一种基于肠道微生物信息预测犊牛腹泻抗性的方法

    公开(公告)号:CN113889190B

    公开(公告)日:2024-12-24

    申请号:CN202111232337.1

    申请日:2021-10-22

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明提供一种基于肠道微生物信息预测犊牛腹泻抗性的方法,具体包括以下步骤:采集可提取微生物群DNA的犊牛粪便样品;检测犊牛粪便样品中微生物群各微生物的存在和丰度,计算微生物群的互作强度指数以及不同组别的总丰度;根据检测信息和计算信息构建随机森林机器学习模型;根据受试犊牛粪便样品中微生物群的互作强度指数、不同组别的总丰度和随机森林机器学习模型预测受试犊牛腹泻抗性。本发明可以有效预测犊牛对腹泻的抗性,具有较高的准确度、灵敏度和特异性,采用本发明的方法在初生后利用粪便微生物评估犊牛的腹泻抗性,有助于犊牛群体选育,减少抗生素预防和治疗腹泻带来的负面作用。

    一株乳酸杆菌菌株及其应用

    公开(公告)号:CN112877239B

    公开(公告)日:2022-03-29

    申请号:CN202110134257.6

    申请日:2021-01-29

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明涉及一株乳酸杆菌菌株及其应用,属于微生物技术领域。一株乳酸杆菌菌株,该菌是罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)的菌株RGW1,该菌株于2019年9月27日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院,中科院微生物研究所,邮编100101)保藏,其保藏号为:CGMCC No.18626。本发明所提供的菌株不具有毒力基因,对常用抗生素敏感,具有耐胃肠道内环境的能力,具有高疏水性使其能够黏附到肠道上皮发挥益生作用,其益生作用包括能够提高动物结肠绒毛高度和绒毛/隐窝比值,并抑制由病原微生物引起的肠道炎症。

    一株乳酸杆菌菌株及其应用

    公开(公告)号:CN112877239A

    公开(公告)日:2021-06-01

    申请号:CN202110134257.6

    申请日:2021-01-29

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明涉及一株乳酸杆菌菌株及其应用,属于微生物技术领域。一株乳酸杆菌菌株,该菌是罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)的菌株RGW1,该菌株于2019年9月27日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院,中科院微生物研究所,邮编100101)保藏,其保藏号为:CGMCC No.18626。本发明所提供的菌株不具有毒力基因,对常用抗生素敏感,具有耐胃肠道内环境的能力,具有高疏水性使其能够黏附到肠道上皮发挥益生作用,其益生作用包括能够提高动物结肠绒毛高度和绒毛/隐窝比值,并抑制由病原微生物引起的肠道炎症。

    一种基于肠道微生物信息预测犊牛腹泻抗性的方法

    公开(公告)号:CN113889190A

    公开(公告)日:2022-01-04

    申请号:CN202111232337.1

    申请日:2021-10-22

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明提供一种基于肠道微生物信息预测犊牛腹泻抗性的方法,具体包括以下步骤:采集可提取微生物群DNA的犊牛粪便样品;检测犊牛粪便样品中微生物群各微生物的存在和丰度,计算微生物群的互作强度指数以及不同组别的总丰度;根据检测信息和计算信息构建随机森林机器学习模型;根据受试犊牛粪便样品中微生物群的互作强度指数、不同组别的总丰度和随机森林机器学习模型预测受试犊牛腹泻抗性。本发明可以有效预测犊牛对腹泻的抗性,具有较高的准确度、灵敏度和特异性,采用本发明的方法在初生后利用粪便微生物评估犊牛的腹泻抗性,有助于犊牛群体选育,减少抗生素预防和治疗腹泻带来的负面作用。

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