一种基于KASP技术开发的荔枝种胚性状SNP分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN116732223A

    公开(公告)日:2023-09-12

    申请号:CN202310657297.8

    申请日:2023-06-05

    Abstract: 本发明属于分子生物工程的技术领域,具体涉及一种基于KASP技术开发的荔枝种胚性状SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记位于荔枝第1号染色体第41766403bp碱基,该处碱基为G或C,若该处碱基为C基因型则判断荔枝种胚性状为大核或焦核率低的品种,若该处碱基为G基因型则判断荔枝种胚性状为焦核型或小核型。通过利用荔枝资源的基因组重测序数据,进行连锁不平衡分析和全基因组关联分析,结合田间表型数据,定位到群体中焦核性状显著相关的SNP位点,继而利用KASP基因分型方法,开发出一种通用稳定的SNP分子标记。利用本发明SNP分子标记在苗期即可快速、准确的判断目标荔枝种胚性状,筛选出所需性状的种质资源。

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