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公开(公告)号:CN108884485A
公开(公告)日:2018-11-23
申请号:CN201680084059.0
申请日:2016-03-31
IPC: C12Q1/04
CPC classification number: C12Q1/04 , Y02A50/451
Abstract: 一种微生物的识别方法,其特征在于,具有:对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤;识别步骤,基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有大肠杆菌、志贺氏菌属菌以及阿尔伯蒂埃希氏菌的哪一个菌种进行识别,使用13种核糖体蛋白质S5、L15、S13、L31、L22、L19、L20、L13、S15、L25、HNS、HdeB以及L29中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号:CN109313161B
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN201680084370.5
申请日:2016-03-31
Abstract: 本发明的微生物的识别方法,其特征在于,具有:对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤;识别步骤,基于所述质荷比m/z,对所述试样所含的微生物含有沙门氏菌属菌的哪一种血清型的菌种进行识别,使用2种核糖体蛋白质S8、肽基脯氨酰异构酶中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号:CN110192106A
公开(公告)日:2019-08-30
申请号:CN201780083721.5
申请日:2017-11-09
Applicant: 株式会社岛津制作所
IPC: G01N27/62
Abstract: 样品分组部(24)对源自微生物的样品按照表示各样品的菌种/菌株的先验信息进行分组,差异解析部(27)使用基于分组结果制作出的峰矩阵来进行差异解析。另一方面,当操作者输入与微生物的耐药性相关联的组重组条件时,样品组重组/重组解除部(25)利用预先登记的每组的表示耐药性的其它先验信息,进行已经分出的组的选择、合并并对组进行重组。差异解析部(27)使用基于组重组结果新制作出的峰矩阵来进行差异解析。由此,能够随着变更组重组条件而依次获取不同的与耐药性相关联的差异解析结果。
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公开(公告)号:CN108931570B
公开(公告)日:2021-02-19
申请号:CN201810502048.0
申请日:2018-05-23
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 本发明的质谱分析数据解析装置以及质谱分析数据解析用程序即便在属于各组的样本的数量较少的情况下也会准确地选定表征组间的差异的标记波峰。根据从属于多个组的多个样本的质谱中检测到的波峰来制作波峰矩阵(S1~S3)。波峰矩阵的各行表示一个质荷比值下的大量样本相关的波峰的强度分布。若在某一质荷比值下组间无差异,则该质荷比值下的波峰强度分布应呈对数正态分布(或正态分布)。因此,针对每一质荷比值来执行波峰强度分布遵循对数正态分布这一情况的假设检验(S5),将存在显著性差异的质荷比值选定为标记波峰的候选(S6)。
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公开(公告)号:CN109154018A
公开(公告)日:2019-01-04
申请号:CN201680084038.9
申请日:2016-03-31
Abstract: 提供一种选定并使用标记蛋白质的微生物的识别方法,该标记蛋白质对李斯特菌属的菌种的再现性良好,并能够迅速地识别李斯特菌属的菌种。本发明的微生物的识别方法,其特征在于,具有:对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;读取步骤,从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z;识别步骤,基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有李斯特菌的哪一个菌种进行识别,使用17种核糖体蛋白质L3、L4、L23、L2、L24、L6、L18、S5、L15、S13、S11、L10、L21、L13、S9、L31以及S16中的至少一种作为所述标记蛋白质,特别是使用所述17种中的8种核糖体蛋白质L24、L6、L18、L15、S11、S9、L31以及S16的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号:CN108931570A
公开(公告)日:2018-12-04
申请号:CN201810502048.0
申请日:2018-05-23
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 本发明的质谱分析数据解析装置以及质谱分析数据解析用程序即便在属于各组的样本的数量较少的情况下也会准确地选定表征组间的差异的标记波峰。根据从属于多个组的多个样本的质谱中检测到的波峰来制作波峰矩阵(S1~S3)。波峰矩阵的各行表示一个质荷比值下的大量样本相关的波峰的强度分布。若在某一质荷比值下组间无差异,则该质荷比值下的波峰强度分布应呈对数正态分布(或正态分布)。因此,针对每一质荷比值来执行波峰强度分布遵循对数正态分布这一情况的假设检验(S5),将存在显著性差异的质荷比值选定为标记波峰的候选(S6)。
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公开(公告)号:CN115927528A
公开(公告)日:2023-04-07
申请号:CN202310106575.0
申请日:2016-03-31
IPC: C12Q1/04 , C12Q1/10 , G01N33/68 , G01N33/569 , G16B45/00 , G16B10/00 , G01N27/626
Abstract: 一种微生物的识别方法,其特征在于,具有:对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤;识别步骤,基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有大肠杆菌、志贺氏菌属菌以及阿尔伯蒂埃希氏菌的哪一个菌种进行识别,使用13种核糖体蛋白质S5、L15、S13、L31、L22、L19、L20、L13、S15、L25、HNS、HdeB以及L29中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号:CN110192106B
公开(公告)日:2021-09-28
申请号:CN201780083721.5
申请日:2017-11-09
Applicant: 株式会社岛津制作所
Abstract: 样品分组部(24)对源自微生物的样品按照表示各样品的菌种/菌株的先验信息进行分组,差异解析部(27)使用基于分组结果制作出的峰矩阵来进行差异解析。另一方面,当操作者输入与微生物的耐药性相关联的组重组条件时,样品组重组/重组解除部(25)利用预先登记的每组的表示耐药性的其它先验信息,进行已经分出的组的选择、合并并对组进行重组。差异解析部(27)使用基于组重组结果新制作出的峰矩阵来进行差异解析。由此,能够随着变更组重组条件而依次获取不同的与耐药性相关联的差异解析结果。
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公开(公告)号:CN109313161A
公开(公告)日:2019-02-05
申请号:CN201680084370.5
申请日:2016-03-31
Abstract: 本发明的微生物的识别方法,其特征在于,具有:对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤;识别步骤,基于所述质荷比m/z,对所述试样所含的微生物含有沙门氏菌属菌的哪一种血清型的菌种进行识别,使用2种核糖体蛋白质S8、肽基脯氨酰异构酶中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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公开(公告)号:CN109154019A
公开(公告)日:2019-01-04
申请号:CN201680084073.0
申请日:2016-03-31
Abstract: 一种微生物的识别方法,其特征在于,具有:对含有微生物的试样进行质量分析从而得到质谱的步骤;从所述质谱读取源自标记蛋白质的峰的质荷比m/z的步骤;识别步骤,基于所述质荷比m/z对所述试样所含的微生物含有弯曲菌属菌的哪一个菌种进行识别,使用18种标记蛋白质S10、L23、S19、L22、L16、L29、S17、L14、L24、S14、L18、L15、L36、S13、S11(Me)、L32、L7/L12中的至少一种作为所述标记蛋白质。
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