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公开(公告)号：CN119811477A
公开(公告)日：2025-04-11
申请号：CN202411868076.6
申请日：2024-12-18
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明公开了一种高遗传信息SNP位点集合筛选方法、设备、介质及计算机程序产品。该筛选方法通过LD阈值及优化的K‑means模型划分相似性基因组区间，并应用方差剖析技术，筛选出划分区间内的代表性SNP位点；完成筛选后输出高遗传信息SNP位点集合。本发明提供可以实现该筛选方法的设备、介质及计算机程序产品。该筛选方法适用范围广，直接选择基因组遗传信息量最大的SNP位点集合，插补准确性高，大幅提高芯片位点有效性的同时，可有效降低设计生产成本。
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公开(公告)号：CN118376783A
公开(公告)日：2024-07-23
申请号：CN202410496958.8
申请日：2024-04-24
Applicant: 扬州大学 , 江苏省农业科学院 , 浙江中星畜牧科技有限公司
IPC: G01N33/569 , A01K67/02 , G01N33/58 , G01N15/14
Abstract: 本发明公开了一种筛选高细胞免疫应答能力奶牛的方法及应用，包括，采集奶牛初始血样；测定初始血样的细胞免疫指数；采集初始血样后当天(第0天)对奶牛进行肌肉注射模式抗原混合物2ml；第14天再次对奶牛进行肌肉注射模式抗原混合物2ml；第21天采集奶牛最终血样；测定最终血样的细胞免疫指数；计算注射模式抗原后细胞免疫指数增量；筛选奶牛经实验证明，本发明可以准确地在奶牛群中筛选出高细胞免疫应答能力的奶牛，管理人员可明确得知高细胞免疫应答能力奶牛并作为后备母牛进行留种，高细胞免疫应答能力的性状遗传力可达0.49‑0.51％，所筛选的“高免牛”体细胞数降低10万/mL以上、乳腺炎发病率下降59.08％、消化系统疾病发病率下降100％、犊牛腹泻下降88.08％。
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公开(公告)号：CN118376783B
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202410496958.8
申请日：2024-04-24
Applicant: 扬州大学 , 江苏省农业科学院 , 浙江中星畜牧科技有限公司
IPC: G01N33/569 , A01K67/02 , G01N33/58 , G01N15/14
Abstract: 本发明公开了一种筛选高细胞免疫应答能力奶牛的方法及应用，包括，采集奶牛初始血样；测定初始血样的细胞免疫指数；采集初始血样后当天(第0天)对奶牛进行肌肉注射模式抗原混合物2ml；第14天再次对奶牛进行肌肉注射模式抗原混合物2ml；第21天采集奶牛最终血样；测定最终血样的细胞免疫指数；计算注射模式抗原后细胞免疫指数增量；筛选奶牛经实验证明，本发明可以准确地在奶牛群中筛选出高细胞免疫应答能力的奶牛，管理人员可明确得知高细胞免疫应答能力奶牛并作为后备母牛进行留种，高细胞免疫应答能力的性状遗传力可达0.49‑0.51％，所筛选的“高免牛”体细胞数降低10万/mL以上、乳腺炎发病率下降59.08％、消化系统疾病发病率下降100％、犊牛腹泻下降88.08％。
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公开(公告)号：CN119580844A
公开(公告)日：2025-03-07
申请号：CN202411630793.5
申请日：2024-11-15
Applicant: 扬州大学 , 江苏省农业科学院 , 浙江中星畜牧科技有限公司
IPC: G16B30/10 , G16B20/20 , G06F18/10 , G06F18/214
Abstract: 本发明公开了一种中国南方奶牛高密度基因型插补面板的构建方法和应用。所述构建方法包括以下步骤：芯片数据处理、插补参考面板的选择、对原始数据进行质控、数据校正、插补面板构建。本发明构建了中国南方奶牛高密度基因型插补面板，提高了参考群体与目标群体的遗传相似性，有效提升了插补的准确性和效率，尤其是亲缘关系较近的群体表现出更高的准确性；插补过程中使用的数据包括10K和50K SNP芯片数据，表明该插补面板对不同数据类型具有广泛适应性，能够在不同类型的遗传数据中保持一致的性能，验证了插补面板的可靠性和实用性；通过两步插补流程可以更精细地补全数据，减少插补误差，提升插补效果。
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