公开(公告)号：CN110268474B

公开(公告)日：2023-03-31

申请号：CN201880010803.1

申请日：2018-02-01

Applicant: 微软技术许可有限责任公司

Inventor： 陈圆觉 ,  L·H·塞兹 ,  S·耶卡尼恩 ,  S·D·安格 ,  K·施特劳斯

IPC: G16B30/00

Abstract: 本公开的实施例涉及用于所存储的多核苷酸的取回的引物设计，描述了用于提高存储在多核苷酸序列数据存储系统中的数据的随机存取的准确性的技术。用于多核苷酸序列复制和扩增的引物可以对照多个准则进行评分，多个准则指示核苷酸序列用作引物的适合性。具有指示用作引物的特定适合性的得分的引物可以被添加到特定的一组引物中。来自一组引物的引物可以用于编码数字数据的多核苷酸序列的扩增和复制。另外，可以确定引物靶与编码数字数据的有效载荷之间的重叠量。最小化引物靶与有效载荷之间的重叠量可以提高多核苷酸复制和扩增的效率。可以随机化数字数据的位以最小化编码数字数据的有效载荷与引物靶之间的重叠量。

公开(公告)号：CN110268474A

公开(公告)日：2019-09-20

申请号：CN201880010803.1

申请日：2018-02-01

Applicant: 微软技术许可有限责任公司

Inventor： 陈圆觉 ,  L·H·塞兹 ,  S·耶卡尼恩 ,  S·D·安格 ,  K·施特劳斯

IPC: G16B30/00

Abstract: 本公开描述了用于提高存储在多核苷酸序列数据存储系统中的数据的随机存取的准确性的技术。用于多核苷酸序列复制和扩增的引物可以对照多个准则进行评分，多个准则指示核苷酸序列用作引物的适合性。具有指示用作引物的特定适合性的得分的引物可以被添加到特定的一组引物中。来自一组引物的引物可以用于编码数字数据的多核苷酸序列的扩增和复制。另外，可以确定引物靶与编码数字数据的有效载荷之间的重叠量。最小化引物靶与有效载荷之间的重叠量可以提高多核苷酸复制和扩增的效率。可以随机化数字数据的位以最小化编码数字数据的有效载荷与引物靶之间的重叠量。

公开(公告)号：CN109804565A

公开(公告)日：2019-05-24

申请号：CN201780060694.X

申请日：2017-09-25

Applicant: 微软技术许可有限责任公司

Inventor： L·策泽 ,  S·耶卡尼恩 ,  S·D·安格 ,  K·施特劳斯 ,  C·拉施特奇安 ,  R·坎南 ,  K·玛卡彻夫

IPC: H03M7/30

Abstract: 描述了用于将来自多核苷酸测序的DNA读段进行聚类的技术。具有可能由测序中的错误引起的一定水平差异的DNA读段被一起分组在相同簇中。表示不同DNA分子的读段的DNA读段被放置在不同簇中。簇基于编辑距离，其是用以将给定DNA读段转换成另一DNA读段所需的改变的数目。形成簇的过程可以被迭代地执行并且可以使用用作针对编辑距离的近似的其他类型的距离。良好聚类的DNA读段提供用于进一步分析的起始点。

公开(公告)号：CN110268473B

公开(公告)日：2023-11-07

申请号：CN201880010811.6

申请日：2018-02-02

Applicant: 微软技术许可有限责任公司

Inventor： 陈圆觉 ,  K·施特劳斯 ,  L·H·塞兹 ,  S·D·安格 ,  S·耶卡尼恩

IPC: G16B25/00

Abstract: 本公开描述了用于提高存储在多核苷酸序列数据存储系统中的数据的随机存取的准确性的技术。用于多核苷酸序列复制和扩增的引物可以对照多个准则进行评分，多个准则指示核苷酸序列用作引物的适合性。具有指示用作引物的特定适合性的得分的引物可以被添加到特定的一组引物中。来自一组引物的引物可以用于编码数字数据的多核苷酸序列的扩增和复制。另外，可以确定引物靶与编码数字数据的有效载荷之间的重叠量。最小化引物靶与有效载荷之间的重叠量可以提高多核苷酸复制和扩增的效率。可以随机化数字数据的位以最小化编码数字数据的有效载荷与引物靶之间的重叠量。

公开(公告)号：CN109804565B

公开(公告)日：2023-06-13

申请号：CN201780060694.X

申请日：2017-09-25

Applicant: 微软技术许可有限责任公司

Inventor： L·策泽 ,  S·耶卡尼恩 ,  S·D·安格 ,  K·施特劳斯 ,  C·拉施特奇安 ,  R·坎南 ,  K·玛卡彻夫

IPC: H03M7/30

Abstract: 描述了用于将来自多核苷酸测序的DNA读段进行聚类的技术。具有可能由测序中的错误引起的一定水平差异的DNA读段被一起分组在相同簇中。表示不同DNA分子的读段的DNA读段被放置在不同簇中。簇基于编辑距离，其是用以将给定DNA读段转换成另一DNA读段所需的改变的数目。形成簇的过程可以被迭代地执行并且可以使用用作针对编辑距离的近似的其他类型的距离。良好聚类的DNA读段提供用于进一步分析的起始点。

公开(公告)号：CN110268473A

公开(公告)日：2019-09-20

申请号：CN201880010811.6

申请日：2018-02-02

Applicant: 微软技术许可有限责任公司

Inventor： 陈圆觉 ,  K·施特劳斯 ,  L·H·塞兹 ,  S·D·安格 ,  S·耶卡尼恩

IPC: G16B25/00

Abstract: 本公开描述了用于提高存储在多核苷酸序列数据存储系统中的数据的随机存取的准确性的技术。用于多核苷酸序列复制和扩增的引物可以对照多个准则进行评分，多个准则指示核苷酸序列用作引物的适合性。具有指示用作引物的特定适合性的得分的引物可以被添加到特定的一组引物中。来自一组引物的引物可以用于编码数字数据的多核苷酸序列的扩增和复制。另外，可以确定引物靶与编码数字数据的有效载荷之间的重叠量。最小化引物靶与有效载荷之间的重叠量可以提高多核苷酸复制和扩增的效率。可以随机化数字数据的位以最小化编码数字数据的有效载荷与引物靶之间的重叠量。