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公开(公告)号：CN108884485A
公开(公告)日：2018-11-23
申请号：CN201680084059.0
申请日：2016-03-31
IPC: C12Q1/04
CPC classification number: C12Q1/04 , Y02A50/451
Abstract: 一种微生物的识别方法，其特征在于，具有：对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤；从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤；识别步骤，基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有大肠杆菌、志贺氏菌属菌以及阿尔伯蒂埃希氏菌的哪一个菌种进行识别，使用13种核糖体蛋白质S5、L15、S13、L31、L22、L19、L20、L13、S15、L25、HNS、HdeB以及L29中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号：CN103890164A
公开(公告)日：2014-06-25
申请号：CN201280051541.6
申请日：2012-10-17
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 在基于对被检细胞进行质量分析而得到的结果来识别该被检细胞的种类的装置中，设为以下结构：设置上位DB(21)和下位DB(22)，其中，该上位DB(21)收录了记载有已知细胞的构成成分的离子质量的质量列表，该下位DB(22)收录了仅记载有上述离子质量中的各菌株特有的质量的部分质量列表，首先，使用根据被检细胞的质量分析结果制作出的被检质量列表来检索上位DB(21)，在基于该检索确定了在之后的检索中作为对象的生物种后，从上述被检细胞的质量列表删除上述生物种共有的质量，使用删除后的质量列表对下位DB(22)进行检索。由此，能够从遗传上亲缘相近的多个已知细胞中高精度地提取更加接近被检细胞的细胞。
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公开(公告)号：CN109313161B
公开(公告)日：2021-05-07
申请号：CN201680084370.5
申请日：2016-03-31
Abstract: 本发明的微生物的识别方法，其特征在于，具有：对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤；从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤；识别步骤，基于所述质荷比m/z，对所述试样所含的微生物含有沙门氏菌属菌的哪一种血清型的菌种进行识别，使用2种核糖体蛋白质S8、肽基脯氨酰异构酶中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号：CN110192106A
公开(公告)日：2019-08-30
申请号：CN201780083721.5
申请日：2017-11-09
Applicant: 株式会社岛津制作所
IPC: G01N27/62
Abstract: 样品分组部(24)对源自微生物的样品按照表示各样品的菌种/菌株的先验信息进行分组，差异解析部(27)使用基于分组结果制作出的峰矩阵来进行差异解析。另一方面，当操作者输入与微生物的耐药性相关联的组重组条件时，样品组重组/重组解除部(25)利用预先登记的每组的表示耐药性的其它先验信息，进行已经分出的组的选择、合并并对组进行重组。差异解析部(27)使用基于组重组结果新制作出的峰矩阵来进行差异解析。由此，能够随着变更组重组条件而依次获取不同的与耐药性相关联的差异解析结果。
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公开(公告)号：CN108931570B
公开(公告)日：2021-02-19
申请号：CN201810502048.0
申请日：2018-05-23
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 本发明的质谱分析数据解析装置以及质谱分析数据解析用程序即便在属于各组的样本的数量较少的情况下也会准确地选定表征组间的差异的标记波峰。根据从属于多个组的多个样本的质谱中检测到的波峰来制作波峰矩阵(S1～S3)。波峰矩阵的各行表示一个质荷比值下的大量样本相关的波峰的强度分布。若在某一质荷比值下组间无差异，则该质荷比值下的波峰强度分布应呈对数正态分布(或正态分布)。因此，针对每一质荷比值来执行波峰强度分布遵循对数正态分布这一情况的假设检验(S5)，将存在显著性差异的质荷比值选定为标记波峰的候选(S6)。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109154018A
公开(公告)日：2019-01-04
申请号：CN201680084038.9
申请日：2016-03-31
Abstract: 提供一种选定并使用标记蛋白质的微生物的识别方法，该标记蛋白质对李斯特菌属的菌种的再现性良好，并能够迅速地识别李斯特菌属的菌种。本发明的微生物的识别方法，其特征在于，具有：对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤；读取步骤，从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z；识别步骤，基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有李斯特菌的哪一个菌种进行识别，使用17种核糖体蛋白质L3、L4、L23、L2、L24、L6、L18、S5、L15、S13、S11、L10、L21、L13、S9、L31以及S16中的至少一种作为所述标记蛋白质，特别是使用所述17种中的8种核糖体蛋白质L24、L6、L18、L15、S11、S9、L31以及S16的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号：CN108931570A
公开(公告)日：2018-12-04
申请号：CN201810502048.0
申请日：2018-05-23
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 本发明的质谱分析数据解析装置以及质谱分析数据解析用程序即便在属于各组的样本的数量较少的情况下也会准确地选定表征组间的差异的标记波峰。根据从属于多个组的多个样本的质谱中检测到的波峰来制作波峰矩阵(S1～S3)。波峰矩阵的各行表示一个质荷比值下的大量样本相关的波峰的强度分布。若在某一质荷比值下组间无差异，则该质荷比值下的波峰强度分布应呈对数正态分布(或正态分布)。因此，针对每一质荷比值来执行波峰强度分布遵循对数正态分布这一情况的假设检验(S5)，将存在显著性差异的质荷比值选定为标记波峰的候选(S6)。
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公开(公告)号：CN115927528A
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202310106575.0
申请日：2016-03-31
IPC: C12Q1/04 , C12Q1/10 , G01N33/68 , G01N33/569 , G16B45/00 , G16B10/00 , G01N27/626
Abstract: 一种微生物的识别方法，其特征在于，具有：对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤；从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤；识别步骤，基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有大肠杆菌、志贺氏菌属菌以及阿尔伯蒂埃希氏菌的哪一个菌种进行识别，使用13种核糖体蛋白质S5、L15、S13、L31、L22、L19、L20、L13、S15、L25、HNS、HdeB以及L29中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号：CN110192106B
公开(公告)日：2021-09-28
申请号：CN201780083721.5
申请日：2017-11-09
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 样品分组部(24)对源自微生物的样品按照表示各样品的菌种/菌株的先验信息进行分组，差异解析部(27)使用基于分组结果制作出的峰矩阵来进行差异解析。另一方面，当操作者输入与微生物的耐药性相关联的组重组条件时，样品组重组/重组解除部(25)利用预先登记的每组的表示耐药性的其它先验信息，进行已经分出的组的选择、合并并对组进行重组。差异解析部(27)使用基于组重组结果新制作出的峰矩阵来进行差异解析。由此，能够随着变更组重组条件而依次获取不同的与耐药性相关联的差异解析结果。
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公开(公告)号：CN111028886A
公开(公告)日：2020-04-17
申请号：CN201910960315.3
申请日：2019-10-10
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 本发明提供一种质谱分析装置、质谱分析方法以及计算机可读介质。由教师数据获取部获取包含株已知的微生物的多个质谱数据中的各个质谱数据来作为教师数据。与各教师数据对应的样本在包含添加剂的同时混合有基质。通过进行机器学习，由模型制作部基于获取到的多个教师数据制作用于识别株的判别分析模型。由对象数据获取部获取包含株未知的微生物的质谱数据来作为对象数据。与对象数据对应的样本在包含添加剂的同时混合有基质。由识别部基于制作出的每种株的判别分析模型和获取到的对象数据来识别与该对象数据对应的微生物的株。
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