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公开(公告)号:CN109360606A
公开(公告)日:2019-02-19
申请号:CN201811373098.X
申请日:2018-11-19
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
IPC: G16B25/00 , G16B20/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及基因组测序技术领域,特别涉及一种低密度SNP基因组区域准确预测BSA-seq候选基因的方法,本发明针对BSA-seq在候选区间附近有低密度SNP区域,通过比价两亲本间的SNP,对SNP列表进行严格过滤,找出低密度区域,然后利用置信区间为95%时对应的候选区间加上低密度候选区间,利用基因组注释网站对候选区域内的基因进行注释;对候选区域变异位点功能注释,得到存在移码变异等功能性变异的基因,并确定该基因为候选基因;使用本发明的方法能弥补由于基因组差异小的区域而造成的候选区域的假阳性,获得真正的候选区间。
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公开(公告)号:CN104450694B
公开(公告)日:2017-08-11
申请号:CN201410683130.X
申请日:2014-11-24
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
Abstract: 本发明提供了抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV6及其分子标记方法,利用广西普通野生稻材料y11与感病品种广恢998杂交、回交和自交获得的BC3F7进行关联分析和遗传连锁分析,获得抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV6,其位于分子标记RM20148‑RM20297之间,分子标记RM20148引物,存在qSRBSDV6时扩增条带为129bp条带;分子标记RM20297引物,存在qSRBSDV6时扩增条带为172bp条带。本发明可通过抗南方水稻黑条矮缩病基因的分子标记来检测抗性材料y11及其衍生品种(系)中是否含有南方水稻黑条矮缩病抗性基因位点,可预测其南方水稻黑条矮缩病抗性水平,大大提高抗南方水稻黑条矮缩病水稻的选择效率。
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公开(公告)号:CN105331619A
公开(公告)日:2016-02-17
申请号:CN201510880349.3
申请日:2015-12-03
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
Abstract: 本发明属于分子遗传学技术领域,具体的说是涉及一种扩增水稻香味基因Badh2序列的方法。一种扩增水稻香味基因Badh2序列的方法,包括以下步骤:(1)由如序列表SEQ ID No.1-26所示序列的特异性引物组;(2)经过碱基的取代、缺失或添加;(3)在PCR扩增体系中经过聚合酶链式反应得到水稻香味基因Badh2序列。本发明的方法具有简单、快速、技术要求较低、结果鉴定准确的优点;可用于鉴定水稻香稻品种与水稻非香稻品种;也可用于定向培育水稻香稻品种基因型的鉴定,可用于常规稻和育种中间材料的基因型鉴定中,在分子标记定向培育香稻品种各环节中起到重要作用。
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公开(公告)号:CN108913795A
公开(公告)日:2018-11-30
申请号:CN201810597031.8
申请日:2018-06-11
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明属于植物分子遗传学领域,涉及抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV9及其分子标记方法。抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV9及其分子标记方法,利用水稻抗病品系D4与感病品种广恢998杂交和自交获得的F2群体进行关联分析和遗传连锁分析,获得抗南方水稻黑条矮缩病位点qSRBSDV9,其位于分子标记Indel32-Indel35之间,分子标记Indel32引物,存在qSRBSDV9时扩增条带为111bp条带;分子标记Indel35引物,存在qSRBSDV9时扩增条带为147bp条带。本发明可通过抗南方水稻黑条矮缩病基因的分子标记来检测抗性材料D4及其衍生品种(系)中是否含有抗南方水稻黑条矮缩病基因位点,可预测其南方水稻黑条矮缩病抗性水平,大大提高抗南方水稻黑条矮缩病水稻的选择效率。
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公开(公告)号:CN106766747A
公开(公告)日:2017-05-31
申请号:CN201611263988.6
申请日:2016-12-30
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
CPC classification number: F26B9/10 , F26B25/063 , F26B25/185
Abstract: 本发明属于晾干装置领域,具体的提供了一种DNA晾干架。所述DNA晾干架包括支架和晾干板,所述晾干板两侧的中部通过支撑杆与支架铰接,所述支架上还铰接有固定晾干板用的定位扣;所述晾干板上间隔安装有若干钉子,所述钉子仅部分安装在晾干板内。所述晾干板可做成多层,可更好地利用空间;所述钉子可选用不同高度的钉子,以适应不同规格DNA的晾晒。本发明的晾干板可相对支架转动,可当晾干架使用,也可将晾干板翻转过来,当普通的架子使用,满足不同操作需求,提高晾干板的使用效率。
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公开(公告)号:CN106755413B
公开(公告)日:2020-07-07
申请号:CN201611205166.2
申请日:2016-12-23
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种水稻氮素吸收利用位点qNUE6及其分子标记方法,所述水稻氮素吸收利用位点qNUE6位于分子标记NUE2和NUE23之间的一个位点;所述分子标记NUE2引物:SEQ ID NO.1,存在qNUE6时的扩增条带为135bp条带。本发明可通过水稻氮素吸收利用位点qNUE6的分子标记来检测氮素高效吸收利用品种广恢998(以下简称GH998)及其衍生品种(系)中是否含有氮素吸收利用基因位点,可预测其氮素吸收利用水平,大大提高氮素高效吸收利用水稻的选择效率。
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公开(公告)号:CN107991442A
公开(公告)日:2018-05-04
申请号:CN201711444206.3
申请日:2017-12-27
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
Abstract: 本发明属于培养架技术领域,具体提供一种鉴定架及包含其的水稻苗期纹枯病鉴定装置。一种鉴定架,包括带支脚和隔板的方形架体,架体两侧设有连接杆,架体上与连接杆相邻的侧面设有支撑杆,支撑杆上设有通孔和与通孔相匹配的支撑插块;隔板两侧的中部通过连接杆与架体铰接,隔板一端架设于支撑插块上,隔板上间隔设置有突起状隔条,隔条平行于所述连接杆;架体上、支脚上方还设有向架体外延伸的膜杆,膜杆上设有分别平行于架体相邻两个侧面第一膜杆和第二膜杆。本鉴定架的隔板可调节,便于观察鉴定架内侧的作物生长情况;膜杆等结构的设置,便于将薄膜罩在鉴定架上,方便调节鉴定架内的温度和湿度。
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公开(公告)号:CN109360606B
公开(公告)日:2019-09-06
申请号:CN201811373098.X
申请日:2018-11-19
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
IPC: G16B25/00 , G16B20/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及基因组测序技术领域,特别涉及一种低密度SNP基因组区域准确预测BSA‑seq候选基因的方法,本发明针对BSA‑seq在候选区间附近有低密度SNP区域,通过比价两亲本间的SNP,对SNP列表进行严格过滤,找出低密度区域,然后利用置信区间为95%时对应的候选区间加上低密度候选区间,利用基因组注释网站对候选区域内的基因进行注释;对候选区域变异位点功能注释,得到存在移码变异等功能性变异的基因,并确定该基因为候选基因;使用本发明的方法能弥补由于基因组差异小的区域而造成的候选区域的假阳性,获得真正的候选区间。
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公开(公告)号:CN106011149B
公开(公告)日:2018-09-21
申请号:CN201610579097.5
申请日:2016-07-21
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种水稻黑色种皮基因qBP3、分子标记引物及分子标记方法,所述水稻黑色种皮基因qBP3在水稻第3染色体20.4‑20.6Mb的区间内,所述水稻黑色种皮基因qBP3控制水稻黑色种皮颜色变化。本发明通过鉴定了一个新的黑色种皮基因qBP3,获得了与其紧密连锁的基于PCR的InDel分子标记IDBP3‑1,该标记可以有效进行水稻黑色种皮的辅助选择,主要用于水稻外观品质的辅助选择;本发明的分子标记引物可以在苗期对自然群体或杂交低世代群体在各种环境条件下进行基因型选择,保留带有基因qBP3的杂合或纯合的个体做进一步杂交,提高了水稻性状改良中选择的准确性和效率,加快育种进程。
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公开(公告)号:CN106755413A
公开(公告)日:2017-05-31
申请号:CN201611205166.2
申请日:2016-12-23
Applicant: 广西壮族自治区农业科学院水稻研究所
Abstract: 本发明公开了一种水稻氮素吸收利用位点qNUE6及其分子标记方法,所述水稻氮素吸收利用位点qNUE6位于分子标记NUE2和NUE23之间的一个位点;所述分子标记NUE2引物:SEQ ID NO.1,存在qNUE6时的扩增条带为135bp条带。本发明可通过水稻氮素吸收利用位点qNUE6的分子标记来检测氮素高效吸收利用品种广恢998(以下简称GH998)及其衍生品种(系)中是否含有氮素吸收利用基因位点,可预测其氮素吸收利用水平,大大提高氮素高效吸收利用水稻的选择效率。
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