公开(公告)号：CN112522249B

公开(公告)日：2023-11-14

申请号：CN202011334377.2

申请日：2020-11-25

Applicant: 扬州大学

Inventor： 张慧敏 ,  姜惠 ,  沈子亮 ,  杨章平 ,  邬敏辰 ,  毛永江 ,  李明勋 ,  陈志 ,  孙雨佳 ,  徐天乐

IPC: C12N11/18 ,  C12N11/16 ,  C12N9/42 ,  C12N9/24 ,  C07K19/00 ,  C12N15/81 ,  C12P19/14 ,  C12P19/00 ,  C12R1/865

Abstract: 本发明公开了一种催化活性提高的纤维小体及其组装方法和应用，属于生物技术领域。本发明利用大肠杆菌分别异源表达含对接模块的木聚糖酶AExynM‑Doc1以及含对接模块的葡聚糖酶EG1‑Doc2；利用酿酒酵母表面展示粘连蛋白Coh1‑Coh2，获得重组酵母EBY100/Coh1‑Coh2；将重组蛋白AExynM‑Doc1、EG1‑Doc2与重组酵母EBY100/Coh1‑Coh2混合，通过AExynM‑Doc1、EG1‑Doc2分别与Coh1、Coh2的结合，完成纤维小体的体外组装。本发明将具高催化活性的木聚糖酶、葡聚糖酶结合在纤维小体的脚手架蛋白中，大大提升了两种酶之间的协同催化作用，从而可以更有效地降解木质纤维素。

公开(公告)号：CN119851758A

公开(公告)日：2025-04-18

申请号：CN202411693247.6

申请日：2024-11-25

Applicant: 扬州大学

Inventor： 杨章平 ,  卢徐斌 ,  姜惠 ,  赵天奇 ,  孙雨佳 ,  杨奕

IPC: G16B30/00 ,  G16B20/20 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明公开了一种可高效应用于SNP芯片、低覆盖率基因组测序及转录组测序等数据的基因型插补方法包括，构建插补数据平台，捕获测序数据处理及SNP，进行芯片数据处理及RNA‑Seq数据处理；确定插补准确性指标，构建定相和插补的软件组合，进行全基因组关联分析；输出分析结果。本方法考虑到不同数据类型的独有特点和动物的亲缘关系。通过本方法，可以更精确地插补三种数据类型，从而为科研和育种提供更为可靠的科学依据。

公开(公告)号：CN119580844A

公开(公告)日：2025-03-07

申请号：CN202411630793.5

申请日：2024-11-15

Applicant: 扬州大学 ,  江苏省农业科学院 ,  浙江中星畜牧科技有限公司

Inventor： 杨章平 ,  姜惠 ,  卢徐斌 ,  张志鹏 ,  杨奕 ,  赵天奇 ,  张慧敏 ,  王慧利 ,  夏淑雯 ,  尹彤

IPC: G16B30/10 ,  G16B20/20 ,  G06F18/10 ,  G06F18/214

Abstract: 本发明公开了一种中国南方奶牛高密度基因型插补面板的构建方法和应用。所述构建方法包括以下步骤：芯片数据处理、插补参考面板的选择、对原始数据进行质控、数据校正、插补面板构建。本发明构建了中国南方奶牛高密度基因型插补面板，提高了参考群体与目标群体的遗传相似性，有效提升了插补的准确性和效率，尤其是亲缘关系较近的群体表现出更高的准确性；插补过程中使用的数据包括10K和50K SNP芯片数据，表明该插补面板对不同数据类型具有广泛适应性，能够在不同类型的遗传数据中保持一致的性能，验证了插补面板的可靠性和实用性；通过两步插补流程可以更精细地补全数据，减少插补误差，提升插补效果。

公开(公告)号：CN119811477A

公开(公告)日：2025-04-11

申请号：CN202411868076.6

申请日：2024-12-18

Applicant: 扬州大学

Inventor： 杨章平 ,  卢徐斌 ,  赵天奇 ,  姜惠 ,  张志鹏 ,  王慧利 ,  夏淑雯

IPC: G16B20/20 ,  G16B25/00

Abstract: 本发明公开了一种高遗传信息SNP位点集合筛选方法、设备、介质及计算机程序产品。该筛选方法通过LD阈值及优化的K‑means模型划分相似性基因组区间，并应用方差剖析技术，筛选出划分区间内的代表性SNP位点；完成筛选后输出高遗传信息SNP位点集合。本发明提供可以实现该筛选方法的设备、介质及计算机程序产品。该筛选方法适用范围广，直接选择基因组遗传信息量最大的SNP位点集合，插补准确性高，大幅提高芯片位点有效性的同时，可有效降低设计生产成本。

公开(公告)号：CN112522249A

公开(公告)日：2021-03-19

申请号：CN202011334377.2

申请日：2020-11-25

Applicant: 扬州大学

Inventor： 张慧敏 ,  姜惠 ,  沈子亮 ,  杨章平 ,  邬敏辰 ,  毛永江 ,  李明勋 ,  陈志 ,  孙雨佳 ,  徐天乐

IPC: C12N11/18 ,  C12N11/16 ,  C12N9/42 ,  C12N9/24 ,  C07K19/00 ,  C12N15/81 ,  C12P19/14 ,  C12P19/00 ,  C12R1/865

Abstract: 本发明公开了一种催化活性提高的纤维小体及其组装方法和应用，属于生物技术领域。本发明利用大肠杆菌分别异源表达含对接模块的木聚糖酶AExynM‑Doc1以及含对接模块的葡聚糖酶EG1‑Doc2；利用酿酒酵母表面展示粘连蛋白Coh1‑Coh2，获得重组酵母EBY100/Coh1‑Coh2；将重组蛋白AExynM‑Doc1、EG1‑Doc2与重组酵母EBY100/Coh1‑Coh2混合，通过AExynM‑Doc1、EG1‑Doc2分别与Coh1、Coh2的结合，完成纤维小体的体外组装。本发明将具高催化活性的木聚糖酶、葡聚糖酶结合在纤维小体的脚手架蛋白中，大大提升了两种酶之间的协同催化作用，从而可以更有效地降解木质纤维素。