公开(公告)号：CN113160880B

公开(公告)日：2023-06-06

申请号：CN202110295353.9

申请日：2021-03-19

Applicant: 广东工业大学

Inventor： 林志毅 ,  朱印廷 ,  顾国生 ,  孙宇平 ,  谢国波

IPC: G16B20/00 ,  G16C20/50 ,  G16H50/20

Abstract: 本发明提供一种基于高阶接近性和矩阵补全算法的lncRNA‑疾病关联预测方法，包括以下步骤：S1：计算lncRNA相似矩阵LS和疾病相似矩阵DS的高阶接近矩阵；S2：获取疾病‑lncRNA邻接矩阵DL，所述疾病‑lncRNA邻接矩阵用于描述lncRNA‑疾病关联关系；S3：构建一个异构性的疾病‑lncRNA关联矩阵，所述疾病‑lncRNA关联矩阵整合了疾病‑lncRNA邻接矩阵DL、lncRNA相似矩阵LS的高阶接近矩阵和疾病相似矩阵DS的高阶接近矩阵；S4：采用矩阵补全法，在所述疾病‑lncRNA关联矩阵中预测lncRNA‑疾病的关联。本发明引入高阶接近性来重构lncRNA和疾病的相似度矩阵，建立一个更好的度量标准来精确描述药物或疾病之间的相似关系，采用构建异构矩阵来利用lncRNA和疾病的相似度信息来辅助预测，实现了更加准确的lncRNA‑疾病的关联预测。

公开(公告)号：CN113160880A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110295353.9

申请日：2021-03-19

Applicant: 广东工业大学

Inventor： 林志毅 ,  朱印廷 ,  顾国生 ,  孙宇平 ,  谢国波

IPC: G16B20/00 ,  G16C20/50 ,  G16H50/20

Abstract: 本发明提供一种基于高阶接近性和矩阵补全算法的lncRNA‑疾病关联预测方法，包括以下步骤：S1：计算lncRNA相似矩阵LS和疾病相似矩阵DS的高阶接近矩阵；S2：获取疾病‑lncRNA邻接矩阵DL，所述疾病‑lncRNA邻接矩阵用于描述lncRNA‑疾病关联关系；S3：构建一个异构性的疾病‑lncRNA关联矩阵，所述疾病‑lncRNA关联矩阵整合了疾病‑lncRNA邻接矩阵DL、lncRNA相似矩阵LS的高阶接近矩阵和疾病相似矩阵DS的高阶接近矩阵；S4：采用矩阵补全法，在所述疾病‑lncRNA关联矩阵中预测lncRNA‑疾病的关联。本发明引入高阶接近性来重构lncRNA和疾病的相似度矩阵，建立一个更好的度量标准来精确描述药物或疾病之间的相似关系，采用构建异构矩阵来利用lncRNA和疾病的相似度信息来辅助预测，实现了更加准确的lncRNA‑疾病的关联预测。