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公开(公告)号:CN116935959A
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202310477930.5
申请日:2023-04-25
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 全国畜牧总站
Inventor: 王金鹏 , 黄金明 , 鞠志花 , 王秀革 , 高亚平 , 刘文浩 , 杨春红 , 肖遥 , 张亚冉 , 魏晓超 , 姜强 , 张桂香 , 刘丑生 , 邱小田 , 李姣 , 李广栋
Abstract: 本发明属于基因测序领域,提供了一种Sanger基因测序结果快速判读方法、系统及介质。其中,Sanger基因测序结果快速判读方法包括获取Sanger基因测序文件,基于所述测序文件提取每个测序位点的四个碱基的信号值,判断每个测序位点的纯合或杂合状态,生成主要序列和次要序列;获取配置文件信息,根据靶位点的锚定序列在主序列中定位靶位点的位置,进而确定出靶位点的纯合或杂合状态并提取出主要序列和次要序列中的靶位点碱基,得到靶位点的基因型;根据靶位点的基因型及靶位点的位置,输出基因型或氨基酸报告。
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公开(公告)号:CN117025797B
公开(公告)日:2025-04-11
申请号:CN202311211912.9
申请日:2023-09-19
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与奶牛乳房炎抗性相关的SNP分子标记及其应用,属于奶牛育种标记物领域。本发明提供的与奶牛乳房炎抗性相关的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,多态性位点位于如SEQ ID No.1所示序列的第129位,多态性为C或T。该分子标记能够在不同遗传背景下准确预测奶牛乳房炎抗性特性,可用于鉴别高乳房炎抗性性状的奶牛,提高分子设计育种的效率。且根据上述SNP位点的鉴定结果,养殖人员可以选择有利的基因型个体留种,从而改善奶牛群体的乳房炎抗性性状,提高奶牛群体的乳房炎抗性,降低治疗成本,提高牧场经济效益。
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公开(公告)号:CN119639750A
公开(公告)日:2025-03-18
申请号:CN202510179498.0
申请日:2025-02-19
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC: C12N15/113 , C12N15/85
Abstract: 本发明公开了干扰PTPN21基因表达的shRNA及其应用,编码所述shRNA的DNA序列如SEQ ID NO.1(GCAGGAGATCACCAGGTAT)或SEQ ID NO.2(GGAGGTAGAGAGAATGGAT)所示。该shRNA可用于制备PTPN21基因功能研究产品,所述产品用于抑制牛PTPN21基因的表达。
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公开(公告)号:CN119287045A
公开(公告)日:2025-01-10
申请号:CN202411844432.0
申请日:2024-12-16
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
Inventor: 王秀革 , 黄金明 , 鞠志花 , 姜强 , 王金鹏 , 肖遥 , 赵文军 , 张亚冉 , 高亚平 , 魏晓超 , 杨春红 , 王玉杰 , 刘文浩 , 李彦芹 , 王玲玲 , 高运东
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种筛选牛睾丸不同细胞关键功能蛋白的方法及应用,所述方法基于单细胞RNA测序技术,对牛睾丸细胞中五种不同的生殖细胞类型和八种体细胞类型进行了详细区分,并提供了睾丸细胞类型特有的基因标记即关键功能蛋白基因,通过这些蛋白的表达情况,可以快速准确地鉴别出细胞类型,另外这些蛋白也可以帮助我们开发有针对性的干预措施以提高牲畜的生育能力。
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公开(公告)号:CN118956869A
公开(公告)日:2024-11-15
申请号:CN202411079682.X
申请日:2024-08-07
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC: C12N15/113 , C12N5/10 , C12N15/85 , C12N15/64 , C12N15/12
Abstract: 本发明提供了一种靶向敲除牛乳腺上皮细胞TARDBP基因的sgRNA及其构建的细胞株。该sgRNA包括sgRNA1、sgRNA2,sgRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2所示。本发明的sgRNA能够精确指导Cas9蛋白靶向切割牛乳腺上皮细胞TARDBP基因,采用该sgRNA构建获得的表达载体细胞转化率高,极大提高了敲除牛乳腺上皮细胞TARDBP基因的成功率,获得TARDBP基因敲除乳腺上皮细胞系。为便于研究TARDBP基因在奶牛的乳脂分泌和产奶方面的功能及其机制供了细胞模型,为奶牛生物育种奠定了基础。
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公开(公告)号:CN113416789B
公开(公告)日:2022-06-03
申请号:CN202110851539.8
申请日:2021-07-27
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于奶牛酮病抗性育种技术领域,涉及与奶牛血液β‑羟丁酸浓度相关的分子标记及应用,所述分子标记包括位于UBA6基因上的SNP位点g.66266G>T。本发明提供了与奶牛血液β‑羟丁酸浓度相关的分子标记及应用,提供了UBA6基因中与奶牛血液β‑羟丁酸浓度相关的SNP位点及其加性遗传效应,具有良好的实际应用价值。
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公开(公告)号:CN118773327B
公开(公告)日:2025-04-18
申请号:CN202410866212.1
申请日:2024-07-01
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , G16B20/20 , C12N15/11
Abstract: 本发明提出了一种与奶牛体细胞数相关的SNP及其应用,属于生物化学遗传育种技术领域。本发明中鉴定获得一种与奶牛体细胞数性状相关的SNP(chr6:g.88494442T>C),分析其基因型CC为优势基因型。通过选择优势基因型个体留种,可以提高SLC4A4优势基因型在奶牛群体中的频率,从而优化奶牛群体的体细胞数,提高奶牛的乳房健康,降低乳腺炎发生概率,增加经济效益。本发明为改善奶牛乳腺炎抗性遗传改良提供了一种新的方法。
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公开(公告)号:CN117070642B
公开(公告)日:2025-04-15
申请号:CN202311160631.5
申请日:2023-09-08
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于奶牛育种标记物技术领域,具体涉及与奶牛生产寿命相关的SNP分子标记及其应用。所述分子标记来自NDUFA9基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述序列的第304bp处为突变位点,碱基为C或A。所述突变位点的碱基为A,即chr5:g.105870613C>A时,表现为长生产寿命的性状。本发明鉴别了1个SNP位点,通过分子生物学相关技术检测个体奶牛NDUFA9基因在此位点的基因型,并且通过和奶牛生产寿命性状的估计育种值的关联分析,选择有利的基因型个体留种,可以提高NDUFA9基因长生产寿命基因型在奶牛群体中的频率,从而提高奶牛群体的使用年限,降低养殖成本,增加牧场的经济效益。本发明为奶牛的生产寿命遗传改良提供了一种新的方法。
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公开(公告)号:CN118956869B
公开(公告)日:2025-03-18
申请号:CN202411079682.X
申请日:2024-08-07
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC: C12N15/113 , C12N5/10 , C12N15/85 , C12N15/64 , C12N15/12
Abstract: 本发明提供了一种靶向敲除牛乳腺上皮细胞TARDBP基因的sgRNA及其构建的细胞株。该sgRNA包括sgRNA1、sgRNA2,sgRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2所示。本发明的sgRNA能够精确指导Cas9蛋白靶向切割牛乳腺上皮细胞TARDBP基因,采用该sgRNA构建获得的表达载体细胞转化率高,极大提高了敲除牛乳腺上皮细胞TARDBP基因的成功率,获得TARDBP基因敲除乳腺上皮细胞系。为便于研究TARDBP基因在奶牛的乳脂分泌和产奶方面的功能及其机制供了细胞模型,为奶牛生物育种奠定了基础。
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公开(公告)号:CN118048464A
公开(公告)日:2024-05-17
申请号:CN202410249248.5
申请日:2024-03-05
Applicant: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC: C12Q1/6888 , G01N33/68 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于动物分子育种技术领域,具体涉及一种牛精液品质相关基因及其分子标记和应用。具体的,本发明通过基因敲除小鼠模型明确了Cfap58基因在雄性繁殖以及精子发生中的作用机制,并在CFAP58基因启动子区域发现了两个SNPs和一个indel与公牛精液品质显著关联,可作为评价公牛精液品质的分子标记,从而可用于高繁殖力公牛的筛选育种,因此具有良好的实际应用之价值。
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