公开(公告)号：CN109337997A

公开(公告)日：2019-02-15

申请号：CN201811105861.0

申请日：2018-09-20

Applicant: 江西省林业科学院

Inventor： 温强 ,  殷鑫 ,  刘丽婷 ,  李田 ,  王建文 ,  杨军 ,  朱恒 ,  叶金山 ,  徐立安

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于林业分子生物学技术领域，具体涉及了一种山茶属多态性叶绿体基因组微卫星分子标记引物及筛选和甄别近缘种的方法。基于山茶属物种叶绿体DNA序列微卫星位点相对一致性，针对种间存在变异的特定微卫星位点设计cpSSR引物；提取不同山茶属物种的DNA，与引物混合、扩增、电泳检测；最终获得山茶属多态性叶绿体基因组微卫星分子标记引物16对。甄别近缘种的方法包括：提取浙江红山茶及其近缘种的DNA，采用多态性引物进行毛细管电泳分离，按PCR产物片段分离甄别近缘种。本发明提供的引物筛选方法快速高效，广泛适用于其他具有叶绿体基因组序列信息的植物种属，获得的多态性cpSSR标记可用于山茶属植物的系统分类、近缘种的甄别及遗传多样性分析等研究。

公开(公告)号：CN117448483A

公开(公告)日：2024-01-26

申请号：CN202311542347.4

申请日：2023-11-18

Applicant: 江西省林业科学院

Inventor： 温强 ,  殷鑫 ,  刘丽婷 ,  黄彬 ,  万承永 ,  王波 ,  查康 ,  汪雁楠 ,  朱恒 ,  李晓辉 ,  龚春 ,  徐立安

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及一种可用于山茶亚属近缘种亲缘关系分析的cpDNA基因间隔区分子标记；包括山茶属近缘种(浙江红山茶、南山茶、小果油茶和短柱茶)叶绿体基因组的测序与比较，叶绿体基因组高变异基因间隔区的获取与分子标记开发，最后筛选获得5个高变异的叶绿体基因组分子标记Cc_petN‑psbM、Cc_trnS‑trnR、Cc_ycf3‑trnS、Cc_rrn5‑trnN、Cc_trnN‑ndhF。本发明可用于山茶属物种的系统发育研究，且具有优秀的通用性，尤其适合针对油茶树种集中分布的山茶亚属的油茶组、红山茶组和短柱茶组近缘物种间的系统发育关系分析，是一种可靠有效的分子标记。

公开(公告)号：CN103667275A

公开(公告)日：2014-03-26

申请号：CN201310681868.8

申请日：2013-12-13

Applicant: 江西省林业科学院

Inventor： 温强 ,  刘丽婷 ,  徐立安 ,  徐林初 ,  周文才 ,  叶金山 ,  朱恒 ,  黄敏仁

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/68

Abstract: 一种油茶SSR分子标记，包括油茶DNA序列的获得及预处理、DNA序列中SSR位点的检索、SSR引物的设计与合成、SSR标记体系的建立、多态性SSR标记的筛选。检索利用454测序得到油茶基因组序列及EST序列中含有简单序列重复单元的、符合条件的序列，筛选得到12个多态性丰富的SSR标记CO_gSSR11、CO_gSSR12、CO_gSSR14、CO_gSSR16、CO_gSSR19、CO_gSSR20、CO_eSSR01、CO_eSSR04、CO_eSSR16、CO_eSSR40、CO_eSSR44、CO_eSSR48。本发明适用于油茶种质资源的遗传评价、种质鉴定及分子标记辅助育种研究，重复性好、可靠性高，是一种非常有效的分子标记。

公开(公告)号：CN109337997B

公开(公告)日：2020-05-22

申请号：CN201811105861.0

申请日：2018-09-20

Applicant: 江西省林业科学院

Inventor： 温强 ,  殷鑫 ,  刘丽婷 ,  李田 ,  王建文 ,  杨军 ,  朱恒 ,  叶金山 ,  徐立安

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明属于林业分子生物学技术领域，具体涉及了一种山茶属多态性叶绿体基因组微卫星分子标记引物及筛选和甄别近缘种的方法。基于山茶属物种叶绿体DNA序列微卫星位点相对一致性，针对种间存在变异的特定微卫星位点设计cpSSR引物；提取不同山茶属物种的DNA，与引物混合、扩增、电泳检测；最终获得山茶属多态性叶绿体基因组微卫星分子标记引物16对。甄别近缘种的方法包括：提取浙江红山茶及其近缘种的DNA，采用多态性引物进行毛细管电泳分离，按PCR产物片段分离甄别近缘种。本发明提供的引物筛选方法快速高效，广泛适用于其他具有叶绿体基因组序列信息的植物种属，获得的多态性cpSSR标记可用于山茶属植物的系统分类、近缘种的甄别及遗传多样性分析等研究。

公开(公告)号：CN103667275B

公开(公告)日：2015-12-09

申请号：CN201310681868.8

申请日：2013-12-13

Applicant: 江西省林业科学院

Inventor： 温强 ,  刘丽婷 ,  徐立安 ,  徐林初 ,  周文才 ,  叶金山 ,  朱恒 ,  黄敏仁

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/68

Abstract: 一种油茶SSR分子标记，包括油茶DNA序列的获得及预处理、DNA序列中SSR位点的检索、SSR引物的设计与合成、SSR标记体系的建立、多态性SSR标记的筛选。检索利用454测序得到油茶基因组序列及EST序列中含有简单序列重复单元的、符合条件的序列，筛选得到12个多态性丰富的SSR标记CO_gSSR11、CO_gSSR12、CO_gSSR14、CO_gSSR16、CO_gSSR19、CO_gSSR20、CO_eSSR01、CO_eSSR04、CO_eSSR16、CO_eSSR40、CO_eSSR44、CO_eSSR48。本发明适用于油茶种质资源的遗传评价、种质鉴定及分子标记辅助育种研究，重复性好、可靠性高，是一种非常有效的分子标记。