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公开(公告)号:CN118866074A
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202410837092.2
申请日:2024-06-26
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东科环生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种结合机器学习和MALDI‑TOF MS的幽门螺杆菌耐药诊断系统。该系统基于我国的HP临床菌株MALDI‑TOF MS蛋白组学数据库,利用LightGBM算法分别构建了菌株对于克拉霉素和左氧氟沙星两种抗生素耐药的机器学习预测模型,模型对于克拉霉素和左氧氟沙星的AUROC分别为0.82和0.86,accuracy分别为0.75和0.72。HP_res_pred通过对HP的多张蛋白指纹图谱数据分别调用模型、智能统计并输出耐药预测结果。与现有技术相比,HP_res_pred系统具有耗时短、成本低、菌株用量少、同时可检测两种药物耐药性、预测准确性高及操作简便等优势,应用前景巨大。
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公开(公告)号:CN114214438B
公开(公告)日:2024-02-02
申请号:CN202111491208.4
申请日:2021-12-08
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司 , 广东科环生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6883 , A61K45/00 , A61P1/16 , A23L33/10
Abstract: 本发明公开了胆道菌群检测在预测胆道结石术后早期复发中的应用。所述的胆道菌群标志物为乳杆菌目(Lactobacillale)、梭杆菌目(Fusobacteriales)或奈氏球菌目(Neisseriales)。本发明提供一种预测胆道结石术后早期复发的微生物标志物,可用于预测胆道结石术后复发风险的辅助诊断,检测特异性好,灵敏度高,具有指示胆道微生物菌群的状况,指
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公开(公告)号:CN114350578B
公开(公告)日:2022-05-27
申请号:CN202210263672.6
申请日:2022-03-17
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司 , 广东科环生物科技有限公司
IPC: C12N1/20 , C12Q1/689 , C12N15/11 , C12N9/24 , A61K35/747 , A61P31/04 , A61P1/00 , A23L33/135 , C12R1/25
Abstract: 本发明公开了一株产溶菌酶并高效拮抗多药耐药幽门螺杆菌的植物乳杆菌LP1Z及其应用。植物乳杆菌LP1Z,其于2022年2月21日保藏于广东省微生物菌种保藏中心,地址:广东省广州市先烈中路100号大院59号楼5楼,邮编:510070,保藏编号为GDMCC No:62256。(1)本发明中所涉及的益生菌能够产生有机酸、溶菌酶等多种活性抗菌物质,能够有效抑制胃部幽门螺杆菌的生长;(2)在胃部存活率高,能够在胃部定植,体内能够与致病菌竞争结合位点,有效降低胃部幽门螺杆菌的感染率;(3)能够改善胃部病理状态,缓解炎症。因此,植物乳杆菌LP1Z在制备预防或治疗Hp尤其是多药耐药Hp感染的产品(如药品)中,具有巨大的应用前景。
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公开(公告)号:CN114350578A
公开(公告)日:2022-04-15
申请号:CN202210263672.6
申请日:2022-03-17
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司 , 广东科环生物科技有限公司
IPC: C12N1/20 , C12Q1/689 , C12N15/11 , C12N9/24 , A61K35/747 , A61P31/04 , A61P1/00 , A23L33/135 , C12R1/25
Abstract: 本发明公开了一株产溶菌酶并高效拮抗多药耐药幽门螺杆菌的植物乳杆菌LP1Z及其应用。植物乳杆菌LP1Z,其于2022年2月21日保藏于广东省微生物菌种保藏中心,地址:广东省广州市先烈中路100号大院59号楼5楼,邮编:510070,保藏编号为GDMCC No:62256。(1)本发明中所涉及的益生菌能够产生有机酸、溶菌酶等多种活性抗菌物质,能够有效抑制胃部幽门螺杆菌的生长;(2)在胃部存活率高,能够在胃部定植,体内能够与致病菌竞争结合位点,有效降低胃部幽门螺杆菌的感染率;(3)能够改善胃部病理状态,缓解炎症。因此,植物乳杆菌LP1Z在制备预防或治疗Hp尤其是多药耐药Hp感染的产品(如食品、药品和保健品等)中,具有巨大的应用前景。
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公开(公告)号:CN114214438A
公开(公告)日:2022-03-22
申请号:CN202111491208.4
申请日:2021-12-08
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司 , 广东科环生物科技有限公司
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6883 , A61K45/00 , A61P1/16 , A23L33/10
Abstract: 本发明公开了胆道菌群检测在预测胆道结石术后早期复发中的应用。所述的胆道菌群标志物为乳杆菌目(Lactobacillale)、梭杆菌目(Fusobacteriales)或奈氏球菌目(Neisseriales)。本发明提供一种预测胆道结石术后早期复发的微生物标志物,可用于预测胆道结石术后复发风险的辅助诊断,检测特异性好,灵敏度高,具有指示胆道微生物菌群的状况,指导胆道微生态的调整以降低胆道结石手术治疗后的疾病复发率。
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公开(公告)号:CN113667767B
公开(公告)日:2023-11-03
申请号:CN202110941380.9
申请日:2021-08-17
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司 , 广东科环生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了快速、高通量检测幽门螺旋杆菌耐药性的方法。分离获取幽门螺旋杆菌样品,对幽门螺旋杆菌进行如下检测:检测克拉霉素耐药基因23S rRNA的突变位点:109G→A、2056A→G、2095T→C、2834C→T和蛋白infB的突变位点794Glu→Asp,如发生任一突变则幽门螺旋杆菌具有克拉霉素耐药性。本发明经研究发现现有的检测方案不能准确地预测HP中国流行株对抗生素的耐药情况,因此发明人建立了首个基于HP中国流行株耐药基因的分子表征库信息的基因‑表征关联模型,提出基于该模型的新型快速、高通量HP耐药检测方案。与现有技术相比,本发明能更精准地协助临床医生快速预测我国HP的耐药表型。
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公开(公告)号:CN113667767A
公开(公告)日:2021-11-19
申请号:CN202110941380.9
申请日:2021-08-17
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司 , 广东科环生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了快速、高通量检测幽门螺旋杆菌耐药性的方法。分离获取幽门螺旋杆菌样品,对幽门螺旋杆菌进行如下检测:检测克拉霉素耐药基因23S rRNA的突变位点:109G→A、2056A→G、2095T→C、2834C→T和蛋白infB的突变位点794Glu→Asp,如发生任一突变则幽门螺旋杆菌具有克拉霉素耐药性。本发明经研究发现现有的检测方案不能准确地预测HP中国流行株对抗生素的耐药情况,因此发明人建立了首个基于HP中国流行株耐药基因的分子表征库信息的基因‑表征关联模型,提出基于该模型的新型快速、高通量HP耐药检测方案。与现有技术相比,本发明能更精准地协助临床医生快速预测我国HP的耐药表型。
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公开(公告)号:CN117660238A
公开(公告)日:2024-03-08
申请号:CN202311645812.7
申请日:2023-12-04
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东科环生物科技有限公司
IPC: C12N1/20 , A61K35/744 , A61P31/04 , C12Q1/689 , C12R1/46
Abstract: 本发明公开了一株产细菌素GarQ并高效拮抗多药耐药幽门螺杆菌的格氏乳球菌LG3092及其应用。格氏乳球菌LG3092于2023年10月30日保藏于广东省微生物菌种保藏中心,保藏编号为GDMCC No:63939。经研究发现LG3092的有益效果为:(1)能够产生细菌素GarQ,能够有效抑制幽门螺杆菌及其他常见致病菌的生长;(2)在胃部存活率高,能够在胃部定植,体内能够与致病菌竞争结合位点,有效降低胃部幽门螺杆菌的感染率;(3)能够改善胃部病理状态,缓解炎症。因此,格氏乳球菌LG3092在制备预防或治疗Hp尤其是多药耐药Hp感染的产品中,具有巨大的应用前景。
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公开(公告)号:CN117210434A
公开(公告)日:2023-12-12
申请号:CN202310435555.8
申请日:2023-04-21
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东科环生物科技有限公司 , 广东环凯生物科技有限公司
IPC: C12N9/14 , C12N15/55 , C12N1/21 , C12N15/70 , A01N63/50 , A01P1/00 , C11D3/48 , C11D9/50 , C11D11/00 , A23L33/195 , A23K20/147 , A61K38/46 , A61P31/04 , A61P1/00 , A61K8/66 , A61Q19/00 , C12R1/19
Abstract: 本发明公开了一种源于植物乳杆菌的新型抗菌蛋白LP1Z_01335及其应用。所述抗菌蛋白LP1Z_01335的氨基酸序列如SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.4所示,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2或密码子优化后的SEQ ID NO.3所示。抗菌蛋白LP1Z_01335能拮抗金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、幽门螺旋杆菌及多药耐药幽门螺旋杆菌。与传统抗幽门螺旋杆菌的抗生素类药物相比,本发明具有对生态环境无毒副作用、无残留风险,绿色安全的优势。本发明的抗菌蛋白制剂具有更宽的pH、高温耐受性和酶稳定性,能适应更多的应用场景,在体外的抗菌消毒、体内的药物、食品、保健品等应用中具有很大潜力。
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公开(公告)号:CN113186136B
公开(公告)日:2022-06-14
申请号:CN202110612046.9
申请日:2021-06-02
Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种多重耐药的幽门螺旋杆菌及其应用。本发明提供了耐阿莫西林、克拉霉素、左氧氟沙星、甲硝唑、四环素等五种抗生素的幽门螺旋杆菌(Helicobacterpylori)GZ6B5,保藏号GDMCC No:61571。本发明提供了一种明确携带2种多药耐药基因hp1181及hp1184的多重耐药靶向菌株,该菌对目前临床获批用于治疗幽门螺旋杆菌的5种抗生素全部耐受,可作为筛选新型功能微生物、药物及抗菌材料中的靶向菌株,具有良好的应用前景。
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