条码barcode的信息,这是第一个对单细胞SPLiT-seq技术的数据分类的方法。在barcode和特征序列中加入了容错比对机制,并使用碱基转换函数,将字符转换成数字进行运算,使单细胞测序数据的分类更加快速和高效。

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