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公开(公告)号：CN105760711A
公开(公告)日：2016-07-13
申请号：CN201610072828.7
申请日：2016-02-02
Applicant: 江南大学
IPC: G06F19/18
CPC classification number: G16B20/00
Abstract: 本发明公开了一种使用KNN计算与相似性比对预测蛋白质亚细胞区间方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1、提取蛋白质序列数据集中所有蛋白质序列的AAC特征；步骤2、通过KNN算法，确定预测范围内的蛋白质序列集合；步骤3、进行Blast相似性比对计算，得到最高相似性序列；最高相似性序列所属的区间就是所预测序列的所属区间。本发明的预测准确率较高，尤其在传统方法预测准确率较低的亚细胞类上识别精度明显提高，对准确预测未知蛋白的亚细胞位置具有重要作用。
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