公开(公告)号：CN114093515B

公开(公告)日：2025-01-24

申请号：CN202111360059.8

申请日：2021-11-17

Applicant: 江南大学

Inventor： 王鸿超 ,  陈宇涛 ,  陆文伟 ,  朱金林 ,  赵建新 ,  张灏 ,  陈卫

IPC: G16H50/30 ,  G16H10/60 ,  G16H50/50

Abstract: 本发明公开了一种基于肠道菌群预测模型集成学习的年龄预测方法，包括：获取人类肠道菌群宏基因组学的原始数据，将获得的基因组数据进行质量控制，并获取肠道菌群物种组成和代谢通路组成丰度表，构建样本数据集；然后对样本数据集进行特征选择；使用筛选后的特征结合宿主地域信息构建多类年龄预测模型，并采用网格搜索确定使得预测模型精度更高的超参数并对各个最佳预测模型进行训练和预测，得到集成年龄预测方法；最后利用确定的肠道菌群特征和集成年龄预测方法预测样本的年龄，并通过特征解释确定与年龄相关的关键物种和通路。本发明采用了集成学习方法，有效提高了年龄预测准确率；并且能够定向指导肠道菌群的调整，进而实现抗衰老干预。

公开(公告)号：CN114093515A

公开(公告)日：2022-02-25

申请号：CN202111360059.8

申请日：2021-11-17

Applicant: 江南大学

Inventor： 王鸿超 ,  陈宇涛 ,  陆文伟 ,  朱金林 ,  赵建新 ,  张灏 ,  陈卫

IPC: G16H50/30 ,  G16H10/60 ,  G16H50/50

Abstract: 本发明公开了一种基于肠道菌群预测模型集成学习的年龄预测方法，包括：获取人类肠道菌群宏基因组学的原始数据，将获得的基因组数据进行质量控制，并获取肠道菌群物种组成和代谢通路组成丰度表，构建样本数据集；然后对样本数据集进行特征选择；使用筛选后的特征结合宿主地域信息构建多类年龄预测模型，并采用网格搜索确定使得预测模型精度更高的超参数并对各个最佳预测模型进行训练和预测，得到集成年龄预测方法；最后利用确定的肠道菌群特征和集成年龄预测方法预测样本的年龄，并通过特征解释确定与年龄相关的关键物种和通路。本发明采用了集成学习方法，有效提高了年龄预测准确率；并且能够定向指导肠道菌群的调整，进而实现抗衰老干预。